Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 234,990 | G→T | 10.3% | F78L (TTC→TTA) | ykfM ← | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 234,990 | 0 | G | T | 10.3% | 684.9 / 3.2 | 312 | F78L (TTC→TTA) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (128/127); new base T (18/32); total (147/165) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.79e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
ACCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAA > CP009273/234843‑235137 | ccGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGa < 2:3090563/148‑1 (MQ=255) cGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGaa < 1:2670760/148‑1 (MQ=255) ggggTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGAt < 2:1619798/148‑1 (MQ=255) ggggTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGAt < 1:509848/148‑1 (MQ=255) gggTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGAtt > 2:1430813/1‑148 (MQ=255) gTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGAtttt < 1:552619/148‑1 (MQ=255) tGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTtta < 2:1477550/148‑1 (MQ=255) gATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTttat < 2:2552546/148‑1 (MQ=255) tAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTttatta < 1:158289/148‑1 (MQ=255) ttAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCg > 2:1500266/1‑148 (MQ=255) tAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgt > 2:3401046/1‑148 (MQ=255) tAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAgt > 1:3657808/1‑148 (MQ=255) ttGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaag‑ta < 2:2910617/148‑1 (MQ=255) tGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAgtaag‑taa > 1:742987/1‑148 (MQ=255) gACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑Taaa < 1:1099534/148‑1 (MQ=255) gACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑Taaa < 2:251825/148‑1 (MQ=255) aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑Taaaa < 1:426147/148‑1 (MQ=255) aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑Taaaa < 1:3311728/148‑1 (MQ=255) aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑Taaaa < 1:1408908/148‑1 (MQ=255) atCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTAc < 1:2813599/148‑1 (MQ=255) tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACa < 2:2252760/148‑1 (MQ=255) tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTTAGAATTATTTTTTTATATTAAT‑TAAAAtaaaatta > 1:1002281/1‑141 (MQ=255) tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAAAGATTTTATTATAGTAAG‑TAAAATTAAATGAat > 1:2689192/1‑148 (MQ=255) tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAat < 2:668956/148‑1 (MQ=255) gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAata < 2:1935442/148‑1 (MQ=255) cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAG‑TAAAAATAAAAGAATAtt > 1:13213/1‑148 (MQ=255) cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATAtt < 2:1144792/148‑1 (MQ=255) cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATAtt > 2:60677/1‑148 (MQ=255) aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTTAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTa < 2:537465/148‑1 (MQ=255) aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAT‑TAAAATTAAATGAATATTTa > 1:3406018/1‑148 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTaa < 1:1205862/148‑1 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTaa > 2:1942697/1‑148 (MQ=255) aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTaaa < 1:2617488/148‑1 (MQ=255) aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTaaa < 1:1923059/148‑1 (MQ=255) gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 2:1580652/148‑1 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:182225/148‑1 (MQ=255) cggttatATTACTATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGATTGATTTTTTTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGAc < 2:3265066/142‑1 (MQ=255) gttgatATTACGATAGATTTTATTAAAAATATATGATTTAGCTGTATTTTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTTTTTTTTTATCGTAAG‑TAAATTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACa < 2:436751/143‑1 (MQ=255) ggTGCTATTACTATAGCATTTTGTAAAAATATAAGATTTAGCTTTTTTGTTATGTGTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTATT‑TAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACa < 2:2329367/148‑1 (MQ=255) ggTGCTATTACGATAGATATTATTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTTTTTTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAT‑TAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACa < 2:3047676/148‑1 (MQ=255) aTTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATTATTTTTTTATAGTAAGTTAAAATAAAATAAAAATTTAAAAA‑GAAAACGACaataaaa > 1:2566341/1‑142 (MQ=255) taTAGCTATTATTAAATATATAATTGTTAGGTGTATTTTTTTGTTTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAg < 2:2856005/147‑1 (MQ=255) aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGc > 2:84874/1‑148 (MQ=255) aTAGATATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTTTTTTTTTGTCTGTGGCGAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATATTGATTTTATTATCGTAAT‑TAAATTTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGc < 1:3178224/148‑1 (MQ=255) aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAT‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGcac > 2:1048701/1‑148 (MQ=255) aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAG‑TAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAAAGAAAAGAAAAAGAAGaac > 1:2021187/1‑148 (MQ=255) attattAAAAATATAAGTTTTAGCTTTATTTTTTTGTCTGTGGCGAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAT‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 2:932571/148‑1 (MQ=255) attattAAAAATATAAGATTTAGGTGTTTTTTTTTTTCTGTGGATAATTTGACTACCTCGTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTTTTATCTTAAT‑TAAAATTAATTGAATATTTAAAACGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 1:2453244/148‑1 (MQ=255) aTTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCTTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 2:931557/148‑1 (MQ=255) aTTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGATTGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 2:1533249/148‑1 (MQ=255) ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAAt > 1:2488174/1‑148 (MQ=255) ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAT‑TAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACAAGAAACACAAGCACAGaaa > 2:2600754/1‑147 (MQ=255) tAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAATTATTTTATTATAGTTAG‑TAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAAAGACAATAAAAAGAAGCACACAAta > 1:1716685/1‑147 (MQ=255) aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGaaaaa > 1:889770/1‑145 (MQ=255) ttaaatttataAGTGTTTGCTTTTTTGTTAGGTCTGTGGCTAAATTGAATACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAT‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 2:1233504/141‑1 (MQ=255) gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAACCCAAGCACAGAATCaa > 2:2689743/1‑148 (MQ=255) tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAG‑TAAAATTAAATGAATATTTTAAAATGAAAACGACATGAAAACCAATCACacaaacaaa > 1:3008556/1‑147 (MQ=255) aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTAGAAATATTTTTTTATAGTAAG‑TAAAAATACAAGAATATTTAAAAATGAAAAAAACAAGAAACCCAAGCACACaaaaaaaa > 1:681671/1‑142 (MQ=255) aaaTATAAGTGTTTGCTGTTTTGTTTTGTCTGTGGCGAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGATTTTTTTTATTATCGTAAT‑TAAATTTACTTTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAtt < 2:1766084/148‑1 (MQ=255) aaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTTAAAATGAAAAAGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACAtt > 1:840893/1‑148 (MQ=255) atatAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGCACACAATCAACATtct > 1:2827502/1‑148 (MQ=255) taAGAGTTAGCGGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCa < 2:137235/148‑1 (MQ=255) aaGAGTTAGCTGTTTTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCGTAAT‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCaa < 2:613346/148‑1 (MQ=255) aaGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCaa > 2:3337040/1‑148 (MQ=255) attgTTAGTTGTTTTGTTATGTGTGTGGCTAATTTGACTACCTTGTTTTTTTTGATTAAGTATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 2:208696/145‑1 (MQ=255) gagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATc > 2:352680/1‑148 (MQ=255) agTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAG‑TAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATTAAACCGAAGCACAGAATAAACATTCTCCAATCa > 2:3062596/1‑148 (MQ=255) tAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAG‑TAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACATTATCCAAtaataa > 1:219620/1‑148 (MQ=255) tAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaa > 2:513840/1‑148 (MQ=255) gCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaaaa > 2:2759054/1‑148 (MQ=255) gCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATAATaaaa > 2:2395625/1‑148 (MQ=255) ttttttttGTCTGGGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGAAAT‑TAAATTTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGAACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 1:3074175/141‑1 (MQ=255) aTTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTGTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 2:2813788/148‑1 (MQ=255) aTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt > 2:1279490/1‑148 (MQ=255) ttttGTCTGTGGCTAATTTGACTACATTCGTTTTTTTGATTAATATTGATTTTTTTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGt < 2:806967/145‑1 (MQ=255) ttATGTTGGTGTCCAATTTGACTACCTTATTTTTTTTGATTAACAATTATTTTATTATCTTAAT‑TAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGt < 2:3217191/148‑1 (MQ=255) ttATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCTTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGt < 2:265595/148‑1 (MQ=255) ttgtgtgtgGCTAAATTGACTACCTTGTTTTTTTTGATTAATATTTATTTTATTATCTTAAT‑AAAATTTACATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:2733051/147‑1 (MQ=255) cTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAG‑TAAAAATACATGAATATTTTAAAATGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACAATCTACAATCATAAAATATTTGCGTGGTGCa > 1:618009/1‑148 (MQ=255) gtgGCGAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAT‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:1285772/148‑1 (MQ=255) gtgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAAATATTTTATTTTAGTTAG‑TAAAAATAAAAGAATATTTAAAAAAGAAAACGACAAGAAAACGAAGCACAAAAAAAACATTCTACAAAAAAAAAAAAATTAAGGGGAGCAtt > 1:3519365/1‑148 (MQ=255) gtctaaaTTGACTACCTTTTTTTTTTTTATTAATATTGATTTTATTATATTAAT‑TAAATTAAAATTAATATTAAAAAAGAAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtttt < 1:15145/144‑1 (MQ=255) aTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAG‑TAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGAAATGAAAAAGAAGCACAGAAAAAAAATTATACAATAATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt > 2:3641340/1‑148 (MQ=255) ttGACTACCTTGTTTTTTTTTATTAATATTGATTTTATTATCGTAAG‑AAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTg < 1:1837576/148‑1 (MQ=255) aatcccTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAT‑TAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAat < 2:3061335/144‑1 (MQ=255) aCCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTAATTTAATATCGTAAG‑TAAAATTACAAGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACATAAAAAACATTATCCAAACATAAAATATTTAAGTGGAGCATTTTATTATTTAAaata > 2:2529288/1‑148 (MQ=255) ttCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCTAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCAAAAAATATTTCAGTGGAGCATTTTATTATTGAATATagag > 2:3765085/1‑148 (MQ=255) ttCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATagag > 2:1876205/1‑148 (MQ=255) ttCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATagag > 2:711001/1‑148 (MQ=255) cGTTTTTTTTATTAAGATTGATTTTTTTATCGTAAG‑AAAAATTACATCAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 2:1678440/148‑1 (MQ=255) cGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCAGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt > 2:2672647/1‑148 (MQ=255) tttttttttATTAATAATTATTTTATTATCTTAAT‑TAAATTTACATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGtt < 1:2381590/147‑1 (MQ=255) ttttttttATTAATATTTATTTTATTATATTAAT‑AAAAATTACATTAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 1:1850030/148‑1 (MQ=255) tttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt > 1:3789578/1‑148 (MQ=255) ttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTa > 1:2928342/1‑148 (MQ=255) ttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTa > 1:2304687/1‑148 (MQ=255) ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt > 2:958869/1‑148 (MQ=255) tAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 2:3443813/1‑148 (MQ=255) tAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 1:3736097/1‑148 (MQ=255) gAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaa > 1:168683/1‑148 (MQ=255) | ACCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAG‑TAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAA > CP009273/234843‑235137 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |