Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,306,165 | C→A | 45.9% | V125F (GTT→TTT) | rbfA ← | 30s ribosome binding factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,306,165 | 0 | C | A | 45.9% | 165.9 / 263.3 | 218 | V125F (GTT→TTT) | rbfA | 30s ribosome binding factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (52/66); new base A (57/43); total (109/109) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.70e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
CGGTTGGCGTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGCGGATGAAACCAGA > CP009273/3306018‑3306312 | gTTGGCGTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAacac > 1:3380253/1‑148 (MQ=255) tgggCTTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAAAAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACacg < 1:13691/146‑1 (MQ=255) tGGCGTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACacga < 1:2475567/148‑1 (MQ=255) cGTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGt < 1:2049366/148‑1 (MQ=255) cGTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGt > 2:65787/1‑148 (MQ=255) cGTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGt > 2:2900918/1‑148 (MQ=255) gTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGtt < 2:745729/148‑1 (MQ=255) gTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGtt > 1:2596698/1‑148 (MQ=255) gTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGtt < 2:2479330/148‑1 (MQ=255) ttATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttc < 2:2408694/148‑1 (MQ=255) ttATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttc < 1:1275759/148‑1 (MQ=255) ttATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGAAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttc < 1:33634/148‑1 (MQ=255) tatatataCGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGttct > 2:897177/1‑148 (MQ=255) atccGTTTCACTTTTGGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGTTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTc < 1:1009761/145‑1 (MQ=255) ataCGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTc > 1:35604/1‑148 (MQ=255) ataCGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTc < 1:1231072/148‑1 (MQ=255) ttCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGttt > 2:2632734/1‑148 (MQ=255) tCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTg < 2:3295957/148‑1 (MQ=255) cTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGAcc < 2:3098500/148‑1 (MQ=255) tttttGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCa > 1:580170/1‑148 (MQ=255) aGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGt < 2:3374998/148‑1 (MQ=255) aGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGt < 2:2096546/148‑1 (MQ=255) aGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCAGTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGt > 2:1181395/1‑148 (MQ=255) aTCGTTGCTGGACATACCCTGAGTTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCa < 1:1007711/148‑1 (MQ=255) aTCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCa < 2:2990787/148‑1 (MQ=255) tCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAg > 2:1102775/1‑148 (MQ=255) tCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAg > 2:1102001/1‑148 (MQ=255) cGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACTCGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAgg > 2:3253700/1‑148 (MQ=255) gTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGt < 1:3779394/148‑1 (MQ=255) gTTGCGGCACAAACCCTGCGGTTTATCCACCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGt < 1:3216420/148‑1 (MQ=255) ttGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGtt > 1:461467/1‑148 (MQ=255) tGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGttt < 1:1928643/148‑1 (MQ=255) tGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGAc < 1:3695386/148‑1 (MQ=255) aCATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATg > 2:3639082/1‑148 (MQ=255) aCATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATg < 1:233854/148‑1 (MQ=255) tccccTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATgcgc < 1:1776162/146‑1 (MQ=255) ctgtgttttATCCAGAAACAAACCGCCTTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATcc < 1:3540882/142‑1 (MQ=255) cTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATcc < 1:534754/148‑1 (MQ=255) gAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCt < 1:1731622/148‑1 (MQ=255) aGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCtt > 2:2949093/1‑148 (MQ=255) ggTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTc > 2:1661759/1‑148 (MQ=255) tATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAAcc < 1:715131/148‑1 (MQ=255) tCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCag > 2:1465432/1‑148 (MQ=255) tCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCag > 2:147552/1‑148 (MQ=255) ccAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCaga < 2:3040446/148‑1 (MQ=255) ccAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCaga > 2:635921/1‑148 (MQ=255) aaacaacaaAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCagag < 1:1065376/145‑1 (MQ=255) gCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCagagag > 1:384475/1‑148 (MQ=255) aaaaaaaCGCCTTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGtt < 1:1095130/145‑1 (MQ=255) 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tCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATc > 1:2270428/1‑148 (MQ=255) aTTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGc > 1:1567724/1‑148 (MQ=255) ttAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCt > 2:373548/1‑148 (MQ=255) gTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTc > 2:559366/1‑148 (MQ=255) ctcctTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTcccc > 1:1316077/1‑148 (MQ=255) tcctTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCca > 2:683551/1‑148 (MQ=255) cctTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCcag > 2:862298/1‑148 (MQ=255) cctTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCcag > 2:2090401/1‑148 (MQ=255) ctTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCcagc > 2:2334203/1‑148 (MQ=255) ctTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCcagc < 2:3678976/148‑1 (MQ=255) ctTGCTGTCGTCCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCcagc < 2:1035629/148‑1 (MQ=255) gtcgtcCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTg > 2:1715502/1‑148 (MQ=255) tcgtcCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGc > 1:1122861/1‑148 (MQ=255) tcCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGCGGa > 1:2226597/1‑148 (MQ=255) tcCGGGTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGCGGa < 1:1409712/148‑1 (MQ=255) ggTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGCGGATGaa < 1:1337526/148‑1 (MQ=255) ggTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGCGGATGaa > 1:1214236/1‑148 (MQ=255) ggTTAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGCGGATGaa < 1:3106199/148‑1 (MQ=255) ttAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGCGGATGAAAc > 2:1944439/1‑148 (MQ=255) ttAAAACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGCGGATGAAAc < 2:580170/148‑1 (MQ=255) cacGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGCGGATGAAACCAGa < 2:3380253/148‑1 (MQ=255) | CGGTTGGCGTTATATATACGTTTCACTTTTTGCAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACCAGAGAGTTGTCGTAGAAGAAGGTCAGTTCCGGCACGATACGCAGGCGCATCGCTTTCCCCAGCAGGCTGCGGATGAAACCAGA > CP009273/3306018‑3306312 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |