| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,591,218 | G→A | 35.2% | intergenic (‑298/‑126) | livK ← / → panM | leucine transporter subunit/PanD autocleavage accelerator, panothenate synthesis |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,591,218 | 0 | G | A | 35.2% | 291.9 / 247.9 | 234 | intergenic (‑298/‑126) | livK/panM | leucine transporter subunit/PanD autocleavage accelerator, panothenate synthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (56/94); new base A (41/41); total (97/137) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.09e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.19e-01 | |||||||||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
TTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCATGAAGCTGACCATCATTCGATT > CP009273/3591070‑3591366 | tttCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATg < 2:1677224/149‑1 (MQ=255) tCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGtt > 1:869853/1‑149 (MQ=255) tCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATAtt < 2:1799827/149‑1 (MQ=255) tCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTaa < 2:1430516/149‑1 (MQ=255) gATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAAtt > 2:223793/1‑149 (MQ=255) aTTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGACTAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAAttt > 2:2393658/1‑149 (MQ=255) aTTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAAttt < 2:366602/149‑1 (MQ=255) ttAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAAtttt < 1:2237941/149‑1 (MQ=255) ttAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAAtttt < 1:163680/149‑1 (MQ=255) tAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTg > 1:843825/1‑149 (MQ=255) aaGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGt > 2:3835115/1‑149 (MQ=255) gAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTaa > 1:2590371/1‑149 (MQ=255) aCAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAatt > 1:3178352/1‑149 (MQ=255) cAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAatta < 2:2102700/149‑1 (MQ=255) aGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAattat < 2:56065/149‑1 (MQ=255) tCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTaa > 2:107731/1‑149 (MQ=255) aaTTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTaaaaaa < 1:3049494/149‑1 (MQ=255) aaTTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTaaaaaa < 1:2360772/149‑1 (MQ=255) aTTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAt < 1:2661548/149‑1 (MQ=255) aTTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAt > 2:3785045/1‑149 (MQ=255) tttATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAtt < 2:2230945/149‑1 (MQ=255) tttATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAtt < 1:1266793/149‑1 (MQ=255) aTTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAAt < 2:853025/149‑1 (MQ=255) ttGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATc < 2:1437639/149‑1 (MQ=255) tGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCa < 2:2298768/149‑1 (MQ=255) gatagataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCAc < 1:2462720/149‑1 (MQ=255) gatagataAACAGAAAAAAGTGCCATTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCAc < 1:1998710/149‑1 (MQ=255) atagataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCAcc > 1:104432/1‑149 (MQ=255) tagataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCt > 1:133511/1‑149 (MQ=255) agataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTg > 1:99576/1‑149 (MQ=255) gataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGTTGTTAAAAAATTAATCACCTGc > 1:1850139/1‑149 (MQ=255) gataAACAGAAAAAAGTGCCTGTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACGATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCGAATGTTTTAATTTTGGAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGc < 2:2555446/149‑1 (MQ=255) ataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGcc < 1:1424483/149‑1 (MQ=255) aCAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCaaaa > 1:2139094/1‑149 (MQ=255) cAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAg > 1:1537401/1‑149 (MQ=255) aGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGa < 2:2156243/149‑1 (MQ=255) aaaaaGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAAt > 1:1290171/1‑149 (MQ=255) aaaaGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATa > 1:3741606/1‑149 (MQ=255) aaGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGTGAGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATaaa < 1:353615/149‑1 (MQ=255) gTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATaaaaa > 2:1145830/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAag > 2:2914379/1‑149 (MQ=255) cTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAagag < 1:2242830/149‑1 (MQ=255) tttGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAgaga < 1:438974/149‑1 (MQ=255) tttGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAgaga < 1:3408115/149‑1 (MQ=255) gTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTTGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTTTTAAAAAATTAATCACCTTCCAAAAGAAATAAAAAATAGAAAg > 2:3053185/1‑149 (MQ=255) tCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGc > 2:3378574/1‑149 (MQ=255) tCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGc > 1:3566377/1‑149 (MQ=255) tCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGc > 1:3565890/1‑149 (MQ=255) tCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGc > 1:88351/1‑149 (MQ=255) cAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGcc < 2:2307723/149‑1 (MQ=255) aGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCt < 2:2012903/149‑1 (MQ=255) gCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTc > 1:1213890/1‑149 (MQ=255) gCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTc < 1:1345120/149‑1 (MQ=255) gCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTc < 1:1345683/149‑1 (MQ=255) cATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTcc < 2:811688/149‑1 (MQ=255) aaTAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTa > 2:376030/1‑149 (MQ=255) aTAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTaa > 1:537800/1‑149 (MQ=255) aaCGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGCAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAat < 2:409349/149‑1 (MQ=255) aCGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAatt > 2:2395462/1‑149 (MQ=255) ggCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAattat < 2:2672064/149‑1 (MQ=255) caAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCg > 2:3850793/1‑149 (MQ=255) caAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCg > 1:1593373/1‑149 (MQ=255) aaaGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGc < 1:1062379/149‑1 (MQ=255) aaGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAGGCCTCCGATTAAATTATTTCGCt > 2:31606/1‑149 (MQ=255) aaGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCt > 1:1728120/1‑149 (MQ=255) aGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATTTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTa < 1:1474503/149‑1 (MQ=255) cGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACt < 1:3935616/149‑1 (MQ=255) gAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTgg < 1:107723/149‑1 (MQ=255) aatTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTcc > 1:3693285/1‑149 (MQ=255) ttCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCAc < 1:2873194/149‑1 (MQ=255) ttCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCAc > 1:2701882/1‑149 (MQ=255) cACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACtt < 1:2393684/149‑1 (MQ=255) aCTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCAAttt > 2:2154547/1‑149 (MQ=255) cTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACtttt > 1:1875546/1‑149 (MQ=255) cTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACtttt > 1:2383068/1‑149 (MQ=255) aTCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTtgt < 1:2929969/149‑1 (MQ=255) aTCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTtgt < 2:2383068/149‑1 (MQ=255) tCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTATAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTtgtg < 2:3590869/149‑1 (MQ=255) cATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGa < 2:2628471/149‑1 (MQ=255) cATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGa < 2:562361/149‑1 (MQ=255) aTTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGAt > 1:2492835/1‑149 (MQ=255) aTTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGAt > 2:3132258/1‑149 (MQ=255) ttCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGAtt > 1:3480166/1‑149 (MQ=255) cAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTa < 1:3378574/149‑1 (MQ=255) aGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTac < 2:2417391/149‑1 (MQ=255) ttATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGt < 1:701857/149‑1 (MQ=255) ttATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCAGTTTAAATTATTTCGCTCCACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGt > 1:3834294/1‑149 (MQ=255) tGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTAc < 2:1237866/149‑1 (MQ=255) tGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCa < 1:2024944/149‑1 (MQ=255) tGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCa < 1:3978678/149‑1 (MQ=255) ggACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCAt < 1:3191862/149‑1 (MQ=255) tttttCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCATGAAGc < 1:3036539/149‑1 (MQ=255) tttttCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCATGAAGc < 1:979776/149‑1 (MQ=255) tCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCATGAAGCTGAc < 2:598500/149‑1 (MQ=255) tCATTCTCTAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCATGAAGCTGAc < 1:3657695/149‑1 (MQ=255) ctctAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCATGAAGCTGACcatca < 2:3178352/149‑1 (MQ=255) ctctAATATTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCATGAAGCTGACcatca > 1:3137431/1‑149 (MQ=255) tctAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCATGAAGCTGACcatcat < 1:807117/149‑1 (MQ=255) tGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCATGAAGCTGACCATCATTCGAt < 1:2353146/149‑1 (MQ=255) gTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCATGAAGCTGACCATCATTCGAtt > 1:920645/1‑149 (MQ=255) | TTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAATTATTTCGCTACACTGGTTCCACTTTTGTGATTTACACGGGTTACCCATGAAGCTGACCATCATTCGATT > CP009273/3591070‑3591366 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |