Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,482,005 | G→T | 100% | D172Y (GAT→TAT) | ydcF → | DUF218 superfamily protein, SAM‑binding |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,482,005 | 0 | G | T | 97.8% | 868.6 / 8.3 | 272 | D172Y (GAT→TAT) | ydcF | DUF218 superfamily protein, SAM‑binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/5); new base T (138/128); total (139/133) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.14e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
ACAAACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCGATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACG > CP009273/1481861‑1482150 | acaaACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGc > 1:2814044/1‑149 (MQ=255) aaCTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGcacc > 1:2585591/1‑149 (MQ=255) aCTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGcacca < 2:378378/149‑1 (MQ=255) aCTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGcacca > 2:3655918/1‑149 (MQ=255) gTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTgg > 1:795455/1‑149 (MQ=255) tGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGt > 2:3066450/1‑149 (MQ=255) aaaaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTa > 1:362684/1‑149 (MQ=255) aaaaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTa > 2:672365/1‑149 (MQ=255) aaaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTaa < 1:3766107/149‑1 (MQ=255) aaaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTaa > 1:1881435/1‑149 (MQ=255) aaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAg > 1:339812/1‑149 (MQ=255) acgcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATc > 2:2289940/1‑149 (MQ=255) acgcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATc > 1:1266001/1‑149 (MQ=255) gcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATccc > 2:1643216/1‑149 (MQ=255) gcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATccc < 1:90496/149‑1 (MQ=255) cTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCg > 1:590700/1‑149 (MQ=255) cTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCg > 2:3921631/1‑149 (MQ=255) ttAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGa < 2:817227/149‑1 (MQ=255) tAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGAt < 2:2499382/149‑1 (MQ=255) tAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGAt < 1:678896/149‑1 (MQ=255) aGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGAtt < 2:600466/149‑1 (MQ=255) gCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTc < 2:3394952/149‑1 (MQ=255) gCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTc < 2:2401706/149‑1 (MQ=255) cATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCg < 1:3122363/149‑1 (MQ=255) tCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGtt > 1:1013443/1‑149 (MQ=255) gcgcTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTcc > 1:3862146/1‑149 (MQ=255) gcTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTc > 2:2871965/1‑149 (MQ=255) cTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCa < 2:2640305/149‑1 (MQ=255) tATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAg < 2:2214043/149‑1 (MQ=255) ttGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGtt < 1:839213/149‑1 (MQ=255) ttGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGtt > 2:3949385/1‑149 (MQ=255) ttGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGtt < 1:1667401/149‑1 (MQ=255) tCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGaa < 2:1976613/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGaaa < 2:4093440/149‑1 (MQ=255) aGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAAt < 1:1228806/149‑1 (MQ=255) aGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAAt > 1:2823520/1‑149 (MQ=255) gCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATaa < 1:3980996/149‑1 (MQ=255) gCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATaa > 2:2786787/1‑149 (MQ=255) gCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATaa < 1:3278907/149‑1 (MQ=255) ccGGAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTGGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAAc < 1:2472733/149‑1 (MQ=255) cGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACg > 2:1770757/1‑149 (MQ=255) cGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACg > 1:2883772/1‑149 (MQ=255) tAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACCATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCa < 1:3480854/149‑1 (MQ=255) tAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCa > 1:2995992/1‑149 (MQ=255) tAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCa < 1:377129/149‑1 (MQ=255) aGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAg > 1:1794258/1‑149 (MQ=255) aGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCGATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAg > 2:720201/1‑149 (MQ=255) gAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAgt < 1:1478170/149‑1 (MQ=255) gTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAgtgt < 1:500120/149‑1 (MQ=255) ttCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTa < 2:3830295/149‑1 (MQ=255) ttCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTa > 2:585426/1‑149 (MQ=255) cATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCGTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAAt < 1:3921635/149‑1 (MQ=255) aTACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATTCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATc < 1:2006972/149‑1 (MQ=255) tACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTATGAAATAACGCAGACAGTGTAATCt < 1:1297267/149‑1 (MQ=255) tACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCt > 2:1882088/1‑149 (MQ=255) aCGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt < 2:3613537/149‑1 (MQ=255) ggCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTtta < 2:3021481/149‑1 (MQ=255) ggCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTtta < 2:964566/149‑1 (MQ=255) cTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTttatt < 1:180105/149‑1 (MQ=255) tATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTttatta > 2:2573186/1‑149 (MQ=255) aTCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTaa > 2:3729299/1‑149 (MQ=255) tCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAAt > 2:3121177/1‑149 (MQ=255) gttgttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCa > 2:1212339/1‑149 (MQ=255) ttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTa < 2:3851992/149‑1 (MQ=255) cAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACa < 2:2847723/149‑1 (MQ=255) ggACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTAATTAATCAGTTACAAg > 2:2973452/1‑149 (MQ=255) ccaccaTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTa > 1:2380012/1‑149 (MQ=255) accaTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATg < 2:84775/149‑1 (MQ=255) caTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGc < 2:98615/149‑1 (MQ=255) gCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAg > 1:1836181/1‑149 (MQ=255) gCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAg < 2:1304752/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGt < 1:4111342/149‑1 (MQ=255) ggcgCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACATTCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGTAATAACGGAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTTCAAGGTTTATGGCCTGTTGAg < 2:1955433/149‑1 (MQ=255) gcgcACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGc > 1:387626/1‑149 (MQ=255) aCGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTa > 2:2677630/1‑149 (MQ=255) aCGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTa > 1:2879504/1‑149 (MQ=255) ggCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTAtctct > 2:144235/1‑149 (MQ=255) gACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCac > 1:2500165/1‑149 (MQ=255) aCGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCact > 2:2766411/1‑149 (MQ=255) gTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCactac < 2:2814044/149‑1 (MQ=255) ttCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCactact > 2:3634845/1‑149 (MQ=255) tCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTc < 2:3318171/149‑1 (MQ=255) cgccgTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCAc < 1:3789059/149‑1 (MQ=255) cgccgTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCAc < 1:2714936/149‑1 (MQ=255) 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tCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTAc < 2:1306997/149‑1 (MQ=255) | ACAAACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCGATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACG > CP009273/1481861‑1482150 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |