| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,617,498 | 0 | G | T | 11.7% | 770.8 / 50.4 | 230 | R204S (CGC→AGC) | dgcZ | diguanylate cyclase, zinc‑sensing |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (99/104); new base T (14/13); total (113/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
CACCTGCTGTCACGGTAATGTTGATATGCCCTTCAGAATGTGTGATGGCATGGTTATCGACTAACTGGCAAATTCTGACACCTGCACGACATGCTTCTTCATCATTAGCCGCTTTGACAATAATGATAAATTCTTCGCCCCCGTAGCGATAAACCGTTTCGTAATCACGCGTCCAACTGGCTAAGTAAGTTGCCAGGGTGCGTAATACTACATCGCCGATTAAATGCCCGTAGGTATCATTAACCAATTTAAATCGGTCAATATCCAACAACATTAAATAAAGATTCAGAGGC > CP009273/1617351‑1617643 | cacCTGCTGTCACGGTAATGTTGATATGCCCTTCAGAATGTGTGATGGCATGGTTATCGACTAACTGGCAAATTCTGACACCTGCACGACATGCTTCTTCATCATTAGCCGCTTTGACAATAATGATAAATTCTTCGCCCCCGTAGCg < 1:663919/148‑1 (MQ=255)cacCTGCTGTCACGGTAATGTTGATATGCCCTTCAGAATGTGTGATGGCATGGTTATCGACTAACTGGCAAATTCTGACACCTGCACGACATGCTTCTTCATCATTAGCCGCTTTGACAATAATGATAAATTCTTCGCCCCCGTAGCg < 2:1688438/148‑1 (MQ=255) acCTGCTGTCACGGTAATGTTGATATGCCCTTCAGAATGTGTGATGGCATGGTTATCGACTAACTGGCAAATTCTGACACCTGCACGACATGCTTCTTCATCATTAGCCGCTTTGACAATAATGATAAATTCTTCGCCCCCGTAGCGa < 2:2808506/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGTCACGGTAATGTTGATATGCCCTTCAGAATGTGTGATGGCATGGTTATCGACTAACTGGCAAATTCTGACACCTGCACGACATGCTTCTTCATCATTAGCCGCTTTGACAATAATGATAAATTCTTCGCCCCCGTAGCGAt > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |