| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,951,334 | C→A | 100% | T352T (ACG→ACT) | torY ← | TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,951,334 | 0 | C | A | 100.0% | 791.2 / NA | 236 | T352T (ACG→ACT) | torY | TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (116/120); total (116/120) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
GGTGCTGCCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGCGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGT > CP009273/1951188‑1951479 | ggTGCTGCCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGt < 1:3472043/149‑1 (MQ=255)ggTGCTGCCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGt < 2:39071/149‑1 (MQ=255) gcCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAAt > 1:3951098/1‑149 (MQ=255) aTGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTcc < 1:2422839/149‑1 (MQ=255) tGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCa > 2:1136694/1‑149 (MQ=255) caccacCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTGTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAACATGTCCAGtt > 2:3853090/1‑149 (MQ=255) accaccAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTc < 1:2168157/149‑1 (MQ=255) ccaccaGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCg > 1:1186402/1‑149 (MQ=255) caccaGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGATAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGt < 2:1372951/149‑1 (MQ=255) caccaGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAAGAAAGTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGt < 2:3309011/149‑1 (MQ=255) accaGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGtt > 1:1928138/1‑149 (MQ=255) accaGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGtt < 1:1953393/149‑1 (MQ=255) accaGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCGTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGtt < 2:559581/149‑1 (MQ=255) ccaGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGttt < 1:1406615/149‑1 (MQ=255) aGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTc > 1:665440/1‑149 (MQ=255) aGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTc > 1:2242664/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCAt < 1:3234410/149‑1 (MQ=255) ggCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTgg < 1:378255/149‑1 (MQ=255) gCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGt > 2:1493604/1‑149 (MQ=255) cAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGtt < 1:84407/149‑1 (MQ=255) aaTACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTc > 1:1734651/1‑149 (MQ=255) aaTACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTc < 1:340062/149‑1 (MQ=255) tACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGt < 2:666737/149‑1 (MQ=255) tACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGt < 2:2851051/149‑1 (MQ=255) tACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGt < 2:3560027/149‑1 (MQ=255) ccGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGc < 1:4026636/149‑1 (MQ=255) cTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGcccc > 2:125370/1‑149 (MQ=255) tgtgTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGccccc > 2:1260568/1‑149 (MQ=255) tgtgTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGccccc < 2:575879/149‑1 (MQ=255) tgtTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCAt < 2:3326149/149‑1 (MQ=255) tgtTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCAt > 1:1120808/1‑149 (MQ=255) tgtTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCAt > 1:2376548/1‑149 (MQ=255) gtTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCAtt > 1:2656971/1‑149 (MQ=255) gtTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCAtt > 1:3841441/1‑149 (MQ=255) ttAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTATCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTcc > 2:3454391/1‑149 (MQ=255) aataaATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCtt < 1:1537980/149‑1 (MQ=255) aataaATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCtt < 1:3585602/149‑1 (MQ=255) taaATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTg > 2:202468/1‑149 (MQ=255) aaaTTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTgg > 2:2065347/1‑149 (MQ=255) aaTTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGc > 1:386796/1‑149 (MQ=255) aTTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCa < 2:377725/149‑1 (MQ=255) aCGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATgg > 2:3477309/1‑149 (MQ=255) tCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCTGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACg > 1:3281571/1‑149 (MQ=255) tCTTGTTAATGTCATAACGTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACg < 2:2664155/149‑1 (MQ=255) ttGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGc < 2:3018354/149‑1 (MQ=255) gTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCa < 1:2602987/149‑1 (MQ=255) gTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCa < 1:537672/149‑1 (MQ=255) gTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAAAGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCa > 1:387346/1‑149 (MQ=255) ttAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCAc < 1:1721184/149‑1 (MQ=255) cATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGa < 1:3719759/149‑1 (MQ=255) tAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACg > 2:916369/1‑149 (MQ=255) aCTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGgt > 2:2302560/1‑149 (MQ=255) aCTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGgt > 2:3168118/1‑149 (MQ=255) aCTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGgt > 2:83251/1‑149 (MQ=255) ttCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGgtgt > 2:78745/1‑149 (MQ=255) tccCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATg < 2:1440165/149‑1 (MQ=255) ccTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGt < 1:2780450/149‑1 (MQ=255) ccTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGt > 2:2350826/1‑149 (MQ=255) aTCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTACTGGTcggc > 1:2324446/1‑149 (MQ=255) aTCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTcggc > 2:2589666/1‑149 (MQ=255) aTCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTcggc > 2:1667187/1‑149 (MQ=255) tCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTcggcg > 1:355441/1‑149 (MQ=255) tCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTcggcg > 1:3413335/1‑149 (MQ=255) cGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCaa < 1:241592/149‑1 (MQ=255) cGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCaa < 1:3717063/149‑1 (MQ=255) aGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATa > 1:1158348/1‑149 (MQ=255) aGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATa > 2:1094721/1‑149 (MQ=255) aGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATa < 2:895955/149‑1 (MQ=255) aTCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAggg > 2:860358/1‑149 (MQ=255) cACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCAATCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGc > 2:342425/1‑149 (MQ=255) cTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCAt > 1:1396173/1‑149 (MQ=255) tGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATg < 2:2074969/149‑1 (MQ=255) gTTTCTCGGTAACATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGa < 1:969022/149‑1 (MQ=255) tttCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGAc > 2:2104738/1‑149 (MQ=255) ttCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACa > 1:188247/1‑149 (MQ=255) tctcGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACaa < 1:3310206/149‑1 (MQ=255) gTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAgc > 2:3252401/1‑149 (MQ=255) gTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAgc < 1:2486058/149‑1 (MQ=255) gTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAgc > 2:1973478/1‑149 (MQ=255) atatCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCa > 2:2184867/1‑149 (MQ=255) tatCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCaa < 2:1903738/149‑1 (MQ=255) tatCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCaa > 1:150965/1‑149 (MQ=255) tCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATa > 1:812658/1‑149 (MQ=255) tGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTa > 1:1015678/1‑149 (MQ=255) tGGCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTa < 1:2825069/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTAt < 2:1192163/149‑1 (MQ=255) gCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATc < 2:2376554/149‑1 (MQ=255) gCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATc > 1:2211483/1‑149 (MQ=255) gCGTTGTACTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATAGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATc > 1:3929922/1‑149 (MQ=255) cTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACACCCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGtt > 1:1622838/1‑149 (MQ=255) cTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGtt < 1:1028419/149‑1 (MQ=255) cTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGtt < 2:2802430/149‑1 (MQ=255) cTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGtt < 1:1028437/149‑1 (MQ=255) cTGGAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGtt > 1:1622857/1‑149 (MQ=255) ggAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGtttt < 2:394710/149‑1 (MQ=255) gAAATACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGttttt < 1:2302560/149‑1 (MQ=255) aaTACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCa > 1:302780/1‑149 (MQ=255) tACCGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGc < 2:1244569/149‑1 (MQ=255) ccGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGt > 2:3600569/1‑149 (MQ=255) ccGAGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGt > 2:1672191/1‑149 (MQ=255) | GGTGCTGCCGATGTCACCACCAGCGCTCCAGCGGCAATACCGCTGTGTTTAATAAATTCACGTCTTGTTAATGTCATAACTTCCTCCCTGATCAACGAGGATCACTGTTTCTCGGTAATATCTTTGGCGTTGTACTGGAAATACCGCGTTAAAATGTCCAGTTCGTTTTCGCTCATGCTGGTTCGTGCCCCCATTCCTTTGGCAATGGACGGCCACGCATTGACGGTGTAATGGTCGGCGGCAATAGGGGCATGACAACCAGCGCAATAGGTATCGTCAAGTTTTTCAGCGT > CP009273/1951188‑1951479 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |