Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,432,031 | G→A | 100% | intergenic (‑38/‑168) | msrA ← / → tamA | methionine sulfoxide reductase A/translocation and assembly module for autotransporter export, outer membrane subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,432,031 | 0 | G | A | 96.9% | 624.1 / 8.0 | 192 | intergenic (‑38/‑168) | msrA/tamA | methionine sulfoxide reductase A/translocation and assembly module for autotransporter export, outer membrane subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/6); new base A (82/104); total (82/110) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.88e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
CATTGAGTGACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGA > CP009273/4431886‑4432175 | cATTGAGTGACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGAtt > 1:2324035/1‑148 (MQ=255) gTGACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACa < 1:335901/148‑1 (MQ=255) aCCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAaga < 2:2193878/148‑1 (MQ=255) aCCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAaga < 2:2066598/148‑1 (MQ=255) ccGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAagag < 1:3032085/148‑1 (MQ=255) ccGTTGACCGCATGCAGCGTAGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAagag < 1:2528785/148‑1 (MQ=255) gTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGc < 1:1319633/148‑1 (MQ=255) ttGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCg < 1:1041610/148‑1 (MQ=255) ttGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCg > 1:3751214/1‑148 (MQ=255) ccGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTAtt < 1:3575976/148‑1 (MQ=255) ccGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTAtt < 2:1386624/148‑1 (MQ=255) ccGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTNTTATCAAGTAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTAtt > 1:1939335/1‑148 (MQ=255) tGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGcac > 1:3197909/1‑148 (MQ=255) aGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGcacaca < 1:3286147/148‑1 (MQ=255) 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gCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAacc > 2:3181095/1‑148 (MQ=255) tACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAaccac < 1:3725296/148‑1 (MQ=255) tACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAaccac < 2:1358718/148‑1 (MQ=255) ggCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTg > 2:505010/1‑148 (MQ=255) gCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGa < 2:3700791/148‑1 (MQ=255) 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ggggTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAgg < 1:1731130/148‑1 (MQ=255) gggTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGt > 2:605703/1‑148 (MQ=255) tgtTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTa < 2:1704209/148‑1 (MQ=255) cGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTa > 2:3548681/1‑148 (MQ=255) tCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTaaa < 1:846714/148‑1 (MQ=255) caggcaggGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAAc < 1:1844162/148‑1 (MQ=255) caggcaggGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAAc < 2:1222285/148‑1 (MQ=255) ggcaggGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACAt < 1:3613033/148‑1 (MQ=255) ggcaggGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACAt < 1:1718304/148‑1 (MQ=255) ggcaggGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACAt < 1:1856819/148‑1 (MQ=255) gcaggGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATa > 1:1660910/1‑148 (MQ=255) gcaggGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATa < 1:3441154/148‑1 (MQ=255) caggGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATaa < 2:834416/148‑1 (MQ=255) gggCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATTTTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGa < 1:2897745/148‑1 (MQ=255) cATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAat < 2:2027331/148‑1 (MQ=255) cggGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTgg < 1:1000523/148‑1 (MQ=255) ggggAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTgggg < 2:2189013/148‑1 (MQ=255) ggggAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTgggg > 1:328740/1‑148 (MQ=255) ggggAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTgggg > 1:3785659/1‑148 (MQ=255) gggAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGt < 1:1078172/148‑1 (MQ=255) gAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGttt > 1:3148789/1‑148 (MQ=255) gAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGttt < 2:1813122/148‑1 (MQ=255) gAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAAAAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGGGAATAGGTCTAAAGTAAAAAATAAGAAATATTTGGGGttt > 1:2029300/1‑148 (MQ=255) aaaCCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTa > 2:109986/1‑148 (MQ=255) aaCCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAg < 2:1948975/148‑1 (MQ=255) 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gATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGc > 2:2066920/1‑148 (MQ=255) gCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCttt > 1:477800/1‑148 (MQ=255) gCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCttt > 1:477619/1‑148 (MQ=255) gCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCttt > 1:2972456/1‑148 (MQ=255) cTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCtttt < 1:2481843/148‑1 (MQ=255) 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tGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGAttt > 1:1182162/1‑148 (MQ=255) ggTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGAtttt > 2:1467271/1‑148 (MQ=255) ggTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGAtttt > 2:2748424/1‑148 (MQ=255) ggTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGAtttt < 2:2282766/148‑1 (MQ=255) tgtCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTg < 1:2823224/148‑1 (MQ=255) 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ctcCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGcc > 2:3376283/1‑148 (MQ=255) ctcCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGcc < 1:1826339/148‑1 (MQ=255) cccGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGt > 2:1834558/1‑148 (MQ=255) gAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTa < 1:3091065/148‑1 (MQ=255) gAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTa > 1:947696/1‑148 (MQ=255) aaTCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACg < 1:3053302/148‑1 (MQ=255) tCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTc < 2:1491629/148‑1 (MQ=255) gggTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAgggg < 1:146695/148‑1 (MQ=255) gTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCa < 1:907428/148‑1 (MQ=255) tAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAgg > 1:22418/1‑148 (MQ=255) aaGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGa < 2:2834142/148‑1 (MQ=255) | CATTGAGTGACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGA > CP009273/4431886‑4432175 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |