| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,540,399 | A→G | 29.8% | intergenic (‑114/+146) | yddL ← / ← yddG | putative lipoprotein;putative membrane; Not classified; putative outer membrane porin protein/aromatic amino acid exporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,540,399 | 0 | A | G | 29.8% | 372.8 / 240.0 | 255 | intergenic (‑114/+146) | yddL/yddG | putative lipoprotein;putative membrane; Not classified; putative outer membrane porin protein/aromatic amino acid exporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (94/85); new base G (40/36); total (134/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
CCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTT > CP009273/1540251‑1540546 | ccAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATgaga < 1:620419/149‑1 (MQ=255) cAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGaa < 1:435511/149‑1 (MQ=255) cAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGaa < 1:3069875/149‑1 (MQ=255) ttACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGaaaaa < 1:1336070/149‑1 (MQ=255) accaccGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGAt < 2:642109/149‑1 (MQ=255) acGCAAATATTTTTAATTTCATTTAACAGAATACTTTTAATTATCTTTAAACTTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCTTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTATAATTGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGaaa < 1:916020/148‑1 (MQ=255) cAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAaataa > 1:2916845/1‑149 (MQ=255) cAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAaataa > 2:518818/1‑149 (MQ=255) attATTTTTAATTACATTTAA‑ATCATCCCTTTTATTTTACTTTAAAGTTTTTTCTTAACGAATTTTTAAAGGGCTCAATTTATAATTTAATAAGTTTTTTTAAAATTGAAGGTTAATTAAAAACATGCCAAAAAATAGATGAAataata < 2:2299974/147‑1 (MQ=255) aCTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAataata < 1:1622539/149‑1 (MQ=255) cTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAatat < 1:369541/149‑1 (MQ=255) cTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGATAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAatat < 2:3740273/149‑1 (MQ=255) tttttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAAtattat > 2:2247927/1‑149 (MQ=255) ttttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATattatt > 1:3440599/1‑149 (MQ=255) tttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATAttattt < 1:549470/149‑1 (MQ=255) tttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATAttattt > 2:2407840/1‑149 (MQ=255) ttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATAttattta < 1:2441739/149‑1 (MQ=255) tAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATAttatttat > 2:3460913/1‑149 (MQ=255) tAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATAttatttat < 2:2639692/149‑1 (MQ=255) aaTTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATc > 2:2210799/1‑149 (MQ=255) aTTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCg > 1:2827961/1‑149 (MQ=255) tttCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGa > 2:1191099/1‑149 (MQ=255) tttCATTTAAAAGACTCATTTTAATTATCGTTAATCTTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATTAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGa < 1:109443/149‑1 (MQ=255) cATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGatat > 1:1800064/1‑149 (MQ=255) aaCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGAt > 1:2332807/1‑149 (MQ=255) aCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTATAAACAATTAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATAGATATGTGAta > 1:3806517/1‑148 (MQ=255) aCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATc > 1:4072937/1‑149 (MQ=255) aaTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAg > 2:2196325/1‑149 (MQ=255) aaTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAg > 1:3255372/1‑149 (MQ=255) aTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGt < 1:4097199/149‑1 (MQ=255) tCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTc < 1:3985758/149‑1 (MQ=255) tttCATTCTCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTATTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACATTGAGAAAAATAGATGAAATTATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGtaa < 2:3647004/149‑1 (MQ=255) aTTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATgag > 2:1223300/1‑149 (MQ=255) cGTTAAACTTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGAtata < 1:1741970/149‑1 (MQ=255) ttAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAg < 2:4017240/149‑1 (MQ=255) ttAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAg > 1:3955103/1‑149 (MQ=255) aaaCGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGt < 1:3289843/149‑1 (MQ=255) aaaCGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGt < 1:1452205/149‑1 (MQ=255) aaaCGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGt < 1:2584043/149‑1 (MQ=255) aaCGTTTTTTCTATACGTA‑TTTTAATCGGAGTCATTTATATATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATTTAAGGTg < 1:856379/149‑1 (MQ=255) aCGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGa > 2:772474/1‑149 (MQ=255) cGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGaa < 1:2245275/149‑1 (MQ=255) cGTATTTTCCAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAACAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGaa < 1:2119181/149‑1 (MQ=255) aTTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTa < 2:2827961/149‑1 (MQ=255) aTTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTa < 2:1086803/149‑1 (MQ=255) aTTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGACTTa > 2:1527217/1‑149 (MQ=255) ttttCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTAc > 2:957286/1‑149 (MQ=255) ttCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTg > 2:2906449/1‑149 (MQ=255) tatAAAAGAA‑TTTTAAACGGCTTCATTTATAAATGACATACTTTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTgg < 1:3298246/147‑1 (MQ=255) cTAAACTAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGt < 2:3559714/149‑1 (MQ=255) cTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGt < 2:879264/149‑1 (MQ=255) aaCGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTAtt > 1:3138201/1‑149 (MQ=255) aaCGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTAtt < 2:3375192/149‑1 (MQ=255) aCGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTAttt > 1:2864219/1‑149 (MQ=255) aCGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTAttt > 1:2528514/1‑149 (MQ=255) aCGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTAttt > 2:1988728/1‑149 (MQ=255) a‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGaaa > 2:867132/1‑149 (MQ=255) ttttAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAat < 1:2214011/149‑1 (MQ=255) agttATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTCTTTGAAATTTATTTTTTTAata > 1:1927758/3‑149 (MQ=255) aTTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAata > 1:768611/1‑149 (MQ=255) aTTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAata < 1:1640684/149‑1 (MQ=255) aTTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAata > 1:26317/1‑149 (MQ=255) aTTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAata > 1:26253/1‑149 (MQ=255) tttATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATGTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAatat < 2:3243885/149‑1 (MQ=255) ttATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATAtt > 1:1404480/1‑149 (MQ=255) taAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTc < 2:444269/149‑1 (MQ=255) taAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTc < 1:1223300/149‑1 (MQ=255) taAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTc > 1:3727/1‑149 (MQ=255) taAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTc > 2:3241426/1‑149 (MQ=255) aaaTGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCg < 1:2664664/149‑1 (MQ=255) aaaTGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCg < 2:2493256/149‑1 (MQ=255) gACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAAt < 1:2260854/149‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATc < 2:3291882/149‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATc > 1:1052348/1‑149 (MQ=255) aCTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATc > 1:580317/1‑149 (MQ=255) tttttAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGAt > 1:3003345/1‑149 (MQ=255) ttAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTaa < 1:2369342/149‑1 (MQ=255) aaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTAc > 1:3908724/1‑149 (MQ=255) aaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTAc > 1:1872778/1‑149 (MQ=255) aTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTAcc > 1:3650861/1‑149 (MQ=255) aTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTAcc > 1:1745353/1‑149 (MQ=255) tAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCg < 1:1050957/149‑1 (MQ=255) tAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCg < 1:2209710/149‑1 (MQ=255) gAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCggg > 2:3831438/1‑149 (MQ=255) aaTGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGc < 2:3440599/149‑1 (MQ=255) aTGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGcc > 2:2364078/1‑149 (MQ=255) aTGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGcc > 1:961550/1‑149 (MQ=255) aTGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGcc > 2:1743594/1‑149 (MQ=255) gTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTa < 1:2575549/149‑1 (MQ=255) tAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGAccc < 1:3381029/149‑1 (MQ=255) aaCAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCa > 2:129243/1‑149 (MQ=255) cAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGt > 1:3331913/1‑149 (MQ=255) cAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGt > 1:1873895/1‑149 (MQ=255) aaTGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGtt < 2:2342347/149‑1 (MQ=255) aTGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTa < 1:772474/149‑1 (MQ=255) tGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGTGATATAAGGTGAATTAGTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAt > 2:1803906/1‑149 (MQ=255) gaggAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAtt < 1:3460913/149‑1 (MQ=255) gagaAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAtt > 1:142855/1‑149 (MQ=255) agaAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAttt > 2:1511925/1‑149 (MQ=255) agaAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAttt > 2:2085210/1‑149 (MQ=255) | CCAGTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAA‑TTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTATTTT > CP009273/1540251‑1540546 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |