Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,243,768 | C→T | 100% | intergenic (+33/‑153) | yqjK → / → yqjF | uncharacterized protein/putative quinol oxidase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,243,768 | 0 | C | T | 96.9% | 707.7 / 8.5 | 224 | intergenic (+33/‑153) | yqjK/yqjF | uncharacterized protein/putative quinol oxidase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/3); new base T (105/112); total (109/115) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.16e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GACGATTCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATCCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACAATCAGCAGCCTGAGTGGCGCAGTGG > CP009273/3243624‑3243912 | gACGATTCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATtcca > 2:2498177/1‑147 (MQ=255) gACGATTCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCt > 2:1663115/1‑148 (MQ=255) gACGATTCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCt < 1:2293224/148‑1 (MQ=255) aTTCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCaaa > 1:383864/1‑148 (MQ=255) ttCGCCATCCTAATATGGTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGGGTATGGAGCGCCTGGCGTGTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAAt < 1:3165306/148‑1 (MQ=255) ttCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAAt > 1:1963667/1‑148 (MQ=255) tCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAAtt > 1:246866/1‑148 (MQ=255) tCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAAtt > 2:3737616/1‑148 (MQ=255) ccATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAAttttt > 2:3646210/1‑148 (MQ=255) ccATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAAttttt > 2:960926/1‑148 (MQ=255) cATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAAtttttt > 2:18486/1‑148 (MQ=255) ccTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGaa > 1:191885/1‑148 (MQ=255) cTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAg < 2:1257320/148‑1 (MQ=255) cTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATCCCTCAAATTTTTTGAAg < 2:1072124/148‑1 (MQ=255) tAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGa > 1:1075023/1‑148 (MQ=255) aaTATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGAt < 1:1400912/148‑1 (MQ=255) aaTATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGAt > 1:3471333/1‑148 (MQ=255) atatGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGAtt < 2:1567215/148‑1 (MQ=255) tatgagggTCCACTGTGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGGGCGTGGCGTCTTGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGAttt < 1:2007456/142‑1 (MQ=255) tatGGTGGTCCGCTGGGCCAGACGGGGTTTGGGCGTTTGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGAttt < 1:407289/148‑1 (MQ=255) tatGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGAttt > 1:1109140/1‑148 (MQ=255) gcgggTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTg < 2:2550246/145‑1 (MQ=255) gCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTg < 2:1193810/148‑1 (MQ=255) gCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTg > 2:3594540/1‑148 (MQ=255) cTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGa < 2:3284258/148‑1 (MQ=255) cTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACGTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGa < 1:540867/148‑1 (MQ=255) ggTCCGGTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCTTATGGAGCGCGGGGGGTGTGTTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACGTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACa < 1:17152/148‑1 (MQ=255) ggTCCGCTGGGCCCGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAACACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACa < 1:17196/148‑1 (MQ=255) ggTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACa < 2:131254/148‑1 (MQ=255) gTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAg < 1:2218023/148‑1 (MQ=255) cTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAACACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTc < 2:2590590/148‑1 (MQ=255) cTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTc > 2:2950570/1‑148 (MQ=255) tGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTcc < 2:237949/148‑1 (MQ=255) tGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTcc > 2:3462850/1‑148 (MQ=255) 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aGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTa < 2:2006508/148‑1 (MQ=255) aGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTa < 2:72621/148‑1 (MQ=255) cgcgGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACa < 1:3278153/148‑1 (MQ=255) cgGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAat < 1:2381759/148‑1 (MQ=255) ttttGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAatcat > 1:2709618/1‑148 (MQ=255) gCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAACTTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTc < 2:743746/148‑1 (MQ=255) gCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTc < 1:3554898/148‑1 (MQ=255) tGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTcaccac > 1:789531/1‑148 (MQ=255) tGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTcaccac > 2:1132484/1‑148 (MQ=255) tGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTcaccac > 1:789524/1‑148 (MQ=255) gAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGt > 1:1643460/1‑148 (MQ=255) gAGCACCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGt > 2:492836/1‑148 (MQ=255) gcgcCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGttt < 2:489900/148‑1 (MQ=255) cgcCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTa > 1:1453323/1‑148 (MQ=255) ccTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATg > 1:77162/1‑148 (MQ=255) tGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGAt > 1:1174345/1‑148 (MQ=255) tGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGAt > 1:647630/1‑148 (MQ=255) tGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATCCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGAt > 1:400027/1‑148 (MQ=255) ggCGTCTTTATAACACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGAtt < 1:705570/148‑1 (MQ=255) ggCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGAtt < 1:2450796/148‑1 (MQ=255) ggCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGAtt > 1:3105124/1‑148 (MQ=255) ggCGTCGGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGAtt < 2:401588/148‑1 (MQ=255) gCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATtc > 1:3290811/1‑148 (MQ=255) cTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATtctctc < 1:1582619/148‑1 (MQ=255) cTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATtctctc > 1:789419/1‑148 (MQ=255) tGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTcc < 1:3751886/148‑1 (MQ=255) gTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCAt > 1:1445696/1‑148 (MQ=255) ttAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATc > 2:969187/1‑148 (MQ=255) aaaCGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGAc < 1:2800227/148‑1 (MQ=255) aaaCGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGAc < 2:1421883/148‑1 (MQ=255) ccTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCGCCATCGACAGCAacg > 1:2139924/1‑148 (MQ=255) cAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAacgacg > 1:36052/1‑148 (MQ=255) cAAGCAGCAACAGATTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCGCCATCGACAGCAacgacg < 2:1521174/148‑1 (MQ=255) agcagcAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCt > 1:2689996/1‑148 (MQ=255) cagcaACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATCCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTaa < 2:3095720/148‑1 (MQ=255) 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ccTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACa > 2:1964013/1‑148 (MQ=255) ccTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCGCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACa < 2:819987/148‑1 (MQ=255) ccTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTAAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACa < 1:998947/148‑1 (MQ=255) ctctGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACaa < 2:3339866/148‑1 (MQ=255) ctctGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCGCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACaa < 2:1750571/148‑1 (MQ=255) tctGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACAAt < 2:2715227/148‑1 (MQ=255) tctGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCACAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATAATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACAAt < 1:2737660/148‑1 (MQ=255) ctGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACTTTTATGATTCTCGCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACAATc < 1:3646210/148‑1 (MQ=255) ctGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACAATc > 1:1380149/1‑148 (MQ=255) ggAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACAATCagcagc < 2:563500/148‑1 (MQ=255) 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tATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACAATCAGCAGCCTGAGTGGCGCAGTgg < 2:789419/148‑1 (MQ=255) | GACGATTCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATCCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACAATCAGCAGCCTGAGTGGCGCAGTGG > CP009273/3243624‑3243912 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |