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| * | CP009273 | 1,290,877 | 0 | T | G | 7.1% | 398.4 / 2.3 | 166 | intergenic (‑99/+25) | insZ/adhE | pseudogene, transposase homolog/fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase/iron‑dependent alcohol dehydrogenase/pyruvate‑formate lyase deactivase |
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Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
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cTGATCGGCATTGCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAgg < 1:1455359/148‑1 (MQ=255) gATCGGCATTGCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTa < 1:2818099/148‑1 (MQ=255) tCGGCATTGCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGGAGTAGGTATc > 1:297049/1‑148 (MQ=255) cGGCATTGCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATcc < 1:3481562/148‑1 (MQ=255) tGCCCAGACGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTCGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGa < 2:34458/148‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGAATc < 1:3259688/148‑1 (MQ=255) cAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCACAATCt > 2:1386321/1‑148 (MQ=255) gacggggCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGAATCTGt < 2:2662765/145‑1 (MQ=255) gAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGAATCTGt < 1:1683768/148‑1 (MQ=255) aaGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGAATCTGtt < 2:1128685/148‑1 (MQ=255) aGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGAATCTGttt < 1:2627757/148‑1 (MQ=255) aGGGGCCGTGTATGTTGCCTGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTGTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGAATCTGttt < 2:2098515/148‑1 (MQ=255) ggCCGTGTATTTTTCCAGACAGCGCTAATGATTAAGCGGATTTTTTAGCTTTTTTATAACCTTTATCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTTCAGTTTCACCATCTACATAATCACGACCCTAGTAGGTATACACCACAATCTTTTTAAg > 2:1782919/1‑148 (MQ=255) tttATGTTGCCAGACTGCGCTACTGATTATGCGTATTTTTTCGTTTTTTTCTCAGCTTTAGCGGGAGCTGCTTCTTTCTTCGCTGCATTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGAATCTGTTTCAGCTCgg < 2:1560287/148‑1 (MQ=255) tttATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGAATCTGTTTCAGCTCgg < 2:1560256/148‑1 (MQ=255) ttATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGAATCTGTTTCAGCTCGga > 1:726864/1‑148 (MQ=255) | GCATAAGCGGATGGTCACTGAAATCGAGCAGATCATTGAGAAGTGGCATAAGAAAACGGCTCCCTGTTGTGGAAGCCGTTATAGTGCCTCAGTTTAAGGATCGGTCAACTAATCCTTAACTGATCGGCATTGCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCAGCTTCTTTCTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGAATCTGTTTCAGCTCGGA > CP009273/1290730‑1291024 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |