| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,727,972 | T→A | 45.1% | L298* (TTA→TAA) | xylH → | D‑xylose ABC transporter permease subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,727,972 | 0 | T | A | 45.1% | 84.6 / inf | 226 | L298* (TTA→TAA) | xylH | D‑xylose ABC transporter permease subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (76/48); new base A (53/49); total (129/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
GTTGCTGTTACTCGGCGGAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGTTGCCGGA > CP009273/3727826‑3728117 | gTTGCTGTTACTCGGCGGAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTaa < 2:4108890/149‑1 (MQ=255) gCTGTTACTCGGCGGAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATgg < 2:2198355/149‑1 (MQ=255) gCTGTTACTCGGCGGAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATgg < 1:1541946/149‑1 (MQ=255) gCTGTTACTCGGCGGAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATgg < 2:823058/149‑1 (MQ=255) tGTTACTCGGCGGAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTa > 2:2035767/1‑149 (MQ=255) gTTACTCGGCGGAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAg < 2:3553204/149‑1 (MQ=255) ttACTCGGCGGAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGc < 2:3062911/149‑1 (MQ=255) ttACTCGGCGGAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGc > 1:2145710/1‑149 (MQ=255) ggcggAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGc < 1:1577202/149‑1 (MQ=255) gcggAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGcc < 2:2974771/149‑1 (MQ=255) gcggAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAAAGGTAGCCATCGcc > 2:1104447/1‑149 (MQ=255) ggAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCgg > 2:2760955/1‑149 (MQ=255) gAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGa < 2:4071909/149‑1 (MQ=255) aTGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGAtt > 1:4111102/1‑149 (MQ=255) aTGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGAtt > 1:3589023/1‑149 (MQ=255) tGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTa > 1:195670/1‑149 (MQ=255) tATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATcc > 2:2517869/1‑149 (MQ=255) tATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATcc > 2:2585017/1‑149 (MQ=255) aTGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCt > 2:2567708/1‑149 (MQ=255) aTGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCt > 1:1034803/1‑149 (MQ=255) tGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCtt > 2:3115848/1‑149 (MQ=255) aCGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTtc < 1:2436240/149‑1 (MQ=255) aCGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTtc < 1:2436276/149‑1 (MQ=255) gcgGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTtctc < 2:3492774/149‑1 (MQ=255) aCGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACt > 1:16674/1‑149 (MQ=255) cGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACtt < 2:1013087/149‑1 (MQ=255) cGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACtt < 1:309316/149‑1 (MQ=255) gCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTgg > 1:2276277/1‑149 (MQ=255) tttGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGgcgc > 1:303281/1‑149 (MQ=255) tttGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGgcgc > 2:38991/1‑149 (MQ=255) tttGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCAGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGgcgc < 1:2533905/149‑1 (MQ=255) ggACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCGCGCCGGGATTAACGTTCTAGGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTgg > 1:4034761/1‑149 (MQ=255) cgacgCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTc < 2:104593/149‑1 (MQ=255) acgCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCAc > 2:3036611/1‑149 (MQ=255) acgCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCAc < 2:3354720/149‑1 (MQ=255) gCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCt > 1:3120755/1‑149 (MQ=255) gCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCt < 2:2236728/149‑1 (MQ=255) aTTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTc > 1:3006801/1‑149 (MQ=255) tATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGc < 1:571129/149‑1 (MQ=255) gCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCggg < 2:325895/149‑1 (MQ=255) cATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGaa > 1:349880/1‑149 (MQ=255) cATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGaa < 2:3902819/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGaaa < 2:2328095/149‑1 (MQ=255) cggcggCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTTAACGGACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAata < 1:205170/149‑1 (MQ=255) cggcggCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAata < 2:2631856/149‑1 (MQ=255) ggcggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAatat > 2:829803/1‑149 (MQ=255) ggcggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAatat < 1:38991/149‑1 (MQ=255) ggcggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAatat < 1:39042/149‑1 (MQ=255) gcggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATc < 2:3189323/149‑1 (MQ=255) gcggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATc < 1:2644149/149‑1 (MQ=255) gcggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATc > 2:3719145/1‑149 (MQ=255) ggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGc < 2:1526590/149‑1 (MQ=255) ggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGc < 1:2743901/149‑1 (MQ=255) ggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGc < 1:2823923/149‑1 (MQ=255) gcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGcc > 1:2578695/1‑149 (MQ=255) agcagcACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACg > 2:2450240/1‑149 (MQ=255) gcaCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGACCTGGACGCAAt > 2:2174327/1‑149 (MQ=255) gcaCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAAt > 1:3551207/1‑149 (MQ=255) gcaCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAAt > 2:3190376/1‑149 (MQ=255) caCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAAtt < 1:1995299/149‑1 (MQ=255) aCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTg > 1:1200159/1‑149 (MQ=255) aCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTg > 2:3991058/1‑149 (MQ=255) gTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTgca < 1:2601368/149‑1 (MQ=255) tctctcCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTgcag > 1:2969530/1‑149 (MQ=255) tctcCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCTCCGAACTGGACGCAATTgcagca < 2:2524665/149‑1 (MQ=255) tctcCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTgcagca > 2:2166134/1‑149 (MQ=255) gggATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGt < 2:3945900/149‑1 (MQ=255) gggATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGt < 1:2856021/149‑1 (MQ=255) ggATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTg < 1:960866/149‑1 (MQ=255) gATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGa < 2:2382341/149‑1 (MQ=255) gATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGa > 2:1822347/1‑149 (MQ=255) aTTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATTGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGAt > 2:3314103/1‑149 (MQ=255) aaCGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTgg > 2:3642822/1‑149 (MQ=255) aCGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTggc > 2:3281168/1‑149 (MQ=255) aCGGTGAACGCACCAAACTTGCCGGGTTCGCGATTACCGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGCTTCACCTTCTGCGGGAAAGATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTggc < 1:697117/149‑1 (MQ=255) ttGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTggcggc > 1:1888367/1‑149 (MQ=255) aaCGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCAcc > 1:2490040/1‑149 (MQ=255) cACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGcc < 1:1514294/149‑1 (MQ=255) cACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGcc < 1:1303312/149‑1 (MQ=255) aaaCTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCctggc > 1:3392362/1‑149 (MQ=255) aaCTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCctggct > 1:1496458/1‑149 (MQ=255) aaCTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCctggct > 2:555644/1‑149 (MQ=255) ttGCCGTGTTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGACATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCtggctggc > 1:3644525/1‑149 (MQ=255) cGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGgtg > 2:3581909/1‑149 (MQ=255) tgtTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGtgtg > 2:424482/1‑149 (MQ=255) tgtTCGCGATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGtgtg > 1:3440293/1‑149 (MQ=255) gtTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTgg > 1:2416377/1‑149 (MQ=255) cgcgATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGaa < 2:16674/149‑1 (MQ=255) gATTAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGCTTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAcgcg > 2:942105/1‑149 (MQ=255) ttAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGtt < 2:3787761/149‑1 (MQ=255) ttAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGtt < 2:3849145/149‑1 (MQ=255) ttAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGtt < 2:3840487/149‑1 (MQ=255) ttAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGtt > 1:3794559/1‑149 (MQ=255) ttAACGGATAAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGtt > 1:1246354/1‑149 (MQ=255) tAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGTTg > 2:3424530/1‑149 (MQ=255) aaCGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGTTGc > 1:101237/1‑149 (MQ=255) aaCGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGTTGc > 2:558830/1‑149 (MQ=255) aCGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGTTGcc < 2:1890480/149‑1 (MQ=255) cGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGTTGCCg > 2:1423635/1‑149 (MQ=255) cGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGTTGCCg > 2:1982814/1‑149 (MQ=255) | GTTGCTGTTACTCGGCGGAATGTTTATGGCAACGCGGACGGCATTTGGACGACGCATTTATGCCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGATTGGCGGCACCAGCCTGGCTGGCGGTGTGGGAAGCGTTGCCGGA > CP009273/3727826‑3728117 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |