Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,004,533 | G→T | 100% | T151T (ACG→ACT) | yedL → | putative acyl transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,004,533 | 0 | G | T | 100.0% | 503.0 / ‑6.7 | 202 | T151T (ACG→ACT) | yedL | putative acyl transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/2); major base T (86/103); minor base A (7/0); total (97/105) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
GATGCCTTCATCGCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACGCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTATTCCAGTG > CP009273/2004388‑2004677 | aTGCCTTCATCGCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTa < 1:1955171/148‑1 (MQ=255) gCCTTCATCGCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTTTCATTTACTCTATg > 1:2534234/1‑148 (MQ=255) gCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAaataa < 1:111615/148‑1 (MQ=255) gCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAaataa < 2:42948/148‑1 (MQ=255) gCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAaataa < 1:1590005/148‑1 (MQ=255) tGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGa < 2:2473056/148‑1 (MQ=255) tGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGa < 2:2473395/148‑1 (MQ=255) gAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGaa < 2:927491/148‑1 (MQ=255) aGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCa < 1:259578/148‑1 (MQ=255) aGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCa < 1:186407/148‑1 (MQ=255) gAAACGGGTACACAGGCTGGATGTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCAt < 2:3300834/148‑1 (MQ=255) aaaCGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATg > 2:1239167/1‑148 (MQ=255) aaaCGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATg > 2:3006717/1‑148 (MQ=255) aCGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTTTAATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTTCCATGAg > 1:1246955/1‑148 (MQ=255) cGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGc < 2:2409696/148‑1 (MQ=255) gggTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGcc < 2:3096896/148‑1 (MQ=255) gggTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGcc < 2:1929564/148‑1 (MQ=255) ggTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTTTCATTGACTCTATTCG‑AAAATAATGAATTTCCATGAGCCa > 1:2829661/1‑148 (MQ=255) gTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTTTAATTTACTAAATTCG‑AAAATAATTAATTTGCATGATcccg > 1:1881281/1‑146 (MQ=255) 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ggATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTTTCTCTATTCG‑AAAATAATTAATTTACATGAGCCAGACGCAGCACAt > 1:3149950/1‑148 (MQ=255) ggATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTTTCTATATTCG‑AAAATAAATAATTTGCATGAGCCAGACGCAGcacaa > 1:3151010/1‑147 (MQ=255) aTTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGACTCTATGCG‑AAAAAAAAGAATTTCCATGAGCCAGACGCCCCACAtta > 1:2548527/1‑147 (MQ=255) tttACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTTTCTATATGCG‑AAAATAATGAATTTCCCAGAGCCAGACGCAGCACAATCt > 2:326181/1‑148 (MQ=255) ttACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTTTAAATGTGTCTATTCG‑AAAATAAATAATTTGCAAGAGCCAGACGCAGCCCAtaaat > 1:3239713/1‑144 (MQ=255) ttACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGAATCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCtt > 2:2693176/1‑148 (MQ=255) cGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGAATCTATGCG‑AAAAAAATGAATTGCCCTGGTCCAGACGCAGCCCATTATTGCa > 1:2859217/1‑148 (MQ=255) ggCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCAt < 2:3471944/148‑1 (MQ=255) tGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTTACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACAATCTTGCAATCGa > 2:3716636/1‑148 (MQ=255) tGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGACTCTATGCG‑AAAAAAATGAATTGCCAAGAGCCAGACGCAGCACAATATTGCATTCGa > 2:3711290/1‑148 (MQ=255) ccATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACg < 2:594983/148‑1 (MQ=255) cATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCGATGCG‑AAAAAAATGAATTTGCATGTTCCAGTCGCCGCACATTCATGCAATAGACGt > 2:2245720/1‑148 (MQ=255) aTCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTTACTCTATGCG‑AAAATAATTAATTGCCAAGAGCCACACGCAGCACATTCTTGCAATAGACGtg > 2:896745/1‑148 (MQ=255) aTCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTTCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCCTTCGACGtg > 2:1898863/1‑148 (MQ=255) aTCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGtg < 2:480487/148‑1 (MQ=255) aTCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCAATGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGATCCAGACGCAGCACATTCTTTCATTAGACGtg > 2:1898349/1‑148 (MQ=255) aCTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAAATGACTCTATGCG‑AAAATAATGAAATTGCATGATCCACACGCAGCACAATCTTGCAATCGACGtgctgc > 2:1056339/1‑148 (MQ=255) ttATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTTACTCTATGCG‑CAAAAAATTAAATGGCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGcc > 2:1634282/1‑148 (MQ=255) ttATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATTCG‑AAAATAATGAAATTCCATGAGCCAGACGCAGCACAATATTGCATTAGACGTGCTGCGcc > 2:1474400/1‑148 (MQ=255) ttATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATGGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGcc < 2:2937745/148‑1 (MQ=255) ttATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTTTCTCTATTCG‑AAAATAATTAAATTCCAAGAGCCAGACGCCCCACAATCTTGCATTAGACCTGGTGCGcc > 1:2472962/1‑148 (MQ=255) tATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCt < 2:1478575/148‑1 (MQ=255) aTTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCtt < 1:3289344/148‑1 (MQ=255) tttGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGAATCTATGCG‑AAAATAATGAATTTCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTTCATTCGACGTGCTGCGCCttt > 2:627528/1‑148 (MQ=255) tGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCtttat < 1:2991750/148‑1 (MQ=255) tGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCtttat < 1:1725476/148‑1 (MQ=255) aaGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATTATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCtttattt < 2:2014606/148‑1 (MQ=255) aaGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAAATTTATATATGCGAAAAAAAATAATTTGCCA‑GAGCCCCACGCACCCCAAAATTGCATTCGAAGTTCTGCGCCggtattt > 2:981021/1‑148 (MQ=255) aaGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGAGTTTTTTGAATTTCTCTATTCG‑CAAAAAATTAATTGGCAAGAGCCCCACGCAGCACAATATTTCATTAGACGTGCTGCGGCgttattt > 1:202380/1‑148 (MQ=255) aGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCtttattta < 1:1062334/148‑1 (MQ=255) aGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCtttattta < 1:3617576/148‑1 (MQ=255) aTGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCa < 2:1580594/148‑1 (MQ=255) tGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGACTCTATTCG‑GAAATAATGTATTTGCCTGAGCCAGAAGCACCACAATATTTCATTAGACCTGGGGCGGCGTTATTTATCAc > 1:3782529/1‑148 (MQ=255) ggTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCAcc < 1:823529/148‑1 (MQ=255) tCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTTACTCAATGCG‑CAAATAATGAATTTCCAATATCCAGACGCCTCACATTATTGCATTCGAAGTGCTGCGCCTTTATTTATCAAcagca > 2:382249/1‑148 (MQ=255) 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aCCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGt < 2:151821/148‑1 (MQ=255) aCCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGt < 1:1479697/148‑1 (MQ=255) ccGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGTGCCAGACCCAGCACATTCTTGCCTTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATAACCAGCAGGAAACGCCTTGTc > 2:446224/1‑148 (MQ=255) cGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTcc < 1:991735/148‑1 (MQ=255) tttGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCAt > 2:205903/1‑148 (MQ=255) 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aCTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCca < 2:805421/148‑1 (MQ=255) cTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTTACTCTATGCG‑AAAATAATGAAATGCCATGAGCCAGACGCAGCACAATCTTTCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATAACCACCAGGAAAAGCCTTGTCCATAGACGCCCCGTCcac > 2:749889/1‑148 (MQ=255) tCCACACAGTCGATTTTTATAAATGACTCTATGCG‑AAAAAAATGAAATTCCATGAGCCAGACGCAGCACAATATTGCATTCGACGTGCTGCGCCGTTATTTATCAACACCAGGAAACGCCGTGTCCATAGACGCCCCGACcacaatcg > 2:1719661/1‑144 (MQ=255) tCCACACAGTCGATGTTTATCATTGACTCTATTCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAAAGCCTTGTCCATATACGCCCCATCCACATgcg > 2:717807/1‑148 (MQ=255) ccACACAGTCGATTTTTATAAATTAAACAATTCC‑AAAAAAAAGAAATGCCAAGAGCCCGACCCCGCACAATCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTGTATTTTTAACCACCAGCAAACCCCTAGTACAAATAAGCCCCAGACACAAgcgc > 2:676005/1‑148 (MQ=255) 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ttATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCATTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTa < 1:683055/148‑1 (MQ=255) tATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTAt < 2:1232470/148‑1 (MQ=255) aTCTTTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTAtt < 1:3007866/148‑1 (MQ=255) aTCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTAtt < 1:1039000/148‑1 (MQ=255) tCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTATTc < 1:1238938/148‑1 (MQ=255) 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gACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTATTCCAGTg < 2:3150073/148‑1 (MQ=255) | GATGCCTTCATCGCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACGCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTATTCCAGTG > CP009273/2004388‑2004677 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |