Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,437,184 | 0 | G | T | 21.8% | 705.0 / 139.0 | 278 | intergenic (‑84/‑124) | ldhA/ydbH | fermentative D‑lactate dehydrogenase, NAD‑dependent/putative membrane‑anchored protein, function unknown |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (113/104); new base T (35/26); total (148/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.72e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
ACTCGTTCACCTGTTGCAGGTACTTCTTGTCGTACTGTTTTGTGCTATAAACGGCGAGTTTCATAAGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAGGCGCAACCTTCAACTGAACGGTTAAACATGCCACAATACCCGTATTGAATGCTTAATTTTTCGCTAAATCAGGATATTAACTACCCATGCTGGGTAAATATAAAGCCG > CP009273/1437037‑1437329 | cGTTCACCTGTTGCAGGTACTTCTTGTCGTACTGTTTTGTGCTATAAACGGCGAGTTTCATAAGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGata < 1:2207334/148‑1 (MQ=255) cGTTCACCTGTTGCAGGTACTTCTTGTCGTACTGTTTTGTGCTATAAACGGCGAGTTTCATAAGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGata < 2:803134/148‑1 (MQ=255) cACCTGTTGCAGGTACTTCTTGTCGTACTGTTTTGTGCTATAAACGGCGAGTTTCATAAGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGATATTGCGATATTGa > 2:3033780/1‑148 (MQ=255) tGTTGAAGTTACTTCTTGTCGTACTTTTTTGTGATATAAACGGCGAGTTTCATAAGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGaaaaa < 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cTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAGGCGCAACCTTCAACTGAACGGTTAAACATGCCACAATACCCGTATTGAATGCTTAATTTTTCGCTAAATCAGGATATTAACTACCCATGCTGGGTAAATATaa > 2:3585169/1‑148 (MQ=255) cTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAGGCGCAACCTTCAACTGAACGGTTAAACATGCCACAATACCCGTATTGAATGCTTAATTTTTCGCTAAATCAGGATATTAACTACCCATGCTGGGTAAATATaa > 1:1249851/1‑148 (MQ=255) cTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAGGCGCAACCTTCAACTGAACGGTTAAACATGCCACAATACCCGTATTGAATGCTTAATTTTTCGCTAAATCAGGATATTAACTACCCATGCTGGGTAAATATaa > 1:2547263/1‑148 (MQ=255) tATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAGGCGCAACCTTCAACTGAACGGTTAAACATGCCACAATACCCGTATTGAATGCTTAATTTTTCGCTAAATCAGGATATTAACTACCCATGCTGGGTAAATATaaa < 2:1658717/148‑1 (MQ=255) aTGGCTATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAGGCGCAACCTTCAACTGAACGGTTAAACATGCCACAATACCCGTATTGAATGCTTAATTTTTCGCTAAATCAGGATATTAACTACCCATGCTGGGTAAATATAAAg > 2:178092/1‑148 (MQ=255) 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gCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAGGCGCAACCTTCAACTGAACGGTTAAACATGCCACAATACCCGTATTGAATGCTTAATTTTTCGCTAAATCAGGATATTAACTACCCATGCTGGGTAAATATAAAGCCg < 1:1224383/148‑1 (MQ=255) | ACTCGTTCACCTGTTGCAGGTACTTCTTGTCGTACTGTTTTGTGCTATAAACGGCGAGTTTCATAAGACTTTCTCCAGTGATGTTGAATCACATTTAAGCTACTAAAAATATTTTACAAAATTTCAAATTTAATTGAAAGCTATGGCGATATTGAAAAATTCATCAACAACTATGCTTAGTGTAGGCGCAACCTTCAACTGAACGGTTAAACATGCCACAATACCCGTATTGAATGCTTAATTTTTCGCTAAATCAGGATATTAACTACCCATGCTGGGTAAATATAAAGCCG > CP009273/1437037‑1437329 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |