| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 3,334,940 | T→G | 46.3% | S106A (TCT→GCT) | kdsD → | D‑arabinose 5‑phosphate isomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,334,940 | 0 | T | G | 46.3% | 28.7 / inf | 205 | S106A (TCT→GCT) | kdsD | D‑arabinose 5‑phosphate isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/72); new base G (50/45); total (88/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.09e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |