Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 201,962 | A→T | 100% | D117V (GAT→GTT) | dnaE → | DNA polymerase III alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 201,962 | 0 | A | T | 99.3% | 896.5 / ‑2.7 | 279 | D117V (GAT→GTT) | dnaE | DNA polymerase III alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base T (148/129); total (148/131) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.20e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.32e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
ATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTCCCGGATCGCTAT > CP009273/201818‑202110 | aTTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTcgc < 1:2270931/149‑1 (MQ=255) ttAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGan < 1:899085/149‑2 (MQ=255) cGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGc < 1:3121994/149‑1 (MQ=255) gTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGTCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCt > 2:1467773/1‑149 (MQ=255) tCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCtt < 1:3496478/149‑1 (MQ=255) gTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCg > 1:691919/1‑149 (MQ=255) tGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGa > 1:1705459/1‑149 (MQ=255) tGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGa < 2:3242550/149‑1 (MQ=255) cGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAAt < 1:2237482/149‑1 (MQ=255) aCCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTa < 2:2304062/149‑1 (MQ=255) ctgctgGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATCCAGGCTATCATACGCTTACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTaaa > 1:4034279/1‑149 (MQ=255) tgctgGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAAc < 1:3809286/149‑1 (MQ=255) tgctgGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAAc > 1:21083/1‑149 (MQ=255) gctgGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACg > 2:871049/1‑149 (MQ=255) gctgGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACg > 2:2257381/1‑149 (MQ=255) tgGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGaa > 1:425065/1‑149 (MQ=255) tgGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGaa > 1:3948176/1‑149 (MQ=255) tgGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGaa > 1:3038241/1‑149 (MQ=255) tgGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGaa < 1:1533936/149‑1 (MQ=255) gggTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAg < 1:1262507/149‑1 (MQ=255) gatgaGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTAGGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGtt < 1:2890984/149‑1 (MQ=255) gatgaGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGtt > 1:2752402/1‑149 (MQ=255) gatgaGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGtt > 2:3388951/1‑149 (MQ=255) atgaGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTg < 1:375693/149‑1 (MQ=255) gaGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGAt > 2:200698/1‑149 (MQ=255) gaGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGAt < 2:2879497/149‑1 (MQ=255) gTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATcc < 2:1074916/149‑1 (MQ=255) gTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATcc < 2:3424192/149‑1 (MQ=255) gTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATAATCGTTCGAGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATcc < 1:1797458/149‑1 (MQ=255) ttAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCct > 1:3477669/1‑149 (MQ=255) ttAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCct > 1:3639040/1‑149 (MQ=255) aaCCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCcttc < 1:1302062/149‑1 (MQ=255) ccACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCttt < 2:940604/149‑1 (MQ=255) cACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTc > 1:281990/1‑149 (MQ=255) aCCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAATAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTcc > 1:1881445/1‑149 (MQ=255) tGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCcggc < 1:959722/149‑1 (MQ=255) tGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCcggc > 2:960552/1‑149 (MQ=255) cGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACGGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGa < 2:1004623/149‑1 (MQ=255) ggTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGAc > 1:242310/1‑149 (MQ=255) gTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACg > 2:1282387/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCAt > 2:105582/1‑149 (MQ=255) gcggcgAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGATTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATggg < 1:3359943/149‑1 (MQ=255) cggcgAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGc < 1:3386456/149‑1 (MQ=255) ggcgAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCg < 2:1365859/149‑1 (MQ=255) aaCAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGt > 1:3529702/1‑149 (MQ=255) aCAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTc < 1:1897182/149‑1 (MQ=255) aCAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTc > 2:1075679/1‑149 (MQ=255) aCAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTc > 2:926284/1‑149 (MQ=255) cAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCg > 2:3952858/1‑149 (MQ=255) cAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCg > 2:2657593/1‑149 (MQ=255) aaaTACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTCTCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAACGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCg > 2:1957224/2‑149 (MQ=255) aaTACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCgg > 2:1562059/1‑149 (MQ=255) aCCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACg > 2:3037604/1‑149 (MQ=255) aCCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACg > 2:632832/1‑149 (MQ=255) cGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCa < 2:647377/149‑1 (MQ=255) cTATCATTATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCTATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTTATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTc < 1:144611/149‑1 (MQ=255) aTCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCtt > 1:120259/1‑149 (MQ=255) tCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCttt < 2:3752206/149‑1 (MQ=255) gAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGc > 1:1314049/1‑149 (MQ=255) aaTCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCg > 2:3618241/1‑149 (MQ=255) aTCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGt < 2:1705459/149‑1 (MQ=255) tCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTg > 2:2214842/1‑149 (MQ=255) aCGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTaa > 2:3822672/1‑149 (MQ=255) ttGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAg > 1:1034183/1‑149 (MQ=255) 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aGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATg > 2:946168/1‑149 (MQ=255) aGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATg > 1:1957699/1‑149 (MQ=255) gTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTGTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAgt > 2:2332817/1‑149 (MQ=255) tATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAgtg > 1:825812/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAgtgt > 1:623608/1‑149 (MQ=255) tCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAgtgtg > 1:2103015/1‑149 (MQ=255) gcgcGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTcg > 2:795110/1‑149 (MQ=255) gcgcGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGAGGAGTGTGTcg > 2:795536/1‑149 (MQ=255) gcgGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTcgcg < 2:2030455/149‑1 (MQ=255) cgGGTACGGTGCCGCCGGGCCGCTCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGt < 2:2756441/149‑1 (MQ=255) cgGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGt > 1:2880044/1‑149 (MQ=255) gggTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGtt < 2:1106336/149‑1 (MQ=255) ggTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGttt < 2:2397973/149‑1 (MQ=255) ggTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGttt < 1:2140121/149‑1 (MQ=255) gTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATgaa < 1:2742906/149‑1 (MQ=255) 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ccGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCTTGGGCGACGTCGGACGCAGTATTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTccc < 1:3079307/149‑1 (MQ=255) atcatcGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTCCCGGa < 1:3610243/149‑1 (MQ=255) atcatcGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTCCCGGa < 1:1467378/149‑1 (MQ=255) atcatcGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTCCCGGa > 2:215778/1‑149 (MQ=255) tcatcGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTCCCGGAt < 1:3372315/149‑1 (MQ=255) 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tcgttcgCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTCCCGGATCGc < 2:1661903/149‑1 (MQ=255) | ATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTCCCGGATCGCTAT > CP009273/201818‑202110 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |