| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 360286 | NA (NA) | 5 (0.020) +AATTC |
4/266 | NT | 3.4% | intergenic (‑220/+375) | lacZ/lacI | pseudogene, truncated/DNA‑binding transcriptional repressor |
| ? | CP009273 | 3416618 = | 147 (0.630) | intergenic (+65/+164) | yhdZ/rrfF | putative amino‑acid transporter subunit/5S ribosomal RNA of rrnD operon | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
GTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG > CP009273/3416470‑3416763 | gTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTc < 2:4108750/149‑1 (MQ=255)gTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTc < 1:3051648/149‑1 (MQ=255)gTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTc < 1:3648058/149‑1 (MQ=255)gTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTc < 1:3648046/149‑1 (MQ=255) tGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCt > 2:1309587/1‑149 (MQ=255) gAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTgg > 1:2866768/1‑149 (MQ=255) gAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTgg > 1:2867696/1‑149 (MQ=255) aGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGc < 2:1450138/149‑1 (MQ=255) aGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGc > 2:3817945/1‑149 (MQ=255) aGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGc > 2:3818017/1‑149 (MQ=255) aGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGtt > 1:553366/1‑149 (MQ=255) aGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGtt > 1:2129863/1‑149 (MQ=255) aGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGtt > 2:1306864/1‑149 (MQ=255) gCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGttt > 1:86207/1‑149 (MQ=255) atgaATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcgggcg > 2:1591691/1‑149 (MQ=255) gaATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTc > 2:1332467/1‑149 (MQ=255) aaTTTTTTGCGCAGCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTcc < 2:126792/149‑1 (MQ=255) tttGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGccc < 2:2056009/149‑1 (MQ=255) gcgcATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGcc > 2:2421028/1‑149 (MQ=255) gcgcATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGAGGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGcc > 1:1423645/1‑149 (MQ=255) gcATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCAc > 1:1885786/1‑149 (MQ=255) cATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCAcc > 1:1445665/1‑149 (MQ=255) aTCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCAccc > 2:2139039/1‑149 (MQ=255) cTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAAGGTGAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTcc < 2:3024180/149‑1 (MQ=255) aTCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCAATTAATTGAATGTTAGTTCGAAACGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGc < 2:3635865/149‑1 (MQ=255) tCAGAGCGTACGAGGGAATTTTTATCGCAGTTAATCAATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGAAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCATTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGcc < 2:553366/149‑1 (MQ=37) cttACGAGGGCTTTTTTAGCGCAGGTAATCCATTATTTGAATTTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCA‑ATCCTTGCGGCGGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCGGGCAGTTTTGGGGGGGCGTCGTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCt < 2:710371/147‑1 (MQ=25) cGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAGCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCt < 2:516709/149‑1 (MQ=255) gAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGGGTCGCa > 1:433655/1‑149 (MQ=255) aGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCaa > 2:1712909/1‑149 (MQ=255) gCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGt > 2:296009/1‑149 (MQ=255) aTTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTc > 2:589727/1‑149 (MQ=255) tttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCaaa > 2:2716909/1‑149 (MQ=255) tctCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTGAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGAGGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGCCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATc < 2:51314/147‑1 (MQ=255) tATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGGTTCGCAACCTTCAAAta > 1:1651673/1‑148 (MQ=255) tATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATc < 2:616078/149‑1 (MQ=255) gagcGCAGGTAATCCATTAATTGACTGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTAGGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGGTGCTTCGCAACGTTCAAATc < 2:51448/146‑1 (MQ=255) aTCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATcc > 2:453599/1‑149 (MQ=255) cGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGc < 2:2867696/149‑1 (MQ=255) aGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTAGCAACGTTCAAATCCGCTcc > 1:3230889/1‑149 (MQ=255) gttAATCAATTAATTGAATGTTTGTTCTAAAA‑CAAAAACGCCAATCATTTGGGAGGGCTTTTCGATTTATTTTCTTCCTGGCTTTTTTGGGGGGGGGTCCCGCCCCCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTccc < 1:1530520/147‑1 (MQ=9) ttAATCAATTAATTTATTGTTCGTTCGAAAAGCAAAAAGGCA‑ATCGTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGGGGGCGTCCTGCCCCCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcg < 1:1207643/148‑1 (MQ=18) gaaaTCCATTAATTGAATGTTAGTGCTAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTGCGGTTGGCCTTTCGGTTTTTTTGATGTCTGGCTGTTTTTGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcg < 1:257359/147‑1 (MQ=18) 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aTTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCGTCGCCACCTTGAAATACGCTCCCCGCGGATTTGtg > 1:180049/1‑148 (MQ=18) ttGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGGTTGATTTCAACAGTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGGTTCGCAAAGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGtgc > 1:4035049/1‑147 (MQ=18) gAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTa > 2:2271781/1‑149 (MQ=255) gAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCAGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGGTTCGCAACGTTCAAATACGCTCCCGGCGGATTTGtgcga > 1:3266056/1‑145 (MQ=255) gAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCAGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCGTCGCAACCTTAAAATCCGCTACCCGCGGCTTTTTCCTa > 1:2140671/1‑149 (MQ=18) 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aaaaGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGGGTGGCAACGTTGAAAAACCCGCCCGGCGGATTTGTGCTACTCCGGCGACTGTTCACCGa > 1:1947596/1‑149 (MQ=17) aaaGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCGTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTTTCCTACTCGGGAGAGGGTTCACCGac > 2:2800595/1‑149 (MQ=255) aaGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGaca > 2:4040113/1‑149 (MQ=255) ccaacccTTTCGGATGGCCTTTCGCTTTTTTTGTTGTCGGGCTGTTTTTGGCGGGCGTCCGGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGacaaac < 1:1847046/144‑1 (MQ=14) c‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGCGAGTGTTCACCGacaaacaa > 2:505018/1‑149 (MQ=255) tCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAacaaca > 2:2338859/1‑149 (MQ=255) tCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAacaaca > 2:3552140/1‑149 (MQ=255) tCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAacaaca < 2:3063598/149‑1 (MQ=255) gtttCGTAGGGCTTTTGGTTTGTTTTGTTGTCTGGAAGTTTATGGGGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGa < 2:1740886/148‑1 (MQ=14) cTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACCAACAACAGa > 2:2623876/1‑149 (MQ=255) ttCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTTCTTCGCCAACTTGAAAAACCCTCCCCGCGGATTTGTGCTAATAGGGGGAGTGTTGAACGACAAacaacacaaa > 1:195975/1‑145 (MQ=14) ttCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTTCGTAGCAACCTTAAAATACCCTCCCCGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTTTTCACCCACAAacaacacaaa > 1:1026248/1‑145 (MQ=14) ttCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTAAAATCCGCGACCGGCGGATTTGTCCTAATCGGGAGAGTGTTAACCGACAAACAACAGATa > 1:3075244/1‑149 (MQ=14) ttCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCGTCCCCACCTTAAAAAACCCGCCCCGCGGGTTTGTGCTACTCGGGAGAGTGTTGAACCACAAACAACAAATa > 1:1026455/1‑149 (MQ=14) gATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGGTTGGCAACCGACAAAAAACCGCCCCGCCGCTTTTTGCTAAACGGGGGAGTGTTAACCGACAAACAAAACATaaaaa > 1:86812/1‑148 (MQ=9) aTGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGGGGGTTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGGCAAACAACAGATAAAACa > 2:41746/1‑149 (MQ=255) ggCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCATTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACaaa < 1:3149235/149‑1 (MQ=255) ggCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGGGTCGCCACCTTAAAAAACCCACCCCGCCGAGTTGTCCGACGCCGGCCCGTGTTCACCGGCAAACAAAAGATaaaaaaaa > 1:3997015/1‑149 (MQ=9) ggCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTAAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTACTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACaaa > 2:3619621/1‑149 (MQ=255) ggCCTTTCGCTTGAGTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACGCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACaaa > 2:2602003/1‑149 (MQ=255) gCCTTTCGCTTGTTTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACaaaa < 1:1287626/149‑1 (MQ=255) ttttCGCTTGTTTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCGGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAgg < 1:2856135/148‑1 (MQ=255) cTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCTTTTCGTCCCAACATTCAAAAACGCACCCCGCGGAATTGTCCTACAAGGGCCAATTTTGACCCACAAACAACAAATAAAAAAAAAgg > 1:3090340/1‑149 (MQ=9) tCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCGGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGccc < 1:1332467/149‑1 (MQ=255) cTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCGTGGCCAACTTCAAAAACGCGCCCCGCCGGATTGTGCGACGAGGGGGGGTGTTTACCGCCAAACAAAACATAAAAAAAAAGAccccct > 1:850682/1‑146 (MQ=9) ttgatttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTc < 2:2977881/149‑1 (MQ=255) ttgatttgatGGCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTc < 2:844804/149‑1 (MQ=255) tgatttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCt < 2:2546279/149‑1 (MQ=40) gatttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCATCGCAAAGTTCAAAGACGCTCCCGGCGGATTTGTCCTCCTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACCACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTcat > 2:2104633/1‑147 (MQ=14) atttgttGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTc < 2:2775497/149‑1 (MQ=255) ttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCg < 2:2583281/149‑1 (MQ=39) atGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACt > 2:3409437/1‑149 (MQ=39) | GTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCC‑ATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG > CP009273/3416470‑3416763 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |