Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 486,494 | C→A | 100% | R53S (CGC→AGC) | ybaN → | DUF454 family inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 486,494 | 0 | C | A | 98.7% | 757.5 / 0.6 | 234 | R53S (CGC→AGC) | ybaN | DUF454 family inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base A (121/110); total (122/112) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.08e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
CATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGT > CP009273/486349‑486638 | cATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGc > 1:828412/1‑148 (MQ=255) tttAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCa > 2:3536343/1‑148 (MQ=255) tttAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCa > 2:1820325/1‑148 (MQ=255) tttAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCa > 2:2468253/1‑148 (MQ=255) tcatcaTTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGtt > 2:2793162/1‑148 (MQ=255) tcatcaTTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGtt < 2:3400643/148‑1 (MQ=255) tcatcaTTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGtt > 2:3709564/1‑148 (MQ=255) tcatcaTTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGtt > 1:77904/1‑148 (MQ=255) tcatcaTTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGtt > 2:3070789/1‑148 (MQ=255) tcatcaTTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGtt < 2:1080038/148‑1 (MQ=255) tcatcaTTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGtt > 1:2931098/1‑148 (MQ=255) catcatTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGttt > 1:3320873/1‑148 (MQ=255) catcatTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGttt > 2:3083425/1‑148 (MQ=255) catcatTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGttt > 1:1416746/1‑148 (MQ=255) catcatTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGttt > 1:1315944/1‑148 (MQ=255) catcatTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGttt > 1:976263/1‑148 (MQ=255) atcatTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTg > 1:1967665/1‑148 (MQ=255) catTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGc < 2:38286/148‑1 (MQ=255) atTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCa > 2:2894851/1‑148 (MQ=255) ttGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAg > 2:773367/1‑148 (MQ=255) ggctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCt < 1:3409702/148‑1 (MQ=255) gctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTa > 1:3359542/1‑148 (MQ=255) gctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTa > 1:2638104/1‑148 (MQ=255) gctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTa > 1:951354/1‑148 (MQ=255) gctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTa < 1:1917397/148‑1 (MQ=255) ctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTAt < 1:1228256/148‑1 (MQ=255) ctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTAt < 1:3615008/148‑1 (MQ=255) ggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCt < 1:1184721/148‑1 (MQ=255) tggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACg < 1:3619403/148‑1 (MQ=255) ggcGGTAGTGCTGGTTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGt < 1:2264672/148‑1 (MQ=255) gcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGtt < 2:3413670/148‑1 (MQ=255) cGGTAGTGCTGGGTTCGCTGGGCGTGGTATTAACGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTTCTTTGCCCGTTCTTCCCCGAGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGttt < 1:1471783/148‑1 (MQ=255) cGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGttt < 1:502432/148‑1 (MQ=255) cGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGttt > 2:2351074/1‑148 (MQ=255) gTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCt > 1:2171850/1‑148 (MQ=255) tAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTg > 1:1643772/1‑148 (MQ=255) tGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGaa < 1:2186551/148‑1 (MQ=255) ggTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAAc > 2:1956885/1‑148 (MQ=255) ggTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAAc < 2:3249496/148‑1 (MQ=255) gTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAAca < 2:3126397/148‑1 (MQ=255) tACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAAcat < 2:1603621/148‑1 (MQ=255) tACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAAcat < 1:483076/148‑1 (MQ=255) cGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAAcatca < 1:1418088/148‑1 (MQ=255) gggCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCg > 1:2858425/1‑148 (MQ=255) gggCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCg > 2:659489/1‑148 (MQ=255) gggCGTGGTATTACCGGTATGACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGCTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCg < 1:3537021/148‑1 (MQ=255) ggCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGa > 2:332366/1‑148 (MQ=255) gCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGAt > 1:3813606/1‑148 (MQ=255) tattaccggtattaccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCcgcg > 2:1772459/1‑148 (MQ=255) ggtattaccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTc < 2:608564/148‑1 (MQ=255) tattaccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCaa < 1:3132680/148‑1 (MQ=255) ttaccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAAc > 2:1009662/1‑148 (MQ=255) taccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAAcc > 2:2770232/1‑148 (MQ=255) ccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACcgc < 2:3285765/148‑1 (MQ=255) acgCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGa < 1:1120122/148‑1 (MQ=255) acgCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGa < 1:1119188/148‑1 (MQ=255) ccGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGAttt > 2:601454/1‑148 (MQ=255) ccGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGAttt > 2:1751799/1‑148 (MQ=255) gTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTg > 2:2172011/1‑148 (MQ=255) tttATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGc > 2:1650675/1‑148 (MQ=255) tttATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGc < 2:1219433/148‑1 (MQ=255) ttATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCt > 1:785316/1‑148 (MQ=255) ttATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCt > 1:3507795/1‑148 (MQ=255) aTCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGAGTTTGCGTa > 2:2962222/1‑148 (MQ=255) tCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTAt < 1:259748/148‑1 (MQ=255) tCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTAt > 2:2817799/1‑148 (MQ=255) gctgGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCTCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTg < 1:2804862/148‑1 (MQ=255) gctgGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTg < 1:2105539/148‑1 (MQ=255) ttgcgggCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGAGGCGTCAAACCGCGTGCTATTTTGATTATTTTGCt < 2:45672/146‑1 (MQ=255) cggcCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCAc > 2:1975323/1‑148 (MQ=255) gTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGcc < 1:2468253/148‑1 (MQ=255) tttGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCAttt < 2:862313/148‑1 (MQ=255) ttGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTtc > 2:1161196/1‑148 (MQ=255) tGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGAGTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTtct > 1:3772229/1‑148 (MQ=255) cccGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTctct < 2:940360/148‑1 (MQ=255) cccGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTctct < 2:1551212/148‑1 (MQ=255) cccGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTctct > 2:1481147/1‑148 (MQ=255) cccGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTctct > 2:3382757/1‑148 (MQ=255) ccGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCtg < 2:3652371/148‑1 (MQ=255) ccGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCtg < 2:904458/148‑1 (MQ=255) ccGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCtg < 2:2583044/148‑1 (MQ=255) cGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCtgt > 1:901086/1‑148 (MQ=255) ccccGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTAGt > 1:657629/1‑148 (MQ=255) cccGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTc < 2:2931098/148‑1 (MQ=255) 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tttCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGc > 1:3177301/1‑148 (MQ=255) tttCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGc > 2:3016128/1‑148 (MQ=255) ttCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGcc > 1:447992/1‑148 (MQ=255) ttCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGcc > 2:2872602/1‑148 (MQ=255) ttCACGCCTGGTTGCTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGcc < 1:1840463/148‑1 (MQ=255) 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cTGTACAGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGcatca > 1:950679/1‑148 (MQ=255) | CATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGT > CP009273/486349‑486638 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |