Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 743,797 | G→T | 100% | R214R (CGC→CGA) | ybgO ← | putative fimbrial protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 743,797 | 0 | G | T | 98.5% | 636.3 / 0.5 | 200 | R214R (CGC→CGA) | ybgO | putative fimbrial protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base T (105/90); total (108/92) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
TGCATTGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACGCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACTTTGATAATCATGCGGCGGCATTTCTCGTATTTTGA > CP009273/743652‑743942 | tGCATTGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTTGGTGGCGGCGTATATCCAGCAAAATAAAATTAACAAAAACAAAAACCTGTGTTTACGGTGAAAAGGAAAAAATTAAGCAGCAAACCAGCACACGa > 1:3098721/1‑149 (MQ=255) gCATTGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGaa < 2:52519/149‑1 (MQ=255) gCATTGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAAAGTTTTAGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATAAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGTAAACATTGAAGCTGCAATCCAGCACTCGaa > 2:2756985/1‑149 (MQ=255) cATTGATCGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAAt < 2:499620/149‑1 (MQ=255) cGTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAACTTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTcc < 1:81454/149‑1 (MQ=255) gTTTTGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCa < 1:1041698/149‑1 (MQ=255) ttGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGAc < 1:73201/149‑1 (MQ=255) ttGGCTCTTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGAc < 2:1720364/149‑1 (MQ=255) tctTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAAACACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTa > 1:951914/1‑149 (MQ=255) ctTGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTaa < 1:1625862/149‑1 (MQ=255) ttGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAat < 1:3148001/149‑1 (MQ=255) ttGGTCGTTTTAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACACGAATGTTTTCCAGACCAGTAat > 2:1598906/1‑149 (MQ=255) ttttAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGatat > 2:523143/1‑149 (MQ=255) tttAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATAtt > 1:153539/1‑149 (MQ=255) tttAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATAtt < 1:1464618/149‑1 (MQ=255) ttAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATAttt < 1:3399114/149‑1 (MQ=255) ttAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATAttt > 2:660525/1‑149 (MQ=255) ttAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATAttt < 2:219707/149‑1 (MQ=255) tAATACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTc > 2:3371309/1‑149 (MQ=255) aaTACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCa > 1:621990/1‑149 (MQ=255) aaTACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCa < 2:1901086/149‑1 (MQ=255) aTACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAg < 1:3005405/149‑1 (MQ=255) aTACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAg < 2:778331/149‑1 (MQ=255) aTACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAg > 1:1814587/1‑149 (MQ=255) tACTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAgg > 2:918914/1‑149 (MQ=255) aCTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGt < 1:3940742/149‑1 (MQ=255) cTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCACTCAACTGTGTTTCCTGTGATATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGtt < 1:2093765/149‑1 (MQ=255) cTGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGtt > 2:1119341/1‑149 (MQ=255) tGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGttt > 1:1453194/1‑149 (MQ=255) tGAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGttt > 1:3543761/1‑149 (MQ=255) tGAACGATTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGttt < 2:1733234/149‑1 (MQ=255) gAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGtttt > 2:2702745/1‑149 (MQ=255) gAACGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGtttt > 1:3473350/1‑149 (MQ=255) cGTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTggg > 1:1824055/1‑149 (MQ=255) gTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGc > 2:1802622/1‑149 (MQ=255) gTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGc < 2:1228478/149‑1 (MQ=255) gTTTTCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGc > 2:3042037/1‑149 (MQ=255) ttttCGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCa < 1:1791157/149‑1 (MQ=255) cGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAg > 1:1859595/1‑149 (MQ=255) cGACATTGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAg > 1:2822331/1‑149 (MQ=255) ttGTGTGGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCACTCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCt < 2:1159122/149‑1 (MQ=255) gtgGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTCTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGt < 1:3092468/149‑1 (MQ=255) tgGCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGtt < 1:2956739/149‑1 (MQ=255) ggCGACGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTa > 2:4026434/1‑149 (MQ=255) cGTATATCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCt > 1:1203054/1‑149 (MQ=255) tataTCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTAc > 1:3351381/1‑149 (MQ=255) atatCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTAcc > 1:562762/1‑149 (MQ=255) tatCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCg > 1:743659/1‑149 (MQ=255) tatCCAGCAAATTAAATTTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCg > 2:1352468/1‑149 (MQ=255) attTACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGc > 2:2003462/1‑149 (MQ=255) ttACCAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCac < 1:1107111/149‑1 (MQ=255) ccAAAATCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCacgac > 1:2293660/1‑149 (MQ=255) ccaaaTCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCacgacg < 2:2286443/147‑1 (MQ=255) aaaTCAATCACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGat > 1:3059742/1‑149 (MQ=255) aaaTCAATCACCTGTGTTAGCGGTCAAATGGAAAAAATGACGCACCAATCGAGCACTCCAATCTTTTCCAGTCCAGTAATATGATATTTCAGGATTAGGGCAGAAGCGTCTTCCTTAACCCTAACGCCACGGACAAATTGCACGACGat > 2:3929648/1‑149 (MQ=255) aatcaatcACCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGata < 2:451395/149‑1 (MQ=255) atcaatcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGatat > 2:584137/1‑149 (MQ=255) atcaatcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGatat > 1:4014675/1‑149 (MQ=255) atcaatcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGatat < 1:2122848/149‑1 (MQ=255) atcaatcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGatat > 2:1676830/1‑149 (MQ=255) tcaatcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACGCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGAtata < 2:2614356/149‑1 (MQ=255) caatcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAg < 1:1371015/149‑1 (MQ=255) caatcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAg < 1:3578734/149‑1 (MQ=255) caatcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCACTAATATGATATTTCAGGTTTTGGTCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGAACGACGATATAg > 2:1415131/1‑149 (MQ=255) atcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTc < 1:3799630/149‑1 (MQ=255) tcaCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCg > 2:2524114/1‑149 (MQ=255) caCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCga < 2:2927862/149‑2 (MQ=255) caCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACGCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGc < 2:2954846/149‑1 (MQ=255) aCCTGTGTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCt < 2:621906/149‑1 (MQ=255) tgtgTTTCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAg > 2:240695/1‑149 (MQ=255) ttCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTAc < 2:3351381/149‑1 (MQ=255) ttCCGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTAc < 2:3782395/149‑1 (MQ=255) ccGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACtt > 2:3463248/1‑149 (MQ=255) cGGTGAAATGGAAAAATTGACGCTGCAATCCAGCACTCGAATGTTTTCCAGACCAGTAATATGATATTTCAGGTTTTGGGCAGTAGGGTCTTCGTTAACGCTACCGGCACCGTCAAATTGCACGACGATATAGTCGCTAAGCGTACttt > 2:1951584/1‑149 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |