| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,296,612 | G→T | 100% | A255A (GCG→GCT) | yhbV → | U32 peptidase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,296,612 | 0 | G | T | 98.2% | 857.3 / 5.4 | 273 | A255A (GCG→GCT) | yhbV | U32 peptidase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/5); new base T (132/136); total (132/141) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.09e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.05e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
TGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTAA > CP009273/3296467‑3296756 | gAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGGGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACg > 2:2543132/1‑148 (MQ=255) gAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACg > 1:1271001/1‑148 (MQ=255) aaaCCAACATGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGcc < 2:1130775/148‑1 (MQ=255) aCCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCtt < 2:2423159/148‑1 (MQ=255) acaaGTGTTTGTACTCAATGGCATTCATACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGATCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCcgc > 2:3081591/1‑148 (MQ=255) aGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCt > 1:1959000/1‑148 (MQ=255) aGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCt > 2:3187532/1‑148 (MQ=255) gtgtTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTa < 2:3461427/148‑1 (MQ=255) gtgtTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTa > 2:1479597/1‑148 (MQ=255) gtgtTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATACTCGACGCCTTCCGCGCTa > 1:3404104/1‑148 (MQ=255) tgtTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTaa > 1:2865415/1‑148 (MQ=255) tgtTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTaa > 2:1862706/1‑148 (MQ=255) gtTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAAt > 2:1461121/1‑148 (MQ=255) ttGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGa > 1:400694/1‑148 (MQ=255) gTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGaaa < 1:1605407/148‑1 (MQ=255) tACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGaaaa > 1:2117474/1‑148 (MQ=255) tACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGaaaa < 2:595635/148‑1 (MQ=255) cTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATg > 2:3392410/1‑148 (MQ=255) tCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATgg > 1:1387954/1‑148 (MQ=255) aaTGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGgcg < 1:1766410/148‑1 (MQ=255) aaTGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGgcg < 1:1725980/148‑1 (MQ=255) aaTGGCATTCAGACCATGAGAGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGgcg > 1:3318091/1‑148 (MQ=255) aTGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGgcgc > 2:3354527/1‑148 (MQ=255) ggCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTg > 1:3814220/1‑148 (MQ=255) tCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGcacca < 1:1018970/148‑1 (MQ=255) tCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGcacca > 2:752252/1‑148 (MQ=255) tCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGcacca < 1:3721017/148‑1 (MQ=255) tCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGcacca < 2:2137676/148‑1 (MQ=255) tCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGcacca > 2:2843940/1‑148 (MQ=255) cAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTCaaccac > 1:2606316/1‑148 (MQ=255) gACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTg > 2:2991793/1‑148 (MQ=255) gACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTg > 2:1691220/1‑148 (MQ=255) gACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTg > 2:2148609/1‑148 (MQ=255) gACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTg < 1:683143/148‑1 (MQ=255) tGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGtt > 1:1914341/1‑148 (MQ=255) gAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTg < 2:638804/148‑1 (MQ=255) gAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTg > 2:3752129/1‑148 (MQ=255) aGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGa > 1:3043003/1‑148 (MQ=255) gCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGAc > 2:2707074/1‑148 (MQ=255) aCGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGaa > 1:845622/1‑148 (MQ=255) aCGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGaa > 2:2251883/1‑148 (MQ=255) aCGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGaa < 2:2115296/148‑1 (MQ=255) cGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAAc < 1:2324492/148‑1 (MQ=255) cGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAAc > 1:869108/1‑148 (MQ=255) tttACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCGGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAg > 1:1829750/1‑148 (MQ=255) ttACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGc > 1:1000221/1‑148 (MQ=255) ttACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGc > 2:1618976/1‑148 (MQ=255) aCAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGa < 1:1138785/148‑1 (MQ=255) aCCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTg > 1:2980693/1‑148 (MQ=255) ccTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGt > 1:2016018/1‑148 (MQ=255) aCGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGTTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGATAATTAAATTGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTa < 1:1688850/148‑1 (MQ=255) gCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTgg > 2:1108341/1‑148 (MQ=255) cATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTggcggcg > 2:2652462/1‑148 (MQ=255) aTCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTggcggcgg < 2:249327/148‑1 (MQ=255) tCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTggcggcggc > 1:563591/1‑148 (MQ=255) ccATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCt > 1:102370/1‑148 (MQ=255) ccATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCt > 1:2709351/1‑148 (MQ=255) cAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAg < 2:620608/148‑1 (MQ=255) aGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTAGGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAgg < 2:133172/148‑1 (MQ=255) gggCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGa < 2:1518355/148‑1 (MQ=255) gggCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATCAAAATGGCGCTGCACCACGGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGa < 1:442758/148‑1 (MQ=255) cTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTCTGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTgg < 2:2190586/148‑1 (MQ=255) cTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTgg < 2:2430873/148‑1 (MQ=255) cTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTgg < 2:3319363/148‑1 (MQ=255) 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tGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTaaa > 2:1391789/1‑148 (MQ=255) aCCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGc > 2:374096/1‑148 (MQ=255) ccGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCt < 1:1878502/148‑1 (MQ=255) cGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTc < 2:2850153/148‑1 (MQ=255) gCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCa < 2:208930/148‑1 (MQ=255) tgggTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAAGGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACt < 1:2296504/147‑1 (MQ=255) gggTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACtt < 1:2530434/148‑1 (MQ=255) gTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTg < 1:245723/148‑1 (MQ=255) tACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGt < 2:2020227/148‑1 (MQ=255) aCTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGtt < 1:3634405/148‑1 (MQ=255) cTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTa < 2:3675779/148‑1 (MQ=255) cTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTa < 2:1834532/148‑1 (MQ=255) tGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTaa < 2:1958924/148‑1 (MQ=255) acacTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTaaca < 2:2749389/148‑1 (MQ=255) cacTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTaacaa < 1:1827040/148‑1 (MQ=255) cacTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTaacaa < 1:3795409/148‑1 (MQ=255) acTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTaacaac < 2:1712033/148‑1 (MQ=255) cTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACt < 2:1271001/148‑1 (MQ=255) tttCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACtt < 1:1108373/148‑1 (MQ=255) tCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTa < 1:752252/148‑1 (MQ=255) tCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTa < 1:286483/148‑1 (MQ=255) | TGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTAA > CP009273/3296467‑3296756 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |