| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,713,571 | 0 | G | T | 17.1% | 586.4 / 71.3 | 198 | H97N (CAC→AAC) | anmK | anhydro‑N‑acetylmuramic acid kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (74/90); new base T (9/25); total (83/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.60e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
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tGACAACCGATCGCAACTATATCTCTTGCCTGCAGATTTTGTTCCTTAAGCAAGGCATTGACCGCATCAGCAAAAAGTTGCCCGAGTTGAGTATCAAGCTGTCCAAACTGCGAAAGTGTAAGCTGCTGGCCCTGGCAAATATCCAGTa > 1:1549315/1‑148 (MQ=255) | TGCGCCTTGTCCTCCCAAGGCAATATCGCGACGGCGAAAATCACCGACAACCGTAATTCCGGTGCGTGCCACAATTTGATTGTTATCGCCAATCTGTAAAGTGTGTGGTGCCACGCCCGTCGGTTCATGCCAGACGGTTTGACCGTGACAACCGATCGCAACTATATCTCTTGCCTGCAGATTTTGTTCCTTAAGCAAGGCATTGACCGCATCAGCAAAAAGTTGCCCGAGTTGAGTATCAAGCTGTCCAAACTGCGAAAGTGTAAGCTGCTGGCCCTGGCAAATATCCAGTA > CP009273/1713425‑1713717 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |