Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,706,839 | 0 | C | T | 16.2% | 847.2 / 126.9 | 303 | intergenic (+424/‑187) | nth/dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (120/134); new base T (20/29); total (140/163) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.37e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 316 total aligned reads displayed.
ACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGATAGTGAACATTACCTGCCGTTTCCCCTCCCACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAACGCGAGAAA > CP009273/1706692‑1706986 | cTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTcc > 2:2992829/1‑148 (MQ=255) tGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTccc > 1:1440863/1‑148 (MQ=255) tATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTTCCGGaa < 2:2517686/148‑1 (MQ=255) 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tttCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGACTGAAAGTGCAAGATAGTGAACATTACCTGCCGTTTCCCCTCCCACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAACGCgag > 2:200912/1‑148 (MQ=255) cccGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGATAGTGAACATTACCTGCCGTTTCCCCTCCCACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAACGCGAGaaa < 1:493869/148‑1 (MQ=255) | ACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGATAGTGAACATTACCTGCCGTTTCCCCTCCCACTATAACAATTGCGCGTATGTTTTTTATACATAACGCGAGAAA > CP009273/1706692‑1706986 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |