| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,651,166 | C→A | 14.0% | A183A (GCG→GCT) | ynfC ← | UPF0257 family lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,651,166 | 0 | C | A | 14.0% | 765.4 / 67.5 | 243 | A183A (GCG→GCT) | ynfC | UPF0257 family lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (72/137); new base A (12/22); total (84/159) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |