Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,376,959 | C→T | 100% | N256N (AAC→AAT) | elaD → | protease, capable of cleaving an AMC‑ubiquitin model substrate |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,376,959 | 0 | C | T | 98.7% | 1013.7 / 1.8 | 314 | N256N (AAC→AAT) | elaD | protease, capable of cleaving an AMC‑ubiquitin model substrate |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base T (167/143); total (169/145) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.19e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 320 total aligned reads displayed.
ATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAACTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACATGCCGAT > CP009273/2376814‑2377103 | aTGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTc > 1:382423/1‑148 (MQ=255) aTGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTc < 1:1339576/148‑1 (MQ=255) tGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATattcaattca < 1:2429579/148‑1 (MQ=255) gAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCAt < 1:3097085/148‑1 (MQ=255) aaaaTATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCAtt > 1:237368/1‑148 (MQ=255) aaaTATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTg < 2:2862068/148‑1 (MQ=255) atatTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCg < 1:71224/148‑1 (MQ=255) tatTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGt > 2:571755/1‑148 (MQ=255) tatTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGt > 2:2490464/1‑148 (MQ=255) tatTAAGAGCGATCCAACATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGt > 2:1827535/1‑148 (MQ=255) tAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCa > 1:2185160/1‑148 (MQ=255) gagCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTa > 2:3555585/1‑148 (MQ=255) agCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCAGATTCAATTCATTGCGTGCACTAg > 2:3299402/1‑148 (MQ=255) gATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCt > 1:1081463/1‑148 (MQ=255) aTCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTa > 2:1644829/1‑148 (MQ=255) tcatGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATa < 1:335929/148‑1 (MQ=255) gCCGAATGAAGTCCAGTTAGTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGaa < 2:1148096/148‑1 (MQ=255) aaTGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAAtt > 2:1389559/1‑148 (MQ=255) aTGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTc < 2:3036528/148‑1 (MQ=255) tGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCa < 1:116986/148‑1 (MQ=255) gTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTa < 2:4950/148‑1 (MQ=255) gTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTa > 2:369116/1‑148 (MQ=255) tATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCgtgt < 1:1616119/148‑1 (MQ=255) ttCCACATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGATACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCa < 2:3763714/148‑1 (MQ=255) cccATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTa < 2:1186239/148‑1 (MQ=255) ccATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTaa > 1:1281215/1‑148 (MQ=255) cATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAAt < 2:2882429/148‑1 (MQ=255) tAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACACATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAg < 2:932243/148‑1 (MQ=255) tAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAg > 2:2161849/1‑148 (MQ=255) aaTACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACATAAAATAGTATATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGtt < 2:3365225/148‑1 (MQ=255) ggCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAAtt < 2:2227888/148‑1 (MQ=255) ggCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAAtt < 2:237368/148‑1 (MQ=255) gACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGa < 2:1544162/148‑1 (MQ=255) gACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGa > 1:2598558/1‑148 (MQ=255) acacTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGaa < 1:3651179/148‑1 (MQ=255) acTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACt < 2:593977/148‑1 (MQ=255) cTGTATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTc < 2:3331306/148‑1 (MQ=255) cTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTc < 2:2593569/148‑1 (MQ=255) cTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTc > 1:461509/1‑148 (MQ=255) tGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCa < 2:53205/148‑1 (MQ=255) tGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCa < 2:1988952/148‑1 (MQ=255) ggATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCAt < 1:2139029/148‑1 (MQ=255) ttAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGgag > 2:80979/1‑148 (MQ=255) tAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAACTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGgaga > 1:935974/1‑148 (MQ=255) aGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGaa < 2:1749562/148‑1 (MQ=255) tCGATACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGt < 2:2540850/148‑1 (MQ=255) gCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCg > 2:2258254/1‑148 (MQ=255) cTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGa < 2:1081480/148‑1 (MQ=255) cTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGa < 2:1281215/148‑1 (MQ=255) aCAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGaat > 2:381436/1‑148 (MQ=255) aCAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGaat > 2:2089951/1‑148 (MQ=255) aaaaTAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGaataata > 1:1207993/1‑148 (MQ=255) aaaTAGTAAATATAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGaataataa < 2:3626988/148‑1 (MQ=255) aaTAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGaataataat < 2:639128/148‑1 (MQ=255) aaTAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGaataataat > 1:3001152/1‑148 (MQ=255) aTAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAataataata < 2:1048458/148‑1 (MQ=255) aTAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAataataata < 2:3157851/148‑1 (MQ=255) aGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAAtata > 2:1685325/1‑148 (MQ=255) aGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAAtata > 1:2028756/1‑148 (MQ=255) aaataaaAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATaaaa > 1:1964066/1‑148 (MQ=255) aataaaAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAg > 1:1920644/1‑148 (MQ=255) aataaaAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAg > 1:3584840/1‑148 (MQ=255) taaaAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGtt > 2:691036/1‑148 (MQ=255) taaaAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGtt > 2:611582/1‑148 (MQ=255) aaaaaaTAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCAt > 1:1572309/1‑148 (MQ=255) aaaaaaTAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCAt < 2:3444544/148‑1 (MQ=255) aaaaaTAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCAtt > 2:2501676/1‑148 (MQ=255) aaaTAATAAACTACAAATTAAATGCGTCATCTTCAATTCATTGCGTGCACTCGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCTTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGTAGAAATGTCTAATAATAATATAAAAGTTCATTTa < 2:3432339/148‑1 (MQ=255) aataatAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTaa > 2:3668331/1‑148 (MQ=255) aataatAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTAATTTaa > 2:2052666/1‑148 (MQ=255) ataataAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTaaa > 2:2596707/1‑148 (MQ=255) taataaACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAAt > 1:1028797/1‑148 (MQ=255) ataaACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGa > 1:1468745/1‑148 (MQ=255) taaACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACGAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGaa < 1:3254762/148‑1 (MQ=255) aaaCTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAAc < 1:1770177/148‑1 (MQ=255) aaaCTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAAc < 1:1769987/148‑1 (MQ=255) aaCTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAAcc > 1:2320680/1‑148 (MQ=255) aaCTACAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAAcc < 2:2185160/148‑1 (MQ=255) aaCTACAAATAAAATGCGTCATATTCAACTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAAcc < 1:1645961/148‑1 (MQ=255) aCAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCagag < 1:3308769/148‑1 (MQ=255) cAAATAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAgaga > 1:1807333/1‑148 (MQ=255) aTAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGataa < 2:1907087/148‑1 (MQ=255) aTAAAATGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGataa > 1:2242587/1‑148 (MQ=255) aaaaTGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGataata < 2:1479141/148‑1 (MQ=255) aaaaTGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGataata < 2:241406/148‑1 (MQ=255) aaaaTGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGataata > 2:1428835/1‑148 (MQ=255) aaaTGCGTCATATTAAATTCATTTCGTGCACTAGTCTATTATAAATAAAATTCACTTAAGAGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAatat < 2:2782485/148‑1 (MQ=255) aTGCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCAGTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATAttt < 1:657589/148‑1 (MQ=255) gCGTCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATAttttt < 2:2777482/148‑1 (MQ=255) tCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACa < 2:2280941/148‑1 (MQ=255) tCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACa < 1:1416199/148‑1 (MQ=255) tCATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACa > 1:421492/1‑148 (MQ=255) cATATTCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACAt > 1:538636/1‑148 (MQ=255) attcaattcaTTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACATGcc > 1:1727515/1‑148 (MQ=255) attcaattcaTTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACATGcc > 2:3078301/1‑148 (MQ=255) ttCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACATGCCg > 1:3211649/1‑148 (MQ=255) tCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACATGCCGa > 2:2488000/1‑148 (MQ=255) tCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACATGCCGa > 1:2027959/1‑148 (MQ=255) tCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACATGCCGa > 1:2493596/1‑148 (MQ=255) tCAATTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACATGCCGa > 1:2890233/1‑148 (MQ=255) | ATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAACTCATTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATTCACTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGTCGAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACATGCCGAT > CP009273/2376814‑2377103 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |