Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,828,952 | C→A | 100% | T611T (ACG→ACT) | hypF ← | carbamoyl phosphate phosphatase and maturation protein for [NiFe] hydrogenases |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,828,952 | 0 | C | A | 99.5% | 571.1 / ‑5.9 | 187 | T611T (ACG→ACT) | hypF | carbamoyl phosphate phosphatase and maturation protein for [NiFe] hydrogenases |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base A (92/92); minor base T (0/2); total (92/95) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAA > CP009273/2828807‑2829096 | gTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGt < 1:1762932/148‑1 (MQ=255) tgcctgccAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGtg < 1:3138921/148‑1 (MQ=255) gcctgccAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGtgg < 1:866738/148‑1 (MQ=255) gccAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCTAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGtggctgg > 1:3342060/1‑148 (MQ=255) ttCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGcac > 1:3531627/1‑148 (MQ=255) ttCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGcac > 1:629170/1‑148 (MQ=255) ttCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGcac > 1:1637147/1‑148 (MQ=255) ttCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGcac > 1:1267501/1‑148 (MQ=255) gCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGcc < 2:693505/148‑1 (MQ=255) aCTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAg < 2:1425162/148‑1 (MQ=255) ctgctgCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGt > 1:1009649/1‑148 (MQ=255) tgctgcCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTg > 2:3394033/1‑148 (MQ=255) gAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTgccgccgcc > 2:3466329/1‑148 (MQ=255) aaaGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCa > 2:3651627/1‑148 (MQ=255) aaaGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCa > 1:2205164/1‑148 (MQ=255) aaaGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCa > 1:2935737/1‑148 (MQ=255) aGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACt > 2:1907145/1‑148 (MQ=255) gTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTg > 2:1110737/1‑148 (MQ=255) tGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGc > 2:1492717/1‑148 (MQ=255) tGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGc > 1:3681754/1‑148 (MQ=255) tGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGc < 1:2812839/148‑1 (MQ=255) aTCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGaaa > 2:1181445/1‑148 (MQ=255) aTCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACGCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCGGCGTCACCTTCTGAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGaaa > 1:1252866/1‑148 (MQ=255) tCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGaaaa > 1:372395/1‑148 (MQ=255) ccAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGaaaaa < 2:496528/148‑1 (MQ=255) gTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACg > 1:1802412/1‑148 (MQ=255) gTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACg > 1:2443262/1‑148 (MQ=255) gTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACg < 2:2010021/148‑1 (MQ=255) ttGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGc > 1:2171475/1‑148 (MQ=255) gATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGccc < 2:787808/148‑1 (MQ=255) ttGTCCCCCCGCGGCATTGTCCCCGGATGCGTCACGCCGTGGCTTGTGGCTGCGAGCGCCTCCAGCGCACAAGCGGCTACACCTTCATAACTTAATGTGGCGGGCGCACAGCCCTGGGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcac < 1:1943332/148‑1 (MQ=255) ttGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcac > 1:1465454/1‑148 (MQ=255) tGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcaca > 2:1644195/1‑148 (MQ=255) tCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACg > 2:623112/1‑148 (MQ=255) aCCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATg < 2:2054920/148‑1 (MQ=255) cgcgGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACg > 1:1185094/1‑148 (MQ=255) gcgGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAGAAACGCCCACACGATGACGc < 1:1417758/148‑1 (MQ=255) gcgGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGc < 1:3471200/148‑1 (MQ=255) cgGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGcc > 2:920493/1‑148 (MQ=255) ttGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAgcgg > 2:3053951/1‑148 (MQ=255) gTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAgcggcg < 2:2726311/148‑1 (MQ=255) gTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAgcggcg < 2:2035859/148‑1 (MQ=255) cACCGGATGCGTCACTCCGTGGCTTGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGGGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGcgcg < 1:1102556/148‑1 (MQ=255) cACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGcgcg < 2:2321562/148‑1 (MQ=255) ccGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGATCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGtt < 2:2669351/148‑1 (MQ=255) ccGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGtt < 2:2534891/148‑1 (MQ=255) cGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTa > 1:889480/1‑148 (MQ=255) ggATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTaa < 2:561723/148‑1 (MQ=255) tCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACg > 2:1188934/1‑148 (MQ=255) cACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGc > 2:2346611/1‑148 (MQ=255) cACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGc > 2:2070593/1‑148 (MQ=255) aCTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCt < 2:49641/148‑1 (MQ=255) cTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTc > 1:2586811/1‑148 (MQ=255) tCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCa < 1:2483854/148‑1 (MQ=255) ccGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCaa < 2:1026265/148‑1 (MQ=255) ccGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCaa < 1:530057/148‑1 (MQ=255) ccGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCaa < 2:1988808/148‑1 (MQ=255) ccGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCGTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTCATTCCACGCTCaa > 1:2340663/1‑148 (MQ=255) tGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGGTAATTCCACGCTCAATgg > 2:1923462/1‑148 (MQ=255) tGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCcgc > 1:2401648/1‑148 (MQ=255) tGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCcgc > 1:2401661/1‑148 (MQ=255) tGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGc < 2:3715318/148‑1 (MQ=255) tGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGc < 2:2594281/148‑1 (MQ=255) cgcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTc > 1:1225204/1‑148 (MQ=255) cgcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTc > 1:1926245/1‑148 (MQ=255) cgcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTc < 2:304108/148‑1 (MQ=255) cgcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTc > 2:112519/1‑148 (MQ=255) cgcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTc < 2:2161641/148‑1 (MQ=255) ccTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCa > 1:471344/1‑148 (MQ=255) ccTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCa > 1:1008367/1‑148 (MQ=255) cTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAg < 2:1256010/148‑1 (MQ=255) cTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGGGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAg < 2:332404/148‑1 (MQ=255) cTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCACTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACCCCCACACGAAGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACCCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAg > 2:2989073/1‑148 (MQ=255) cccAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGt < 1:2350928/147‑1 (MQ=255) cAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGttt < 2:2139637/148‑1 (MQ=255) cAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGttt < 2:1267546/148‑1 (MQ=255) cAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGttt < 2:3531627/148‑1 (MQ=255) cAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGttt < 2:1637147/148‑1 (MQ=255) cAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGttt < 2:1267501/148‑1 (MQ=255) gagCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTg < 1:1540747/148‑1 (MQ=255) agCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGc > 2:2427807/1‑148 (MQ=255) agCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGc > 1:1089512/1‑148 (MQ=255) gCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAAAGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGca > 2:1150424/1‑148 (MQ=255) cGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGcaca < 1:3750659/148‑1 (MQ=255) cGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGcaca < 1:2209955/148‑1 (MQ=255) tCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTg < 1:3417778/148‑1 (MQ=255) aCCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCt > 2:807187/1‑148 (MQ=255) aCCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGGTGCACACTTGCt > 2:249230/1‑148 (MQ=255) ccTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTg > 2:2716945/1‑148 (MQ=255) ccTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTAAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTg > 2:2717452/1‑148 (MQ=255) ttCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGtt > 2:3545676/1‑148 (MQ=255) ttCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGGTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGtt > 1:2123527/1‑148 (MQ=255) tCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGttt < 1:1024565/148‑1 (MQ=255) cATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTc < 2:3234/148‑1 (MQ=255) cATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTc < 2:1616594/148‑1 (MQ=255) tAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCag > 1:754941/1‑148 (MQ=255) aaCTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCaga > 1:390112/1‑148 (MQ=255) cTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGt < 2:1518655/148‑1 (MQ=255) ttAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTa < 2:2652770/148‑1 (MQ=255) tAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTaa < 1:3787589/148‑1 (MQ=255) | GTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAA > CP009273/2828807‑2829096 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |