| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,261,810 | G→A | 100% | A87A (GCG→GCA) | prmC → | N5‑glutamine methyltransferase, modifies release factors RF‑1 and RF‑2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,261,810 | 0 | G | A | 100.0% | 500.1 / ‑6.7 | 167 | A87A (GCG→GCA) | prmC | N5‑glutamine methyltransferase, modifies release factors RF‑1 and RF‑2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); major base A (75/86); minor base C (2/1); total (79/88) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
TATTCTCGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAA > CP009273/1261663‑1261954 | tATTCTCGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCg < 1:1260331/148‑1 (MQ=255) ttCTCGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAAc < 2:1566186/148‑1 (MQ=255) ttCTCGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAAc < 2:3464876/148‑1 (MQ=255) tctcGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAAcc > 2:2397620/1‑148 (MQ=255) cGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTa < 2:1675102/148‑1 (MQ=255) cGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTa < 1:892264/148‑1 (MQ=255) gCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCTGCAACCTTaa < 2:450720/148‑1 (MQ=255) gCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTaa < 1:3765296/148‑1 (MQ=255) cTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAAtt < 1:2724455/148‑1 (MQ=255) cTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAAtt < 1:2724225/148‑1 (MQ=255) ttGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTcc > 2:2156255/1‑148 (MQ=255) aaCGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCg > 1:2944365/1‑148 (MQ=255) cGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCTGa > 1:2551881/1‑148 (MQ=255) cAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCACCCTTAATTCCGCGCCCGGATa > 2:659691/1‑148 (MQ=255) cAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATa < 2:1526970/148‑1 (MQ=255) cAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATa < 2:1114852/148‑1 (MQ=255) aGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATAc > 2:2895159/1‑148 (MQ=255) tgactgacGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGa < 1:2201199/148‑1 (MQ=255) gactgacGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAg < 2:1952164/148‑1 (MQ=255) 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cGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCtg < 1:2845278/148‑1 (MQ=255) gAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTTTTTAGCCAGCAAACATAATAAAGCGCCCGGATAAGGAGAGTAtgg > 1:1759930/1‑148 (MQ=255) gAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCtgg > 1:467473/1‑148 (MQ=255) cAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTTTTTAGCCAGCAACCATAATTCCGCGCCCGGATAAGGAGTGTCtggtgg > 1:1969432/1‑148 (MQ=255) tGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGc < 1:1731007/148‑1 (MQ=255) gTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCa < 1:3565991/148‑1 (MQ=255) gTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCa < 1:3563140/148‑1 (MQ=255) tCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAg < 1:331836/148‑1 (MQ=255) gCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTTTTTGGCCCGCAACCATAAATACGCGCCCCGATACGGAGTGTGTGGTGGTGCAGGCa > 1:341788/1‑148 (MQ=255) cAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCAc > 2:1901241/1‑148 (MQ=255) aCTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTg < 1:2664583/148‑1 (MQ=255) aCTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTg > 2:736006/1‑148 (MQ=255) aCTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTACGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTg > 1:192090/1‑148 (MQ=255) tGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGgcg > 2:3210758/1‑148 (MQ=255) tGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGgcg > 2:3102281/1‑148 (MQ=255) 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cTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTg > 1:2000050/1‑148 (MQ=255) cacGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGaaca > 1:3102007/1‑148 (MQ=255) tcgtcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCt < 2:421497/148‑1 (MQ=255) gtcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTg < 1:2005064/148‑1 (MQ=255) gtcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTg < 1:1664086/148‑1 (MQ=255) gtcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTg < 1:1664250/148‑1 (MQ=255) tcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGc < 2:1993548/148‑1 (MQ=255) tcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGc < 2:2682144/148‑1 (MQ=255) cgATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAAGTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGt < 1:1633900/148‑1 (MQ=255) gATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTa > 1:3471768/1‑148 (MQ=255) 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ttCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGAttgcgcttg > 2:2978294/1‑148 (MQ=255) ttCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTAGCCAGCAACCATAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGAttgcgcttg > 1:2159925/1‑148 (MQ=255) tCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTAGCCACCAACCTTAATTACGCGCCCGGCTACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGCACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGAttgcgcttgc > 2:3535877/1‑148 (MQ=255) cTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGAttgcgcttgcg < 2:2060725/148‑1 (MQ=255) tCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTgg < 2:60819/148‑1 (MQ=255) 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tGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTACGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTag > 1:594229/1‑148 (MQ=255) ccGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTagcg < 2:3403076/148‑1 (MQ=255) gTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTagcgag > 2:706087/1‑148 (MQ=255) ttGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGAGTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGccc > 2:1112994/1‑148 (MQ=255) tGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCg > 2:1423524/1‑148 (MQ=255) 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aGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGaa < 2:1906441/148‑1 (MQ=255) | TATTCTCGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAA > CP009273/1261663‑1261954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |