| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,706,839 | 0 | C | T | 38.8% | 190.3 / 243.7 | 204 | intergenic (+424/‑187) | nth/dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (61/63); new base T (36/43); total (98/106) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.63e-01 | |||||||||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |