| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,524,056 | C→A | 100% | A179A (GCG→GCT) | zipA ← | FtsZ stabilizer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,524,056 | 0 | C | A | 97.7% | 556.6 / 3.8 | 177 | A179A (GCG→GCT) | zipA | FtsZ stabilizer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base A (93/80); total (95/82) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
TATTCATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCCGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCGG > CP009273/2523911‑2524199 | tatTCATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGc > 2:1344867/1‑148 (MQ=255) tCATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAc > 1:260490/1‑148 (MQ=255) cATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAca > 1:39369/1‑148 (MQ=255) tatCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcagg > 2:3421943/1‑148 (MQ=255) tatCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcagg < 2:331160/148‑1 (MQ=255) atCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTAGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcaggc > 1:2243090/1‑148 (MQ=255) tCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcaggct > 2:3771861/1‑148 (MQ=255) cAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcaggctcagg < 2:1402635/148‑1 (MQ=255) aaaTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCtg > 2:2044799/1‑148 (MQ=255) gAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTgtggt > 1:801516/1‑148 (MQ=255) aaGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTgtggtg < 2:2655668/148‑1 (MQ=255) aaGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTgtggtg < 2:470918/148‑1 (MQ=255) aGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGc < 2:3791443/148‑1 (MQ=255) gCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGcc > 1:2702136/1‑148 (MQ=255) cccGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGATCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCg > 2:769840/1‑148 (MQ=255) cccGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGATCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCg > 2:768898/1‑148 (MQ=255) cTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGGGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTAc > 2:2206994/1‑148 (MQ=255) tgttgAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACgg > 1:3265494/1‑148 (MQ=255) gttgAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACggg < 2:631061/148‑1 (MQ=255) ttgAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGt > 2:1739126/1‑148 (MQ=255) tGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGc > 2:2726769/1‑148 (MQ=255) tGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGc > 2:3349587/1‑148 (MQ=255) tGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGc > 2:3408551/1‑148 (MQ=255) tGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAgg < 1:1842962/148‑1 (MQ=255) gTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGc > 2:2606186/1‑148 (MQ=255) ttAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCt < 1:1835961/148‑1 (MQ=255) gaagCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGTCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGaa > 1:2047316/1‑148 (MQ=255) gaagCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGaa < 1:1711879/148‑1 (MQ=255) aagCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGaaa > 2:3156599/1‑148 (MQ=255) aagCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGaaa > 2:2831334/1‑148 (MQ=255) gCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGc > 1:3258112/1‑148 (MQ=255) gCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGc < 1:1901107/148‑1 (MQ=255) cAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGcc > 1:1451829/1‑148 (MQ=255) ttCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgt > 1:3173193/1‑148 (MQ=255) ttCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgt < 1:3272141/148‑1 (MQ=255) ttCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgt > 2:1139953/1‑148 (MQ=255) ttCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgt > 2:1139915/1‑148 (MQ=255) ttCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgt > 1:916801/1‑148 (MQ=255) ttCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgt > 1:1270415/1‑148 (MQ=255) 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tACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGc < 2:2575046/148‑1 (MQ=255) tACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGc > 1:3533321/1‑148 (MQ=255) cGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGa < 1:97683/148‑1 (MQ=255) tGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAAt > 1:2406542/1‑148 (MQ=255) tGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAAt > 1:2665923/1‑148 (MQ=255) 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aTGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTg > 2:3668755/1‑148 (MQ=255) aTGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTg < 1:3788160/148‑1 (MQ=255) tGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTgg > 1:2260928/1‑148 (MQ=255) aTAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGgcg < 1:1433581/148‑1 (MQ=255) aTAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGgcg > 1:562890/1‑148 (MQ=255) tAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGgcgc > 1:2071452/1‑148 (MQ=255) tAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGgcgc > 1:174542/1‑148 (MQ=255) actCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTGATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGcgcg < 2:2478100/146‑1 (MQ=255) aaTCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGcgcg > 2:3027729/1‑148 (MQ=255) aTCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGa < 1:592861/148‑1 (MQ=255) tCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGAc > 1:2152087/1‑148 (MQ=255) tCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGAc > 2:642321/1‑148 (MQ=255) cACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCCGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGAcc < 1:1651243/148‑1 (MQ=255) cACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGAcc < 2:801516/148‑1 (MQ=255) cACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGAcc < 2:1561878/148‑1 (MQ=255) cACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGGTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGAcc < 2:1562555/148‑1 (MQ=255) ccGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCtg < 2:239535/148‑1 (MQ=255) ccGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCtg < 1:3238316/148‑1 (MQ=255) cGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCtgt < 2:2418357/148‑1 (MQ=255) cttcttTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCCGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTgg > 1:1734265/1‑148 (MQ=255) tcttTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCg > 1:1008182/1‑148 (MQ=255) tttGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGaa < 2:2191863/148‑1 (MQ=255) cgcTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTg < 1:3419994/148‑1 (MQ=255) cgcTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTg > 2:243742/1‑148 (MQ=255) ttCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGgct > 1:1573611/1‑148 (MQ=255) tCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGgctg > 2:522201/1‑148 (MQ=255) tttATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCtgctgc > 2:1484519/1‑148 (MQ=255) ttATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCa < 2:3545624/148‑1 (MQ=255) aTCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAAc > 1:135184/1‑148 (MQ=255) tCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACg > 2:1165284/1‑148 (MQ=255) ccATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACgg < 2:2996753/148‑1 (MQ=255) ccATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACgg > 1:1053965/1‑148 (MQ=255) aTAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCt > 2:1273857/1‑148 (MQ=255) tAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTg < 2:1793804/148‑1 (MQ=255) aCTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGtt < 1:3736207/148‑1 (MQ=255) cTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTc < 2:308402/148‑1 (MQ=255) tGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCa < 2:3122337/148‑1 (MQ=255) tGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCa < 2:3122497/148‑1 (MQ=255) gAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAgg > 2:2997556/1‑148 (MQ=255) cAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTg > 1:311826/1‑148 (MQ=255) gTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCgg > 1:1671568/1‑148 (MQ=255) | TATTCATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCCGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCGG > CP009273/2523911‑2524199 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |