| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,163,117 | T→A | 37.8% | I36I (ATT→ATA) | birA → | bifunctional biotin‑[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase/ DNA‑binding transcriptional repressor, bio‑5'‑AMP‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,163,117 | 0 | T | A | 37.8% | 208.4 / 269.1 | 222 | I36I (ATT→ATA) | birA | bifunctional biotin‑[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase/ DNA‑binding transcriptional repressor, bio‑5'‑AMP‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (74/64); new base A (49/35); total (123/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.01e-01 | |||||||||||
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
ATTGGTGCATCAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAGTGTAGCCGTGCTGCCAG > CP009273/4162969‑4163265 | tGGTGCATCAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATtaa < 2:2938860/149‑1 (MQ=255) tGCATCAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATtaataa < 2:3237031/149‑1 (MQ=255) gCATCAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATaaa < 1:3151029/149‑1 (MQ=255) tCAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAacac < 1:243440/149‑1 (MQ=255) cAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAAcaca < 2:3324295/149‑1 (MQ=255) ggTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACAtt < 2:1380183/149‑1 (MQ=255) gTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGaca < 1:1740282/149‑1 (MQ=255) tGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGacac > 2:3123359/1‑149 (MQ=255) aGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTg < 1:1785560/149‑1 (MQ=255) aGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGa < 1:157001/149‑1 (MQ=255) aCAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGc > 1:1248941/1‑149 (MQ=255) aaTTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGt > 2:182419/1‑149 (MQ=255) ttCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGTGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGa < 2:103645/149‑1 (MQ=255) ttCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGa < 1:252816/149‑1 (MQ=255) aTGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGt > 2:3621755/1‑149 (MQ=255) aTGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGt > 2:3753069/1‑149 (MQ=255) tGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTc < 2:3977362/149‑1 (MQ=255) tGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTc > 2:1638488/1‑149 (MQ=255) tGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTc > 1:3654427/1‑149 (MQ=255) gAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCt > 2:2299413/1‑149 (MQ=255) gAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCt < 2:3694868/149‑1 (MQ=255) aaGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCtt > 1:814267/1‑149 (MQ=255) aaGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCtt > 1:2871929/1‑149 (MQ=255) ggATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTa > 1:1655027/1‑149 (MQ=255) aaCACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGt > 1:4089805/1‑149 (MQ=255) acacCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGtt > 1:234296/1‑149 (MQ=255) acacCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGtt > 1:1460513/1‑149 (MQ=255) ccGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCg > 1:548884/1‑149 (MQ=255) ccGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCg > 2:2483143/1‑149 (MQ=255) ccGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCg > 1:1171940/1‑149 (MQ=255) gTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCggg < 1:1162825/149‑1 (MQ=255) gAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGAt < 2:1098202/149‑1 (MQ=255) aaaTTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATa < 1:2352483/149‑1 (MQ=255) aaTTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATAc < 2:3692245/149‑1 (MQ=255) attgattgCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACa > 2:182160/1‑149 (MQ=255) attgattgCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACa > 1:2694166/1‑149 (MQ=255) gattgCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAgcc > 2:2617279/1‑149 (MQ=255) ttgCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCCGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAgcctg > 2:2414228/1‑149 (MQ=255) ttgCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAgcctg > 2:2691738/1‑149 (MQ=255) gCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAgcctgcc > 1:3417286/1‑149 (MQ=255) gCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAgcctgcc < 2:1958318/149‑1 (MQ=255) cccTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAgcctgcct > 2:126259/1‑149 (MQ=255) cTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGa > 1:1386035/1‑149 (MQ=255) cTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGa > 2:1488641/1‑149 (MQ=255) cTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGa > 1:2768730/1‑149 (MQ=255) tGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAg < 1:2251832/149‑1 (MQ=255) gTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGc < 1:1400462/149‑1 (MQ=255) ttAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGCAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACCTTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGcc < 1:3271552/149‑1 (MQ=255) tAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCt > 1:532186/1‑149 (MQ=255) gCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTGGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTAt > 2:3650991/1‑149 (MQ=255) gCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTAt < 1:3727467/149‑1 (MQ=255) gCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTAt > 2:2517587/1‑149 (MQ=255) cGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATc < 2:2684739/149‑1 (MQ=255) gAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATcc < 1:1296088/149‑1 (MQ=255) aaCGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCa > 2:2245892/1‑149 (MQ=255) aaCGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCa < 1:3210034/149‑1 (MQ=255) aCGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAg > 1:1406555/1‑149 (MQ=255) aCGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAg > 1:1777766/1‑149 (MQ=255) ggTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGtt > 2:382527/1‑149 (MQ=255) ggTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGtt < 1:3372493/149‑1 (MQ=255) ggTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGtt > 2:2590696/1‑149 (MQ=255) tGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTAc < 1:163350/149‑1 (MQ=255) tGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTAc < 1:2236080/149‑1 (MQ=255) tGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTAc < 1:3504097/149‑1 (MQ=255) gAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACt > 2:433435/1‑149 (MQ=255) aaTTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACAGCGTGACTGGGGCGTTGATGTATTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACATCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACtt > 2:1802801/1‑149 (MQ=255) tttCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTaa < 1:847021/149‑1 (MQ=255) tttCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTaa < 1:847969/149‑1 (MQ=255) tCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAAt < 2:96262/148‑1 (MQ=255) tCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAAt > 1:96262/1‑148 (MQ=255) cACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGc > 1:3910160/1‑149 (MQ=255) aCTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCt > 2:737751/1‑149 (MQ=255) tctGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTaa > 2:2959254/1‑149 (MQ=255) tctGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTaa < 1:641174/149‑1 (MQ=255) tctGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGAGGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTaa > 2:3674283/1‑149 (MQ=255) ctGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTaaa < 1:2470946/149‑1 (MQ=255) cGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGa < 1:3823334/149‑1 (MQ=255) gCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGatat < 2:4089805/149‑1 (MQ=255) gTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTgg < 1:45036/149‑1 (MQ=255) ttGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTggg > 1:2058482/1‑149 (MQ=255) ttGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTggg > 1:4091939/1‑149 (MQ=255) gggTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTc < 1:1509958/149‑1 (MQ=255) gTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAg > 2:167862/1‑149 (MQ=255) gTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAg > 2:3507989/1‑149 (MQ=255) tGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGc < 1:2331492/149‑1 (MQ=255) aaaCGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTg > 2:2854213/1‑149 (MQ=255) aaCGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTgg < 2:1757714/149‑1 (MQ=255) aaCGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTgg > 2:674185/1‑149 (MQ=255) gCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATg > 2:2186470/1‑149 (MQ=255) gCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATg > 2:2558373/1‑149 (MQ=255) gggAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCg > 1:3684431/1‑149 (MQ=255) gggAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCg > 1:3034235/1‑149 (MQ=255) gAATGAGCCGGGCGGCTATAAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGt < 2:2280275/149‑1 (MQ=255) aTGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAg > 2:1328344/1‑149 (MQ=255) aTGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAg > 2:2021682/1‑149 (MQ=255) aTGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAg > 1:1444777/1‑149 (MQ=255) gAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAgtg < 2:1889758/149‑1 (MQ=255) aGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAgtgt < 1:3252332/149‑1 (MQ=255) taataaACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAGTGTAGCCGTGCTGCCAg > 2:3710748/1‑149 (MQ=255) taataaACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAGTGTAGCCGTGCTGCCAg > 2:2081289/1‑149 (MQ=255) | ATTGGTGCATCAGGTGAAGTGAGCGCAGTGGAGACAATTTCATGAAGGATAACACCGTGCCACTGAAATTGATTGCCCTGTTAGCGAACGGTGAATTTCACTCTGGCGAGCAGTTGGGTGAAACGCTGGGAATGAGCCGGGCGGCTATTAATAAACACATTCAGACACTGCGTGACTGGGGCGTTGATGTCTTTACCGTTCCGGGTAAAGGATACAGCCTGCCTGAGCCTATCCAGTTACTTAATGCTAAACAGATATTGGGTCAGCTGGATGGCGGTAGTGTAGCCGTGCTGCCAG > CP009273/4162969‑4163265 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |