| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,037,484 | T→A | 100% | intergenic (+80/‑75) | dsbA → / → yihF | periplasmic protein disulfide isomerase I/DUF945 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,037,484 | 0 | T | A | 100.0% | 537.4 / ‑6.7 | 167 | intergenic (+80/‑75) | dsbA/yihF | periplasmic protein disulfide isomerase I/DUF945 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (108/58); minor base C (0/1); total (108/59) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
CAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACAC > CP009273/4037338‑4037629 | gCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCAt > 1:528849/1‑149 (MQ=255) atatGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCt < 2:1197028/149‑1 (MQ=255) atGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGc > 2:3513334/1‑149 (MQ=255) tGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGcc < 1:1594294/149‑1 (MQ=255) gATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGc < 2:956876/149‑1 (MQ=255) gATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTATGATAAAGCATCCTGCCGc > 1:2437580/1‑149 (MQ=255) tGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTg > 1:3829637/1‑149 (MQ=255) tttttGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATCATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGa > 2:3293365/1‑149 (MQ=255) tttttGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGa > 1:3031701/1‑149 (MQ=255) tttGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACa < 2:1330384/149‑1 (MQ=255) ttGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACat < 1:61282/149‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACatt < 1:1399688/149‑1 (MQ=255) tGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACatt < 1:86673/149‑1 (MQ=255) gTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACatta > 2:1737808/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACatta < 1:1159892/149‑1 (MQ=255) gTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTAACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACatta > 2:1176218/1‑149 (MQ=255) cagTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAg < 2:3555889/149‑1 (MQ=255) gTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCTGCa > 2:1973891/1‑149 (MQ=255) tGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATaa < 1:414047/149‑1 (MQ=255) aTACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGa < 1:460265/149‑1 (MQ=255) aGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATAtt > 2:119057/1‑149 (MQ=255) aaaTATCTGTCAGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCaaa < 1:2149901/149‑1 (MQ=255) aaTATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATACGTGGATATTCAAAg > 2:1685468/1‑149 (MQ=255) aaTATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAg > 2:1202513/1‑149 (MQ=255) tatatttCCTAGAAAAAATAATTAAATTTAAATTAAATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGtt < 2:3963105/143‑1 (MQ=255) tatCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGtt > 1:839947/1‑149 (MQ=255) tatCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGtt > 2:2927789/1‑149 (MQ=255) atCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGttt < 1:1804790/149‑1 (MQ=255) atCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGttt < 2:707540/149‑1 (MQ=255) tCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTAAGCATAAGTGGATATTCAAAGtttt > 2:2261166/1‑149 (MQ=255) tGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGc > 2:2444449/1‑149 (MQ=255) gTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCt > 2:514469/1‑149 (MQ=255) gagaAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGttt < 2:3031701/149‑1 (MQ=255) gaAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTa < 2:1198177/149‑1 (MQ=255) gaAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACAATCTGATAAAGCATCCTGCCGATGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTa > 2:2417589/1‑149 (MQ=255) aaaaaaTAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTAt > 2:3692883/1‑149 (MQ=255) aataatTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAgg < 1:3498777/149‑1 (MQ=255) aatTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAATGTTTTGCTGTTTTATCCGGGaa > 2:756057/1‑149 (MQ=255) aatTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGaa > 1:1002216/1‑149 (MQ=255) aatTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCGGTTGTATCAGGGaa > 2:3274405/1‑149 (MQ=255) tCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAatat < 2:467090/149‑1 (MQ=255) aTGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTta > 2:3123858/1‑149 (MQ=255) aTGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTta > 2:3124318/1‑149 (MQ=255) aTGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGGTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTta > 2:1106255/1‑149 (MQ=255) gTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTtata < 1:1737808/149‑1 (MQ=255) tAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACCTTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATGAGGGAATATTTatat > 1:2489356/1‑149 (MQ=255) aaTTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAACGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGa < 2:1000082/149‑1 (MQ=255) aaTTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATAAATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCGGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAATTTTTGCTGTTTTTTGAGGGAATATTTATTTgt > 1:369415/1‑148 (MQ=255) aGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAATGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTc > 2:3857840/1‑149 (MQ=255) aGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCGGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTTCTGTTTTATGAGGGAATATTTATATGATACGTAAGta > 1:62037/1‑148 (MQ=255) ccGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGc < 2:672917/149‑1 (MQ=255) gTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTa > 2:1130242/1‑149 (MQ=255) tGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTAc > 1:3010258/1‑149 (MQ=255) tGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATAAGTAAGTCAGCTAc > 2:1561565/1‑149 (MQ=255) gAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACa > 2:835180/1‑149 (MQ=255) atatTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAgg > 2:2336303/1‑149 (MQ=255) atatTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAgg < 1:3940881/149‑1 (MQ=255) atatTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAgg > 2:4083059/1‑149 (MQ=255) tatTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGgt > 2:1945801/1‑149 (MQ=255) tatTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGgt > 2:1115472/1‑149 (MQ=255) atTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGgtg > 2:794589/1‑149 (MQ=255) aCGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATAAATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTAAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTAAAGGTGTTAt > 1:3254624/1‑149 (MQ=255) gggCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTAttg < 2:1372374/149‑1 (MQ=255) gggCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTAttg < 2:3422052/149‑1 (MQ=255) gggCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTAttg < 2:508634/149‑1 (MQ=255) gCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTAttgtt > 1:1080713/1‑149 (MQ=255) gCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTAttgtt > 1:3140646/1‑149 (MQ=255) cTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTAttgttg < 1:1008416/149‑1 (MQ=255) cTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTAttgttg > 2:3424139/1‑149 (MQ=255) tttttATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGt > 1:2745139/1‑149 (MQ=255) tttttATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGt > 1:2900239/1‑149 (MQ=255) tttttATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGt > 1:683757/1‑149 (MQ=255) tttATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTa < 2:2403731/149‑1 (MQ=255) ttattaTTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAg < 2:2905661/149‑1 (MQ=255) tattatTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGc < 2:839947/149‑1 (MQ=255) tattatTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGc > 2:2427449/1‑149 (MQ=255) tattatTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGc > 2:1430980/1‑149 (MQ=255) attattTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGcc > 1:3612876/1‑149 (MQ=255) attattTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGcc > 1:115850/1‑149 (MQ=255) attattTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGcc > 2:2875765/1‑149 (MQ=255) ttattTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCg > 2:2556381/1‑149 (MQ=255) ttattTAATAAATATAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCg > 2:2556039/1‑149 (MQ=255) aataaataTAAATACATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCt > 1:620688/1‑149 (MQ=255) taaatataaataCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTgg > 1:1449105/1‑149 (MQ=255) aaatataaataCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTggg > 2:16721/1‑149 (MQ=255) aaatataaataCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTggg > 2:4036090/1‑149 (MQ=255) aatataaataCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTgggg > 2:2100466/1‑149 (MQ=255) atataaataCCGTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATACGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGggt < 1:2155443/149‑1 (MQ=255) atataaataCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGggt > 2:1584889/1‑149 (MQ=255) aataCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGtggtgg < 1:1407052/149‑1 (MQ=255) taCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGca > 1:2418897/1‑149 (MQ=255) aCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGcac > 1:2025917/1‑149 (MQ=255) aCATTCTGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGcac > 1:1867029/1‑149 (MQ=255) tGATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTa > 1:1592216/1‑149 (MQ=255) gATAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTac > 1:1282330/1‑149 (MQ=255) aTAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTaca > 2:803431/1‑149 (MQ=255) tAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCCCATGGTacac > 2:3645151/1‑149 (MQ=255) tAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTacac > 2:1317233/1‑149 (MQ=255) tAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTacac > 1:2957237/1‑149 (MQ=255) tAAAGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTacac > 2:129542/1‑149 (MQ=255) | CAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGATACGTAAGTCAGCTACAGGTGTTATTGTTGCGTTAGCCGTAATCTGGGGTGGTGGCACATGGTACAC > CP009273/4037338‑4037629 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |