| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 2,231,230 | C→A | 5.5% | M1M (ATG→ATT) † | mglC ← | methyl‑galactoside transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP009273 | 2,231,230 | 0 | C | A | 5.5% | 919.8 / 17.4 | 237 | M1M (ATG→ATT) † | mglC | methyl‑galactoside transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (124/100); new base A (8/5); total (132/105) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |