Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,497,946 | G→T | 100% | L7I (CTC→ATC) | fryA ← | putative PTS enzyme, Hpr component/enzyme I component/enzyme IIA component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,497,946 | 0 | G | T | 97.7% | 526.1 / 3.6 | 172 | L7I (CTC→ATC) | fryA | putative PTS enzyme, Hpr component/enzyme I component/enzyme IIA component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/4); new base T (76/92); total (76/96) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.32e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
GTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATCTGCAAAATGTCGCGGCAATCGGCAAT > CP009273/2497801‑2498090 | gtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATaa < 2:1143277/148‑1 (MQ=255) gccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAAt < 2:2462482/148‑1 (MQ=255) gccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAAt < 1:2936919/148‑1 (MQ=255) aTCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGaa > 1:2595246/1‑148 (MQ=255) aTCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGaa > 2:3433404/1‑148 (MQ=255) aTCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGaa < 1:354319/148‑1 (MQ=255) tCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAAt < 2:3287469/148‑1 (MQ=255) tCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAAt < 2:1642814/148‑1 (MQ=255) tCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAAt > 1:3304404/1‑148 (MQ=255) aGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCg > 1:881263/1‑148 (MQ=255) gcgcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGt < 1:1963838/148‑1 (MQ=255) cgcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGtt < 1:1396617/148‑1 (MQ=255) cgcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGtt > 1:3103582/1‑148 (MQ=255) cgcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGtt > 1:3743380/1‑148 (MQ=255) 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tttCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCt > 1:1090428/1‑148 (MQ=255) tttCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTCAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCt < 2:3334503/148‑1 (MQ=255) ttCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTc < 1:1609513/148‑1 (MQ=255) cATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCggg < 2:2822942/148‑1 (MQ=255) tCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGtt > 2:2923543/1‑148 (MQ=255) tGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTaa < 2:2991852/148‑1 (MQ=255) tGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTaa < 2:790958/148‑1 (MQ=255) gCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAACAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAAt < 2:590200/148‑1 (MQ=255) gCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAAt < 2:590241/148‑1 (MQ=255) ccTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATc > 1:2987050/1‑148 (MQ=255) cTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCa < 1:2340801/148‑1 (MQ=255) tttGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAg > 2:2793906/1‑148 (MQ=255) ttGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAgg > 1:3232665/1‑148 (MQ=255) ttGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAgg < 2:1315265/148‑1 (MQ=255) ttGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAgg > 1:3233848/1‑148 (MQ=255) cTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGatcat < 1:2015775/148‑1 (MQ=255) tGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGatcatc < 1:416182/148‑1 (MQ=255) tGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAAt < 2:3792493/148‑1 (MQ=255) taataaAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGt > 1:2106779/1‑148 (MQ=255) taataaAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGt < 1:2314767/148‑1 (MQ=255) taataaAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGt < 1:116442/148‑1 (MQ=255) aaaaGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGt > 1:2940540/1‑148 (MQ=255) aaaGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGtt < 2:1798632/148‑1 (MQ=255) aaaGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGtt < 2:1798644/148‑1 (MQ=255) aaGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTg > 1:772398/1‑148 (MQ=255) aaGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTg > 1:1564641/1‑148 (MQ=255) aGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGa > 1:1849710/1‑148 (MQ=255) aGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGa > 1:2512434/1‑148 (MQ=255) gTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGaa > 1:2732502/1‑148 (MQ=255) ttCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGGAATCCGTCAGTTGAACAAcc > 2:3230063/1‑148 (MQ=255) ttCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAAcc < 2:128429/148‑1 (MQ=255) cGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGt < 1:710783/148‑1 (MQ=255) cTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGtct < 1:1746433/148‑1 (MQ=255) cTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGtct < 2:3677394/148‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGt > 2:3800705/1‑148 (MQ=255) cTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTa > 1:181466/1‑148 (MQ=255) cTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTa < 2:1025657/148‑1 (MQ=255) cTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGAc > 2:890348/1‑148 (MQ=255) cTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGAc < 2:578513/148‑1 (MQ=255) cACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGtt > 1:721961/1‑148 (MQ=255) cTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGa < 1:239308/148‑1 (MQ=255) cTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGa < 1:3379517/148‑1 (MQ=255) ttCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATa > 1:1152719/1‑148 (MQ=255) ttCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATa > 2:3080645/1‑148 (MQ=255) tCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATaa > 2:2185137/1‑148 (MQ=255) cTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAg > 2:1980613/1‑148 (MQ=255) cTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAg < 2:3812012/148‑1 (MQ=255) cTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAg < 2:1573886/148‑1 (MQ=255) cTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGCAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAg < 2:1913414/148‑1 (MQ=255) ttAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAggg < 1:1872050/148‑1 (MQ=255) tAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGc < 2:474625/148‑1 (MQ=255) aaGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCa > 1:3328316/1‑148 (MQ=255) aGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAg < 1:2764183/148‑1 (MQ=255) tCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATa > 1:1651184/1‑148 (MQ=255) tCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATa > 1:1651198/1‑148 (MQ=255) 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ccGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTtg > 2:1464941/1‑148 (MQ=255) gACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTtgctg > 2:2065448/1‑148 (MQ=255) gAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCAt < 1:2178533/148‑1 (MQ=255) gAGCATGTAGACCGTGAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCAt < 2:1739262/148‑1 (MQ=255) aGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATc > 2:589615/1‑148 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |