Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,932,241 | G→T | 5.7% | D219Y (GAT→TAT) | rbsR → | transcriptional repressor of ribose metabolism |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,932,241 | 0 | G | T | 5.7% | 967.9 / 19.8 | 276 | D219Y (GAT→TAT) | rbsR | transcriptional repressor of ribose metabolism |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (135/123); new base T (4/14); total (139/137) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.50e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
ATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATA > CP009273/3932096‑3932388 | atatCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTTAtt < 2:1271172/149‑1 (MQ=255) atatCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGAtt > 2:1936642/1‑149 (MQ=255) atCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGAtttt > 1:296309/1‑149 (MQ=255) atCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGAtttt < 2:1682893/149‑1 (MQ=255) gATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAAt < 2:744988/149‑1 (MQ=255) gATCGATAAAGGTAATACCCGTATCGACTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCGGCGGTTGGAAGGTAATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAAt > 1:2897678/1‑149 (MQ=255) aTCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAAtt > 1:958526/1‑149 (MQ=255) aTCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAAtt > 2:3131816/1‑149 (MQ=255) tCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAAttt > 2:3862895/1‑149 (MQ=255) gATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTaa > 2:2015911/1‑149 (MQ=255) gATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTaa > 1:850478/1‑149 (MQ=255) tAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAAcg > 2:2972935/1‑149 (MQ=255) aaaGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAAcgg > 1:1699198/1‑149 (MQ=255) aaaGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAAcgg > 2:1583295/1‑149 (MQ=255) aaaGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAAcgg > 2:3989983/1‑149 (MQ=255) aaGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAAcggc < 2:3085939/149‑1 (MQ=255) aaGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAAcggc < 1:939950/149‑1 (MQ=255) cATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGtt < 1:153209/149‑1 (MQ=255) aTACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAAGGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGATGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGttt < 2:1058150/149‑1 (MQ=255) tACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTg > 1:577519/1‑149 (MQ=255) aCCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGa < 2:2256333/149‑1 (MQ=255) cGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGc < 1:688347/149‑1 (MQ=255) cGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGc > 1:2451750/1‑149 (MQ=255) cGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGc < 1:2725792/149‑1 (MQ=255) cGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGc > 1:3095291/1‑149 (MQ=255) cGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATgc > 2:696385/1‑149 (MQ=255) cTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGcc < 2:1599908/149‑1 (MQ=255) cTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGcc < 1:3638114/149‑1 (MQ=255) tGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCa > 2:3431064/1‑149 (MQ=255) ttACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTg > 1:655759/1‑149 (MQ=255) tACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGc > 1:973980/1‑149 (MQ=255) tACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGc > 1:1990979/1‑149 (MQ=255) tACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGc > 1:336029/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCt > 1:1392421/1‑149 (MQ=255) ccGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTa < 2:3372975/149‑1 (MQ=255) ggCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATc < 1:1033272/149‑1 (MQ=255) ggCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATc > 2:459294/1‑149 (MQ=255) ggCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATc > 1:3830722/1‑149 (MQ=255) ggCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTAGGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATc > 2:1174835/1‑149 (MQ=255) gCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTTATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATca > 2:687662/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATcaca < 2:1433588/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATcaca < 2:1432855/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATcaca > 2:1245148/1‑149 (MQ=255) gCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATc < 1:3260008/149‑1 (MQ=255) tGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCg > 1:3788742/1‑149 (MQ=255) gATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCt < 1:3595534/149‑1 (MQ=255) aTAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTg > 1:3289381/1‑149 (MQ=255) tAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGc < 2:3190622/149‑1 (MQ=255) tAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGc > 2:529575/1‑149 (MQ=255) aaaaCTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTCACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCg < 1:4006841/149‑1 (MQ=255) aaCTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTc < 2:2345801/149‑1 (MQ=255) aCTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGAGGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTcc < 1:426768/149‑1 (MQ=255) tCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTc < 1:3707364/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCa > 1:3197957/1‑149 (MQ=255) cgcgcCTGCGGTTGGAAGGTTATGGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTTATTTTGAATTTCACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGcc < 1:925277/149‑1 (MQ=255) gcCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTc < 2:1764140/149‑1 (MQ=255) ttGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCgg > 1:2495943/1‑149 (MQ=255) aTCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCt > 2:4069303/1‑149 (MQ=255) tCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTa < 1:2277535/149‑1 (MQ=255) ggggCGGCGATTAAACGTGCGGGTCTCAAAATTCCTGATGGATATTAAGTCACTGGTTATTTTTATTTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTAt < 1:1056113/148‑1 (MQ=255) cggcgATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCt < 1:2361477/149‑1 (MQ=255) cgATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGtt < 2:2691604/149‑1 (MQ=255) tGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGc > 1:3391445/1‑149 (MQ=255) tGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGc > 2:842601/1‑149 (MQ=255) tGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGc > 1:1343474/1‑149 (MQ=255) aaaCGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGt < 2:3719563/149‑1 (MQ=255) aaaCGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGt > 2:3061508/1‑149 (MQ=255) aaCGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGtt > 1:1949727/1‑149 (MQ=255) cGTGCGGGTCTCAACATTCCTTTTTGCTATGATGTCAGTTGTGATTTTTAATTTAACTGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTa < 2:2757489/149‑1 (MQ=255) gTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAc > 1:2299282/1‑149 (MQ=255) gggTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAgg > 1:2668825/1‑149 (MQ=255) ctcAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGtt > 2:300139/1‑149 (MQ=255) ctcAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGtt > 2:299316/1‑149 (MQ=255) tcAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTCCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAACTGACGCTCTGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTta > 2:2113220/1‑149 (MQ=255) aaCATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTtata > 1:3682113/1‑149 (MQ=255) aTTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTCACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCa < 1:2860280/149‑1 (MQ=255) tCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAgg > 1:1774012/1‑149 (MQ=255) tGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCag > 2:2041525/1‑149 (MQ=255) gATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCaga > 1:473619/1‑149 (MQ=255) tGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGt > 2:938386/1‑149 (MQ=255) ggCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGtt < 1:192005/149‑1 (MQ=255) gCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTa < 1:459294/149‑1 (MQ=255) aTGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAg > 1:1000707/1‑149 (MQ=255) aaGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCCGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAgggt > 1:1158/1‑147 (MQ=255) aaGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGtt > 1:1995477/1‑149 (MQ=255) aaGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGtt < 1:820994/149‑1 (MQ=255) aGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTc < 2:1699198/149‑1 (MQ=255) gTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCATAGTTACAGGTTcc > 1:2106533/1‑149 (MQ=255) gTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTcc < 1:3894864/149‑1 (MQ=255) cACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGc > 2:2639014/1‑149 (MQ=255) cACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGc > 1:2400423/1‑149 (MQ=255) cTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGTCAGTCTTTACCGGATATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAg < 2:2624552/149‑1 (MQ=255) cTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAg < 1:1450108/149‑1 (MQ=255) cTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAg < 2:2386133/149‑1 (MQ=255) tGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAgg < 1:1472327/149‑1 (MQ=255) ggTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGa < 2:3289381/149‑1 (MQ=255) ggTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGa < 2:2519311/149‑1 (MQ=255) gTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGat < 2:655759/149‑1 (MQ=255) gTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGat < 2:2127364/149‑1 (MQ=255) tGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGata < 2:1164106/149‑1 (MQ=255) | ATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATA > CP009273/3932096‑3932388 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |