Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,778,820 | G→A | 100% | intergenic (‑450/+301) | ypjC ← / ← ileY | pseudogene/tRNA‑Ile |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,778,820 | 0 | G | A | 98.5% | 912.3 / 2.1 | 273 | intergenic (‑450/+301) | ypjC/ileY | pseudogene/tRNA‑Ile |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/1); new base A (109/160); total (112/161) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.09e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
TGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGAT > CP009273/2778677‑2778964 | tgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGaataat > 2:1290648/1‑148 (MQ=255) tgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGaataat > 2:2521590/1‑148 (MQ=255) gcggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAAc < 2:402635/148‑1 (MQ=255) cggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAAcc < 1:1811785/148‑1 (MQ=255) ttCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTa > 1:947551/1‑148 (MQ=255) tCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGTCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTaa < 1:3628787/148‑1 (MQ=255) tGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAAt < 1:1290495/148‑1 (MQ=255) tGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAAt < 1:1290756/148‑1 (MQ=255) gTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGa > 2:1761159/1‑148 (MQ=255) gTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGa < 1:3024923/148‑1 (MQ=255) tCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGaa < 1:3235231/148‑1 (MQ=255) tCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGaa < 2:2139939/148‑1 (MQ=255) tCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGaa > 2:3489869/1‑148 (MQ=255) tagtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAgggg > 2:1858061/1‑148 (MQ=255) agtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGt < 1:1130361/148‑1 (MQ=255) gtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGta < 2:1212520/148‑1 (MQ=255) tagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtat > 1:1326229/1‑148 (MQ=255) tagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtat > 1:1221210/1‑148 (MQ=255) tagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtat > 1:1517198/1‑148 (MQ=255) agATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCCCGTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtcta > 2:2815896/1‑148 (MQ=255) agATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtata > 2:1774796/1‑148 (MQ=255) agATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtata < 1:2870015/148‑1 (MQ=255) gATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTataa > 1:530993/1‑148 (MQ=255) aTGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTataat > 2:2999470/1‑148 (MQ=255) tGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTataata > 2:636465/1‑148 (MQ=255) tttAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATaaa < 2:3035487/148‑1 (MQ=255) tttAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATaaa < 2:2291393/148‑1 (MQ=255) ttAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAAt > 2:565119/1‑148 (MQ=255) tAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATg < 2:2975169/148‑1 (MQ=255) aaGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGa < 2:160625/148‑1 (MQ=255) aGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGat > 1:1612063/1‑148 (MQ=255) aGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGat > 1:1342422/1‑148 (MQ=255) ggCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGata < 2:3107083/148‑1 (MQ=255) ggCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGata > 1:3134962/1‑148 (MQ=255) ggCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGata > 2:149566/1‑148 (MQ=255) gCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGataa < 1:411612/148‑1 (MQ=255) cGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGataat < 1:2469011/148‑1 (MQ=255) agaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGc < 1:3558283/148‑1 (MQ=255) gaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCt < 1:2787899/148‑1 (MQ=255) cATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCttt < 1:821171/148‑1 (MQ=255) cATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCttt < 2:587475/148‑1 (MQ=255) aTTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTa < 1:3370152/148‑1 (MQ=255) tttCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTAt < 1:616854/148‑1 (MQ=255) tttCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTAt < 1:2302711/148‑1 (MQ=255) ttCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATc > 1:1726317/1‑148 (MQ=255) ttCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATc > 1:2103674/1‑148 (MQ=255) tCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGTATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTa < 1:2408330/148‑1 (MQ=255) ccTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTaa < 1:464966/148‑1 (MQ=255) ccTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTaa < 1:290352/148‑1 (MQ=255) tACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTCGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTCTCGTTAATTa > 2:2753795/1‑148 (MQ=255) ctctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACt > 1:555632/1‑148 (MQ=255) tctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACtt < 2:3319802/148‑1 (MQ=255) ctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTa < 1:874886/148‑1 (MQ=255) tACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTaa < 2:1057630/148‑1 (MQ=255) ggCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTc < 1:262969/148‑1 (MQ=255) ggCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTc < 2:1164236/148‑1 (MQ=255) gCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTcc < 2:145872/148‑1 (MQ=255) ttGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcaca > 2:89355/1‑148 (MQ=255) ttGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcaca > 1:3493052/1‑148 (MQ=255) tGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt > 1:3773145/1‑148 (MQ=255) tGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt > 2:1652498/1‑148 (MQ=255) tGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt > 1:3323597/1‑148 (MQ=255) tacatTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAAt < 1:2333807/148‑1 (MQ=255) ttGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGc < 1:2558006/148‑1 (MQ=255) tGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGcc < 1:1115245/148‑1 (MQ=255) ttGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGc > 2:1131229/1‑148 (MQ=255) tgGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTg < 2:3566682/148‑1 (MQ=255) tgGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTg < 2:3568570/148‑1 (MQ=255) tACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCa < 1:1290683/148‑1 (MQ=255) aCTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAt < 1:1652498/148‑1 (MQ=255) tCACTTATCATCAGTGAGCGAAGAGAGAATAGTTCAGTGATTTTAATTATTAACCTGATTAAATGAAGGTGTATAATAAATTATAATACTCTTTATTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGACCGCTTGGAATAg < 2:551964/148‑1 (MQ=255) cTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAg > 1:1909070/1‑148 (MQ=255) ttATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAgg > 2:3676838/1‑148 (MQ=255) tATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGc > 1:1746274/1‑148 (MQ=255) atcatcAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCa > 2:2475854/1‑148 (MQ=255) tcatcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAt > 2:2629630/1‑148 (MQ=255) tcatcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAt > 1:2436586/1‑148 (MQ=255) caGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAttttt > 2:1977795/1‑148 (MQ=255) caGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAttttt > 1:1387362/1‑148 (MQ=255) gAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCa < 2:842423/148‑1 (MQ=255) gAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCa < 1:278324/148‑1 (MQ=255) aGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAg > 2:1015471/1‑148 (MQ=255) cGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGt > 1:904898/1‑148 (MQ=255) aCAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACt > 2:2458149/1‑148 (MQ=255) aCAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACt > 2:3067389/1‑148 (MQ=255) cAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACtt > 1:3113575/1‑148 (MQ=255) agaATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTg > 2:2645889/1‑148 (MQ=255) gaATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGa < 2:3393855/148‑1 (MQ=255) gaATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGa < 2:1395117/148‑1 (MQ=255) gaATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGa < 2:946525/148‑1 (MQ=255) aGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGa < 1:1357865/148‑1 (MQ=255) aGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGa > 2:106498/1‑148 (MQ=255) ttCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGt < 2:1726836/148‑1 (MQ=255) gTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTg > 1:2300046/1‑148 (MQ=255) gTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTg < 1:636515/148‑1 (MQ=255) tGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGa < 2:3261480/148‑1 (MQ=255) tGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGa < 1:1946600/148‑1 (MQ=255) tGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGa > 2:449173/1‑148 (MQ=255) tttGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTAc > 1:1493430/1‑142 (MQ=255) ttGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGa > 1:1849379/1‑148 (MQ=255) | TGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGAT > CP009273/2778677‑2778964 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |