| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,495,499 | G→T | 9.0% | D224Y (GAC→TAC) | tehA → | potassium‑tellurite ethidium and proflavin transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,495,499 | 0 | G | T | 9.0% | 827.4 / 36.5 | 232 | D224Y (GAC→TAC) | tehA | potassium‑tellurite ethidium and proflavin transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (111/100); new base T (11/10); total (122/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
CTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCA > CP009273/1495351‑1495647 | tcATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGa < 1:661367/149‑1 (MQ=255) tcATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGa > 1:293990/1‑149 (MQ=255) tcATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGa > 2:933647/1‑149 (MQ=255) 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cTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATc < 1:3739916/149‑1 (MQ=255) gAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTTACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCCTGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTg > 1:3105012/1‑149 (MQ=255) gCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCa > 1:806567/1‑149 (MQ=255) cGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCAc < 2:1382240/149‑1 (MQ=255) gTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACt > 2:1068271/1‑149 (MQ=255) tCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTg > 1:2724742/1‑149 (MQ=255) tCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGACGTATCTGCACTg > 1:3118723/1‑149 (MQ=255) cAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTgg > 2:2002253/1‑149 (MQ=255) ggcgAGGGTTACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAaccac > 2:3495435/1‑149 (MQ=255) gcgAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAaccacc > 1:1077766/1‑149 (MQ=255) gggTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGtt < 2:3399658/149‑1 (MQ=255) ggTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGttt < 1:636704/149‑1 (MQ=255) | CTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCA > CP009273/1495351‑1495647 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |