| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,635,294 | T→A | 5.3% | L358Q (CTG→CAG) | dtpB → | dipeptide and tripeptide permease B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,635,294 | 0 | T | A | 5.3% | 875.7 / 28.2 | 279 | L358Q (CTG→CAG) | dtpB | dipeptide and tripeptide permease B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (125/139); new base A (4/11); total (129/150) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
TCAACCCGGTCAGCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATTGCTGCCCTG > CP009273/3635147‑3635442 | aCCCGGTCAGCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGc < 1:1059450/149‑1 (MQ=255) aCCCGGTCAGCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGc > 2:3112745/1‑149 (MQ=255) aCCCGGTCAGCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGc > 1:52662/1‑149 (MQ=255) aCCCGGTCAGCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGc < 1:2928819/149‑1 (MQ=255) cccGGTCAGCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCt > 1:2401501/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCttt < 1:2036867/149‑1 (MQ=255) gTCAGCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGAGGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCttttt > 1:2791920/1‑149 (MQ=255) cAGCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGa < 1:3330128/149‑1 (MQ=255) aGCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGAc < 1:1672113/149‑1 (MQ=255) aGCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGAc < 1:1459662/149‑1 (MQ=255) gCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGAcg > 1:1033765/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGAcggcg > 1:1462987/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACggcggc < 2:3867035/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACggcggc < 1:188593/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACggcggc < 1:209185/149‑1 (MQ=255) gcgcTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGc < 1:3275366/149‑1 (MQ=255) gTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGACtgt > 1:2172669/1‑149 (MQ=255) gTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAAtgt > 1:2172140/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGt < 2:960500/149‑1 (MQ=255) gtggtACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGc > 2:3307860/1‑149 (MQ=255) gtACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGa > 2:377199/1‑149 (MQ=255) gtACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGa < 1:3776406/149‑1 (MQ=255) gtACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGa > 2:1873385/1‑149 (MQ=255) aCTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATg > 2:497648/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGcac < 1:3112745/149‑1 (MQ=255) cGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGcac < 2:1206433/149‑1 (MQ=255) cGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGcac < 1:3538001/149‑1 (MQ=255) cGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGcac < 2:3407677/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACaa > 1:943034/1‑149 (MQ=255) cAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAg < 1:3982676/149‑1 (MQ=255) gCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAggg < 2:581769/149‑1 (MQ=255) gCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAggg > 1:1518058/1‑149 (MQ=255) cAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTg < 2:752143/149‑1 (MQ=255) aaTACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAACGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGa < 2:3074092/149‑1 (MQ=255) aaTACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGa < 1:124124/149‑1 (MQ=255) aCTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACAt < 2:868453/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATc > 1:321914/1‑149 (MQ=255) tGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCg > 1:2403998/1‑149 (MQ=255) ggcaggcaTTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGc > 1:3479177/1‑149 (MQ=255) gcaggcaTTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGcc > 1:2697734/1‑149 (MQ=255) caggcaTTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCa < 1:2487904/149‑1 (MQ=255) aggcaTTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCAt < 1:1636404/149‑1 (MQ=255) aggcaTTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCAt > 1:3255289/1‑149 (MQ=255) ggcaTTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATg > 1:148410/1‑149 (MQ=255) gcaTTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATgg < 1:3439668/149‑1 (MQ=255) gcaTTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATgg < 1:1608999/149‑1 (MQ=255) ttACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTa < 2:2558102/149‑1 (MQ=255) ttACACGCATCGTGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTAAGAGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGTTTTGTGGTTTGCTGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTa < 2:1805107/149‑1 (MQ=255) acGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCAGGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGACTGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGt > 2:790935/1‑149 (MQ=255) gCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGc < 2:3731703/149‑1 (MQ=255) cATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCt < 2:1462987/149‑1 (MQ=255) cATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCt < 2:3507303/149‑1 (MQ=255) tCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTgg > 1:3874602/1‑149 (MQ=255) ggTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTa > 2:1374493/1‑149 (MQ=255) gTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTAc < 1:2635069/149‑1 (MQ=255) gTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTAGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTAc < 1:791720/149‑1 (MQ=255) cAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTAt > 1:754402/1‑149 (MQ=255) cAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTAt < 1:222228/149‑1 (MQ=255) cAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTAt > 1:246548/1‑149 (MQ=255) aaaGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTAtt < 1:1027826/149‑1 (MQ=255) aaaGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTAtt > 2:3695556/1‑149 (MQ=255) aaaGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTAtt < 1:3668800/149‑1 (MQ=255) aaaGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTAtt < 1:394783/149‑1 (MQ=255) aaGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTc > 2:3912669/1‑149 (MQ=255) aaGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTc < 1:1746570/149‑1 (MQ=255) aaGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTc > 1:2621800/1‑149 (MQ=255) gCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCag > 1:3005658/1‑149 (MQ=255) cAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCaga < 1:3700344/149‑1 (MQ=255) aaGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGACTGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGc > 2:2902513/1‑149 (MQ=255) aaGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGc > 2:845109/1‑149 (MQ=255) aaGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGc > 2:142414/1‑149 (MQ=255) aCCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTa > 2:2432798/1‑149 (MQ=255) ctctCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAgg > 1:1376754/1‑149 (MQ=255) tGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTg > 2:1543980/1‑149 (MQ=255) tGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTg > 2:1633080/1‑149 (MQ=255) tGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACAGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTg > 2:1742774/1‑149 (MQ=255) gCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGt < 2:2627146/149‑1 (MQ=255) aTGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTttat > 2:3466605/1‑149 (MQ=255) gAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTttatta > 1:249165/1‑149 (MQ=255) gAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTttatta > 2:2435631/1‑149 (MQ=255) aTTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAgcg > 2:2600887/1‑149 (MQ=255) tttACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAgcgc > 1:1575681/1‑149 (MQ=255) cGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGcc < 1:2628173/149‑1 (MQ=255) ggCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCt > 1:3225619/1‑149 (MQ=255) ggCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCt < 2:1382272/149‑1 (MQ=255) cATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCGGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTgg > 2:672944/1‑149 (MQ=255) aTGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGc < 2:35340/149‑1 (MQ=255) gTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCga < 1:2425025/149‑1 (MQ=255) gtgCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATtg > 1:1973892/1‑149 (MQ=255) tgCTCACAGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATtgc < 2:3384772/149‑1 (MQ=255) tgCTCACAGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATtgc < 2:363852/149‑1 (MQ=255) gCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATtgct < 1:4098642/149‑1 (MQ=255) cTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATtgctg > 2:1261041/1‑149 (MQ=255) cACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATTGCTGcc > 2:3270692/1‑149 (MQ=255) aCTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATTGCTGccc < 2:2670275/149‑1 (MQ=255) aCTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATTGCTGccc < 1:237179/149‑1 (MQ=255) cTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATTGCTGCCCt > 1:1114293/1‑149 (MQ=255) cTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATTGCTGCCCt < 1:3583696/149‑1 (MQ=255) cTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATTGCTGCCCt > 1:1955668/1‑149 (MQ=255) tGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATTGCTGCCCTg < 2:2287890/149‑1 (MQ=255) | TCAACCCGGTCAGCTTCCAGGCGCTTAACCCGTTCTGGGTGGTACTCGCCAGCCCAATACTGGCAGGCATTTACACGCATCTGGGTAACAAAGGCAAAGACCTCTCGATGCCGATGAAATTTACTCTCGGCATGTTTATGTGCTCACTGGGCTTTTTGACGGCGGCAGCTGCGGGAATGTGGTTTGCGGATGCACAAGGGCTGACATCGCCATGGTTTATCGTGCTGGTGTACTTATTCCAGAGCTTAGGTGAACTGTTTATTAGCGCCCTTGGCCTGGCGATGATTGCTGCCCTG > CP009273/3635147‑3635442 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |