| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 258,688 | 0 | C | A | 15.9% | 756.8 / 84.1 | 256 | intergenic (+31/+173) | thrW/ykfN | tRNA‑Thr/pseudogene, YdiA family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (96/119); new base A (23/18); total (119/137) | |||||||||||
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Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
TCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGTACACCACTC > CP009273/258544‑258835 | ccACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATtc < 2:728596/148‑1 (MQ=255) ccACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATtc < 2:3249126/148‑1 (MQ=255) ccGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTcc < 1:222945/148‑1 (MQ=255) ccGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTcc < 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ttCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCaa > 2:885287/1‑148 (MQ=255) ttCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCaa > 2:1275523/1‑148 (MQ=255) tCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTTGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCaaa > 2:672669/1‑148 (MQ=255) cGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATAATTCTCCCACCaaaaaa < 2:3062920/148‑1 (MQ=255) ttCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAAtt < 2:3348229/148‑1 (MQ=255) 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aGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTACCAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGt > 2:391264/1‑148 (MQ=255) aGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGt > 1:1268391/1‑148 (MQ=255) gATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGTa > 2:3478220/1‑148 (MQ=255) aTCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCATAGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGTac < 1:209873/148‑1 (MQ=255) aTCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGTac > 1:2812266/1‑148 (MQ=255) cTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGTacac > 2:3595855/1‑148 (MQ=255) cTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGTacac > 2:2440590/1‑148 (MQ=255) tATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGTAcacca < 1:476672/148‑1 (MQ=255) tATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGTAcacca < 1:2322999/148‑1 (MQ=255) tCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGTACACCACt > 1:467193/1‑148 (MQ=255) cATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGTACACCACTc > 1:26092/1‑148 (MQ=255) | TCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGTACACCACTC > CP009273/258544‑258835 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |