Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 263,564 | G→T | 15.3% | I51I (ATC→ATA) | yafZ ← | CP4‑6 prophage; conserved protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 263,564 | 0 | G | T | 15.3% | 704.8 / 68.4 | 226 | I51I (ATC→ATA) | yafZ | CP4‑6 prophage; conserved protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (83/108); new base T (21/14); total (104/122) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.61e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
TTCCGGCACCTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTTGCTGCGCCAAAGCGCGAAGCCAGA > CP009273/263417‑263708 | ttCCGGCACCTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGgag < 2:1475486/148‑1 (MQ=255) ttCCGGCACCTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGgag > 2:1850037/1‑148 (MQ=255) ttCCGGCACCTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGgag > 1:3416711/1‑148 (MQ=255) ttCCGGCACCTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGgag > 2:3740163/1‑148 (MQ=255) ccGGCACCTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGAt < 2:520950/148‑1 (MQ=255) cGGCACCTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGAtg > 1:2619384/1‑148 (MQ=255) cGGCACCTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGAtg < 2:2721972/148‑1 (MQ=255) ggCACCTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGAtgg > 1:2456252/1‑148 (MQ=255) gCACCTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTAGGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCCAAGAATGGCTGGACGCCTTCTCGCTGTCGGCTGTCGCGCGGGGAGCtggg > 1:2007611/1‑147 (MQ=255) aCCTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGGTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAATGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGAtggttg < 1:2154181/148‑3 (MQ=255) ccTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTggg > 2:2525483/1‑148 (MQ=255) ccTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTggg > 1:3107542/1‑148 (MQ=255) ccTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTggg < 2:365576/148‑1 (MQ=255) ccTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGGAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTggg > 2:1279111/1‑148 (MQ=255) cTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGt > 1:712141/1‑148 (MQ=255) tGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGta > 2:2269014/1‑148 (MQ=255) gTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGtat > 2:1729902/1‑148 (MQ=255) aCCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAg < 1:3576831/148‑1 (MQ=255) aCCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAg < 2:3285612/148‑1 (MQ=255) cGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGt < 1:1144733/148‑1 (MQ=255) cGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGt < 1:2156803/148‑1 (MQ=255) tCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACg > 2:1361715/1‑148 (MQ=255) tGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCt < 1:888814/148‑1 (MQ=255) gCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTc > 1:3478870/1‑148 (MQ=255) cccTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCa > 2:3777982/1‑148 (MQ=255) cccTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCa > 1:1228537/1‑148 (MQ=255) cccTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCa > 1:3073384/1‑148 (MQ=255) cTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACt < 1:486275/148‑1 (MQ=255) cgccgcAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACggg > 1:2167861/1‑148 (MQ=255) gccgcAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGa < 1:2751433/148‑1 (MQ=255) gccgcAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGa < 1:3181094/148‑1 (MQ=255) cgcAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACt > 2:3800651/1‑148 (MQ=255) cAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCg < 2:2204493/148‑1 (MQ=255) aGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCgt < 1:383823/148‑1 (MQ=255) aCGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCgtgt > 1:223954/1‑148 (MQ=255) aCGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCgtgt > 1:548965/1‑148 (MQ=255) aCGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCgtgt > 1:3734152/1‑148 (MQ=255) caTATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTcc < 2:243044/148‑1 (MQ=255) tatGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTc < 2:3418298/148‑1 (MQ=255) gCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACt > 1:3008792/1‑148 (MQ=255) gCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACt > 2:1905111/1‑148 (MQ=255) ttGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGaa < 1:2110474/148‑1 (MQ=255) ttGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGaa < 1:3034329/148‑1 (MQ=255) tGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATacac > 1:2132518/1‑148 (MQ=255) tGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATacac < 2:1017964/148‑1 (MQ=255) gTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACt > 1:283115/1‑148 (MQ=255) ttCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTg > 1:3360913/1‑148 (MQ=255) cACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTggg < 1:847487/148‑1 (MQ=255) cgacgaCCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAATAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCa > 1:2346974/1‑148 (MQ=255) cgacgaCCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCa < 1:294326/148‑1 (MQ=255) cgacCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTa > 1:1891776/1‑148 (MQ=255) cgacCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTa > 2:1581647/1‑148 (MQ=255) cccGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTAcgc > 2:443694/1‑148 (MQ=255) ccGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTAcgcg > 1:1429847/1‑148 (MQ=255) ggTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGaaa > 2:607336/1‑148 (MQ=255) ggTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGaaa < 2:918849/148‑1 (MQ=255) ggTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGaaa < 1:813629/148‑1 (MQ=255) cacgcacgCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAg < 1:2649209/148‑1 (MQ=255) acgcacgcGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGc < 2:2395418/148‑1 (MQ=255) acgcacgcGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGc < 2:2234678/148‑1 (MQ=255) acgcacgcGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGc < 1:1268070/148‑1 (MQ=255) gcgGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTTGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCa < 1:1614200/148‑1 (MQ=255) ggTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACgg > 2:3611998/1‑148 (MQ=255) gTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACggg < 2:1689749/148‑1 (MQ=255) gTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACggg < 2:2122357/148‑1 (MQ=255) tCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGGGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGt > 2:3386122/1‑148 (MQ=255) tGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTa < 1:3345249/148‑1 (MQ=255) gACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTaa > 1:3092112/1‑148 (MQ=255) gACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTaa > 1:2951369/1‑148 (MQ=255) aCAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTacc > 2:113058/1‑146 (MQ=255) cAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAacggacg > 2:719412/1‑148 (MQ=255) aaaGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAacggacgg < 2:3696927/148‑1 (MQ=255) aaaGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAacggacgg < 2:44565/148‑1 (MQ=255) aGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTc > 1:1006929/1‑148 (MQ=255) aGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTc > 2:291263/1‑148 (MQ=255) aGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTc > 1:571448/1‑148 (MQ=255) aTGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTcgcg < 1:1481077/148‑1 (MQ=255) gCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACg > 1:847854/1‑148 (MQ=255) cTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACgg < 1:1850037/148‑1 (MQ=255) gAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATa < 2:3008792/148‑1 (MQ=255) gAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATa < 1:228503/148‑1 (MQ=255) aaGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATaa > 2:2639629/1‑148 (MQ=255) aaGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATaa > 2:3357628/1‑148 (MQ=255) aGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGATATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAg > 2:739251/1‑148 (MQ=255) ccTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGt > 2:3039199/1‑148 (MQ=255) ccTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGt > 2:2315541/1‑148 (MQ=255) cTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGtt < 2:642207/148‑1 (MQ=255) tctcGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTtg > 1:3536538/1‑148 (MQ=255) ctcGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTtgc < 1:2981240/148‑1 (MQ=255) ctcGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTtgc < 1:748539/148‑1 (MQ=255) tcGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTtgct > 2:2195869/1‑148 (MQ=255) gCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTtgctgc > 1:1522902/1‑148 (MQ=255) cGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTTGCTGCGCCAAAGCGCGa < 2:1740896/148‑1 (MQ=255) cAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTTGCTGCGCCAAAGCGCGAAGcc > 1:1757548/1‑148 (MQ=255) cAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTTGCTGCGCCAAAGCGCGAAGcc > 1:3650588/1‑148 (MQ=255) cAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTTGCTGCGCCAAAGCGCGAAGcc < 2:1366227/148‑1 (MQ=255) cAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGAATATTGTTTGTCCTCACACAAAACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTTGCTGCGCCAAAGCGCGAAGcc > 1:3746404/1‑148 (MQ=21) ggAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTTGCTGCGCCAAAGCGCGAAGCCAGa < 2:1212381/148‑1 (MQ=255) ggAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTTGCTGCGCCAAAGCGCGAAGCCAGa > 1:5015/1‑148 (MQ=255) ggAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTTGCTGCGCCAAAGCGCGAAGCCAGa < 1:2125968/148‑1 (MQ=255) | TTCCGGCACCTGTTTACCGGTGATCTGCCCTTCCCGCCGCAGACGCAGCATATGCTTTGTATGTTCACGACGACCCGGGTCACGCACGCGGGTCTGACAGGCAAAGAATGGCTGGAAGCCTTCTCGCTGTAGGCTGTCGAGCAGGGAGATGGTGGGTATATAGGTATAACGCTCACTACGGGACTCGTGTTTGTCCTCACTGAATACACTGGGCACTACGCGAAACAGCTCTTCACGGGTTAACGGACGGTCGCGACGGATAAGGTTTGCTGCGCCAAAGCGCGAAGCCAGA > CP009273/263417‑263708 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |