Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,181,504 | G→T | 100% | D69Y (GAT→TAT) | pepT → | peptidase T |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,181,504 | 0 | G | T | 97.7% | 736.7 / 5.9 | 233 | D69Y (GAT→TAT) | pepT | peptidase T |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/1); new base T (117/110); total (122/111) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.16e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
AGGGGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCGATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGT > CP009273/1181359‑1181648 | aGGGGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTat < 1:3337753/148‑1 (MQ=255) aGGGGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCATGGCTat < 1:3791003/148‑1 (MQ=255) ggggTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCtata > 1:923795/1‑148 (MQ=255) ggggTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCtata > 1:923072/1‑148 (MQ=255) gggTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTatat < 1:2694349/148‑1 (MQ=255) gggTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTatat > 1:3310818/1‑148 (MQ=255) ggTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATc < 1:2260773/148‑1 (MQ=255) agaCAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCgg > 2:2361942/1‑148 (MQ=255) aCAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCg < 2:2872588/148‑1 (MQ=255) cAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGa < 1:1193356/148‑1 (MQ=255) ttCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTgg > 2:3456331/1‑148 (MQ=255) ttCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTgg < 2:2795741/148‑1 (MQ=255) tCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGc < 2:1254820/148‑1 (MQ=255) cAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCttt < 1:2758069/148‑1 (MQ=255) gCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAt > 1:2419043/1‑148 (MQ=255) cACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAATAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAtt > 2:2783459/1‑148 (MQ=255) cACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAtt > 2:3183399/1‑148 (MQ=255) aCGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAttt < 2:839215/148‑1 (MQ=255) cGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTtc > 1:2191380/1‑148 (MQ=255) gAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTtctc < 1:3277147/148‑1 (MQ=255) aaGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCa < 2:1118457/148‑1 (MQ=255) ggCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCAtg < 1:1460758/148‑1 (MQ=255) cAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTgg < 1:1861144/148‑1 (MQ=255) aTGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGAt > 1:2474097/1‑148 (MQ=255) aTGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGAt > 2:1792000/1‑148 (MQ=255) gTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCa < 2:412793/148‑1 (MQ=255) gTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCGCa < 2:2073441/148‑1 (MQ=255) tCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGc < 1:2352037/148‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCa < 1:940393/148‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATGTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCa < 2:131316/148‑1 (MQ=255) aaaGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCa > 1:3052863/1‑148 (MQ=255) agagCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCaaa > 1:523077/1‑148 (MQ=255) gagCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCaaaa < 1:3535928/148‑1 (MQ=255) agcagcTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCaaaaa > 1:3678272/1‑148 (MQ=255) agcagcTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCaaaaa < 1:1023243/148‑1 (MQ=255) agcagcTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCGATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCaaaaa > 2:1645625/1‑148 (MQ=255) gcTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAAtgtg > 1:2320783/1‑148 (MQ=255) gcTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAAtgtg > 2:3073106/1‑148 (MQ=255) gcTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAAtgtg > 2:2969706/1‑148 (MQ=255) ctctAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGa > 2:1973770/1‑148 (MQ=255) tCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGaa < 1:2903404/148‑1 (MQ=255) tCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGaa < 1:1353754/148‑1 (MQ=255) cGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAAt < 2:1136767/148‑1 (MQ=255) agagATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCg > 1:1220067/1‑148 (MQ=255) agagATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCg > 2:1450301/1‑148 (MQ=255) aTGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCaaa > 1:1104357/1‑148 (MQ=255) aTGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCaaa > 1:1085960/1‑148 (MQ=255) gggCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAAttg < 1:3475389/148‑1 (MQ=255) gggCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAAttg > 1:1488084/1‑148 (MQ=255) gggCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAAttg > 1:3649206/1‑148 (MQ=255) gggCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAAttg > 2:65740/1‑148 (MQ=255) gggCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAAttg > 1:1767630/1‑148 (MQ=255) gggCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAAttg > 2:3033807/1‑148 (MQ=255) ggCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCCAAAATGTGAATCCGCAAAttgt > 1:794460/1‑148 (MQ=255) ttATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGa > 2:1519417/1‑148 (MQ=255) tCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAATTGTGAATCCGCAAATTGTTGaaaa > 2:3117936/1‑148 (MQ=255) tCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGaaaa < 2:3801188/148‑1 (MQ=255) tCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGaaaa < 1:2077682/148‑1 (MQ=255) aTGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTa < 1:157337/148‑1 (MQ=255) tgtgACCTTCAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTAt < 1:3729921/148‑1 (MQ=255) tgtgACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTAt < 1:1840460/148‑1 (MQ=255) tgtgACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTAt > 1:3118759/1‑148 (MQ=255) tgtgACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTAt < 2:1920943/148‑1 (MQ=255) gACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATcgc > 1:1923144/1‑148 (MQ=255) ttAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTg > 1:2144661/1‑148 (MQ=255) ttAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTg > 1:2144468/1‑148 (MQ=255) tAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTgg > 1:2534166/1‑148 (MQ=255) tAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTgg > 2:2910292/1‑148 (MQ=255) gagaAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGata < 1:3179680/148‑1 (MQ=255) gagaAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGata < 1:3629420/148‑1 (MQ=255) gagaAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGata < 2:852375/148‑1 (MQ=255) gggCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTgcg > 1:1812040/1‑148 (MQ=255) gggCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGGGGCGATATTgcg > 1:2011780/1‑148 (MQ=255) ggCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTgcgc < 1:3351561/148‑1 (MQ=255) gCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATCTTGCGCt > 2:2611016/1‑148 (MQ=255) gCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCt < 1:608709/148‑1 (MQ=255) gCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCt > 2:1078772/1‑148 (MQ=255) cTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTggg > 2:3623140/1‑148 (MQ=255) cTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTggg < 2:1500753/148‑1 (MQ=255) cTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTggg > 1:1127263/1‑148 (MQ=255) tttGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGt > 1:3003733/1‑148 (MQ=255) gCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCg > 1:2716484/1‑148 (MQ=255) cGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGa > 2:2004692/1‑148 (MQ=255) gACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGAt < 1:3184984/148‑1 (MQ=255) aCGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGTAAACTATCGCGGTGGCGATATTTCGCTGGGTATCGGCGATg > 1:1732738/1‑148 (MQ=255) aCGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATg > 2:2627814/1‑148 (MQ=255) ttACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCACACCGGATTTCAGCGGCAAAAATGTGAATACGCCAATTGTTGAAAACTAACGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAg > 1:3699618/1‑148 (MQ=255) tACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGt > 2:2239061/1‑148 (MQ=255) tACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGt < 2:3314174/148‑1 (MQ=255) tACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGt < 1:1519417/148‑1 (MQ=255) cGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGtttt < 2:2323352/148‑1 (MQ=255) gCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTAt < 2:527654/148‑1 (MQ=255) aaCGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTAtaaa > 1:761959/1‑145 (MQ=255) aaCGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCAc > 2:2524372/1‑148 (MQ=255) aCGTCCCTGGCTATATCCCGGCGAGTGGGTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCAcc > 1:2407638/1‑148 (MQ=255) tCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATAGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGt > 1:2212025/1‑148 (MQ=255) ccTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTa > 2:576896/1‑148 (MQ=255) ccTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTa < 1:438011/148‑1 (MQ=255) cTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCACAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTAt > 1:2848634/1‑148 (MQ=255) tGGCGATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTGATg > 2:3218661/1‑148 (MQ=255) | AGGGGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCGATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGT > CP009273/1181359‑1181648 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |