Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,207,958 | G→T | 15.4% | intergenic (‑499/+201) | iraM ← / ← ycgX | RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor/DUF1398 family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,207,958 | 0 | G | T | 15.4% | 567.0 / 17.0 | 220 | intergenic (‑499/+201) | iraM/ycgX | RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor/DUF1398 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (65/114); new base T (39/2); total (104/116) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.53e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
AGAATAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCAT > CP009273/1207810‑1208106 | agaATAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGTTTTTATAAATATg > 1:1416293/1‑149 (MQ=255) gaATAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑t < 2:1455849/149‑1 (MQ=255) gaATAAGGCTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑t < 2:633703/149‑1 (MQ=255) aTAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATT‑TTa > 2:3380199/1‑149 (MQ=255) tAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATT‑TTaa > 2:887073/1‑149 (MQ=255) tAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTaa > 2:1341959/1‑149 (MQ=255) aGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTTTTTTTATAAATATG‑TTAAcc > 2:1912531/1‑149 (MQ=255) aGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTTTAAATATT‑TTaaaa > 1:921049/1‑147 (MQ=255) aGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATT‑TTaaac > 1:3982717/1‑147 (MQ=255) aGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGTTTTTATAAATATT‑TTaaac > 1:558157/1‑147 (MQ=255) ggTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAAACg > 1:274640/1‑149 (MQ=255) gTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTTTAAATATT‑TTaaacct > 1:307088/1‑145 (MQ=255) gTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGt < 2:1096380/149‑1 (MQ=255) ttCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACCTGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTta < 1:2246922/149‑1 (MQ=255) aaTTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATaa > 2:623497/1‑149 (MQ=255) tttttGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATT‑TTAACCCTTATaaaa > 1:1986410/1‑149 (MQ=255) tttttGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATaaaa < 2:3795890/149‑1 (MQ=255) tttttGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGTTTTTTTTAAAATG‑TTTAAAGTTATaaaa > 1:1046255/1‑149 (MQ=255) tttgtGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATaaaa < 2:3932301/149‑1 (MQ=255) tttGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCCCGGCCGTGGTTTTTTTAAAAATT‑TTAAACGATATaaaaaa > 1:1051586/1‑147 (MQ=255) tttGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGGTTTTATAAAAATT‑TTAAACGTTATAAAATa > 1:2883334/1‑149 (MQ=255) tGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAAc < 1:2755714/149‑1 (MQ=255) gTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTa < 2:2771602/149‑1 (MQ=255) ttATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTAt < 1:3467056/149‑1 (MQ=255) ttATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGTTTTTTTAAATATG‑TTAAACGTTATAAAATAAAGTAt > 1:2342471/1‑149 (MQ=255) tataGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGGTTTTTTTAATTTT‑TTTAAAGTTTTAAAATAAAGTATCaa > 1:373358/1‑149 (MQ=255) aaTGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCCCGGCCGTTGTTTTTTTAAATATG‑TTTAACGGTTTAAAATAAAGTATCACAAGTCa > 2:17667/1‑149 (MQ=255) aaTGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATAAAAAGTCa > 2:1981091/1‑149 (MQ=255) aaTGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAAACGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCa > 2:2411368/1‑149 (MQ=255) aTGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGTTTTTTTAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATAAAAAGTCaa > 1:3425523/1‑149 (MQ=255) tGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCCCGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAAAGTATCAAAAGTCAAg > 2:555523/1‑149 (MQ=255) gATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGt > 2:504163/1‑149 (MQ=255) gATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGt > 2:3492952/1‑149 (MQ=255) gATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGt < 1:679910/149‑1 (MQ=255) aTTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTg < 2:958081/149‑1 (MQ=255) aTTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTg < 2:327523/149‑1 (MQ=255) tttAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGa < 2:1845242/149‑1 (MQ=255) ttAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGAt < 1:1432068/149‑1 (MQ=255) aCCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATaac > 2:2782982/1‑149 (MQ=255) aCCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTTTCAAAAGTCCAGTGATcac > 2:1217250/1‑149 (MQ=255) aCCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGTTTTTATAAATATG‑TTAAACGTTATAAAAAAAAGTATAAAAAGTAAAGTGAtgaa > 1:4100248/1‑146 (MQ=255) gTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGTTTTTTTTAAAATGTTTAAACG‑TATAAAAAAAAATTTAAAAAGTAAAGGGATGACAatt > 1:1888686/1‑149 (MQ=255) gCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAatat < 1:3559171/149‑1 (MQ=255) aaTACATATAACCGGTTGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGt < 2:709973/149‑1 (MQ=255) aaTACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGTTTTTATAAATATT‑TTAACCGTTATAAAAAAACGGATCAAAAGTCAAGTGATCACAATTAAAATATAAAGt > 2:790454/1‑149 (MQ=255) aTACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGtt < 2:2451611/149‑1 (MQ=255) aCATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGa < 1:64902/149‑1 (MQ=255) tataACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTTTAAATATG‑TTAAACGTTATAAAATAAAGTATCAAAAATAAACTGATAACAATTCAAATATAAAGTTGATAg > 1:298515/1‑149 (MQ=255) tataACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGGTTTTTTAAATAAT‑TTAACCCGTATAAAAAAACGAATCAAAAGTGCAGGGTAGACAATTAAAATATCAAATTGATat > 1:3924799/1‑148 (MQ=255) taACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTa < 2:3486603/149‑1 (MQ=255) taACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTa < 2:1393807/149‑1 (MQ=255) aaCCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAACTGATCACATTTCAAATATAAAGTTGAtattat > 2:2491537/1‑149 (MQ=255) aaCCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGGGTTTATAAATATT‑TTAACCGGTATAAAATAAATGATAAAAATTAACGTGATCACAATTAAAATATCAAGTTGAttttat > 1:655817/1‑144 (MQ=255) aCCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTAtt < 1:2185837/149‑1 (MQ=255) aCCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTAtt > 2:1687867/1‑149 (MQ=255) aCCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTAtt < 1:110387/149‑1 (MQ=255) ccGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTa < 1:3612457/149‑1 (MQ=255) cGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAg < 1:3562680/149‑1 (MQ=255) ggATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGt < 1:1698266/149‑1 (MQ=255) tAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGGTTTTTTAAATATG‑TTAACCGTTATAAAAAAAACTATAAAAATTAAAGTGATCACATTTAAAATATAAAGTTTTTATTATTATTGTGGTGgttt > 1:1227546/1‑148 (MQ=255) aaaCCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTTTAAATATT‑TTAAACGTTATAAAATAACGTATCAAAAATCAAGTGATAACATTTAAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTTGGGattat > 2:1496774/1‑149 (MQ=255) aaaCCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATAAG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATAAAAAGTCAATTGATCACATTTCAAATATCAAGTTTATATTATTAGTCTGGTGattat > 2:3241984/1‑149 (MQ=255) aaaCCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGTTTTTTTAAATATT‑TTAAAAGTTATAAAATAAAAGATAAAAAGTAAAGTTATAAAAATTAAAATATAAAGTTTTTATTATTATTGTTGTGtttat > 1:1945135/1‑149 (MQ=255) aaCCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCCAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGattatt > 2:3411997/1‑149 (MQ=255) aaTACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATggg < 1:2833633/149‑1 (MQ=255) aTACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGt < 1:419252/149‑1 (MQ=255) aCATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGa < 1:2590069/149‑1 (MQ=255) aCATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGa < 1:474170/149‑1 (MQ=255) aCATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGa < 1:512491/149‑1 (MQ=255) tgtgCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACaa < 1:1618083/149‑1 (MQ=255) gtgCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAAt < 2:3201391/149‑1 (MQ=255) ttAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATaaaaa < 2:2350470/149‑1 (MQ=255) aaGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGGATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTATTCTGGTGATTATTTATTGGTTACAATaaaaaaa > 2:3729993/1‑147 (MQ=255) aGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGAc < 2:344685/149‑1 (MQ=255) gTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATAGG‑TTAACCGTTATAAAAAAAAGTATCAAAATTCAAGTGATCACAATTCAAAAATCAAGTTGTAACTATAAGTCTGGTGGATATTTATTGGTGACAAAAAAAAGaaa > 2:1933958/1‑147 (MQ=255) aTTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTGGTTTTTTTAAAAATT‑TTAAACCTTATAAAATAAAGTATAAAAATTAAAGTGATAAAATTTAAAATATAAAATTGATATTATTATTATGGGGATTATTTTTTGGTGACaaaaaaaaaaaact > 1:333838/1‑143 (MQ=255) ttGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTa < 2:2686436/149‑1 (MQ=255) gtgtGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCa < 2:414300/149‑1 (MQ=255) tgtgGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCAt < 2:2750411/149‑1 (MQ=255) tgGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATag < 2:2168246/149‑1 (MQ=255) cGGCCTTTTTTTTTATAAATATT‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATa < 2:3457156/149‑1 (MQ=255) ccGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGtc < 1:614681/149‑1 (MQ=255) ccGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGtc < 1:2234650/149‑1 (MQ=255) ccGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGtc < 1:4053037/149‑1 (MQ=255) ccGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATACATAGAGATAGta > 2:3934479/1‑148 (MQ=255) gttgttTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGtctc < 1:3241984/149‑1 (MQ=255) gttgttTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGtctc < 2:298515/149‑1 (MQ=255) ttgttTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTctct < 2:2883334/149‑1 (MQ=255) ttttATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCAc > 1:1544533/1‑149 (MQ=255) ttttATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCAc < 2:307088/149‑1 (MQ=255) tttATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACAGTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACt < 1:3835252/149‑1 (MQ=255) ataAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACtttt < 2:678461/149‑1 (MQ=255) taAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTa < 1:1935420/149‑1 (MQ=255) aaTATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTAtt < 2:2077861/149‑1 (MQ=255) aaTATG‑ATAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTAtt < 2:4100031/149‑1 (MQ=255) tatG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTc < 2:1934874/149‑1 (MQ=255) tatG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTc > 2:1552017/1‑149 (MQ=255) atG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTcc < 1:555523/149‑1 (MQ=255) tG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCa > 1:1274287/1‑149 (MQ=255) g‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCAt < 2:249537/149‑1 (MQ=255) | AGAATAAGGTTTCAATTTTTGAGTTATATAGGAATGATTTAACCTGTTCCTGGCTAAAATACATATAACCGGATGATGACTAAACCAAAATACATGTGCGTTAAGTATTGAAACGGACGTGTGGCACGGCCGTTGTTTTTATAAATATG‑TTAACCGTTATAAAATAACGTATCAAAAGTCAAGTGATCACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGATTATTTATGGGTGACAATAAAAAGACAGTATTAATCATCCATAGAGATAGTCTCTGCACTTTTATTTCCAT > CP009273/1207810‑1208106 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |