| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 2,222,970 | T→A | 100% | N299Y (AAT→TAT) | dusC ← | tRNA‑dihydrouridine synthase C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,222,970 | 0 | T | A | 100.0% | 649.2 / NA | 194 | N299Y (AAT→TAT) | dusC | tRNA‑dihydrouridine synthase C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (115/79); total (115/79) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
GGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATTATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGACGGGTATATTTTTGCAGCAAAGC > CP009273/2222825‑2223114 | cGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAac < 1:1213222/148‑1 (MQ=255) cGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAac > 1:801553/1‑148 (MQ=255) cGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAac > 2:3659418/1‑148 (MQ=255) cGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAac > 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aataatTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGACGGGTATATTTTTGCagcaaagc > 1:2676427/1‑148 (MQ=255) | GGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATTATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGACGGGTATATTTTTGCAGCAAAGC > CP009273/2222825‑2223114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |