| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,010,999 | C→A | 5.8% | intergenic (+84/‑172) | pqiC → / → rmf | DUF330 family putative lipoprotein/ribosome modulation factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,010,999 | 0 | C | A | 5.8% | 973.3 / 19.9 | 263 | intergenic (+84/‑172) | pqiC/rmf | DUF330 family putative lipoprotein/ribosome modulation factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (136/111); new base A (9/7); total (145/118) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
TGGCCGGTGTCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACAAGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTCCGGTATGTTGCCTGAGGCGGTTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAAAATTTGTTCCTCTTCACATTTTTTGTACAACCGACATGCCCGTGTAGCTCACAAATATGACAGTGGCGTGAATTTTGCGCATTGACGGCAGTTATGATTCGCGGTATTGCTTAACTGTGATTGCACATTTAGTAATCACTGTTTTCTTTTCCACC > CP009273/1010854‑1011144 | ggCCGGTGTCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACAAGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTCCGGTATGTTGCCTGAGGCGGTTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAAAATTTGTTCctct > 2:1531381/1‑148 (MQ=255) ggTGTCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACAAGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTCCGGTATGTTGCCTGAGGCGGTTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAAAATTTGTTCCTCTTcac < 1:3695201/148‑1 (MQ=255) gtgtCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACAAGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTCCGGTATGTTGCCTGAGGCGGTTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAATATTTGTTCCTCTTcaca > 2:1416476/1‑148 (MQ=255) gtgtCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACAAGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTCCGGTATGTTGCCTGAGGCGGTTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAAAATTTGTTCCTCTTcaca > 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TGGCCGGTGTCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACAAGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTCCGGTATGTTGCCTGAGGCGGTTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAAAATTTGTTCCTCTTCACATTTTTTGTACAACCGACATGCCCGTGTAGCTCACAAATATGACAGTGGCGTGAATTTTGCGCATTGACGGCAGTTATGATTCGCGGTATTGCTTAACTGTGATTGCACATTTAGTAATCACTGTTTTCTTTTCCACC > CP009273/1010854‑1011144 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |