| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,046,600 | G→T | 100% | pseudogene (210/1053 nt) | yeeL ← | pseudogene, glycosyltransferase homology |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,046,600 | 0 | G | T | 98.1% | 687.1 / 3.0 | 213 | pseudogene (210/1053 nt) | yeeL | pseudogene, glycosyltransferase homology |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/1); new base T (97/112); total (100/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.43e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGA > CP009273/2046454‑2046745 | cGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATAc > 2:743288/1‑149 (MQ=255) ccccTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTa > 2:697169/1‑149 (MQ=255) ccccTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTa < 2:2345354/149‑1 (MQ=255) tCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaatt < 1:170966/149‑1 (MQ=255) tCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaatt > 1:1783535/1‑149 (MQ=255) tCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaatt < 1:3530190/149‑1 (MQ=255) aTGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaat < 2:2423564/149‑1 (MQ=255) aTGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaat > 1:1365275/1‑149 (MQ=255) aTGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaat > 1:1365319/1‑149 (MQ=255) tGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAaattaatt < 2:1079249/149‑1 (MQ=255) cAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGt < 2:3315509/149‑1 (MQ=255) cAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGt < 1:2413374/149‑1 (MQ=255) cAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGt < 1:2392293/149‑1 (MQ=255) aaaGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTc > 2:1777336/1‑149 (MQ=255) tCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGt > 1:1937998/1‑149 (MQ=255) ggCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTAc > 2:3954733/1‑149 (MQ=255) ggCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTAc > 2:568381/1‑149 (MQ=255) gCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACa > 2:135378/1‑149 (MQ=255) gCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACa > 2:2501366/1‑149 (MQ=255) cGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACaa < 1:2244002/149‑1 (MQ=255) cGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACaa > 1:1956707/1‑149 (MQ=255) gTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTaaaa < 1:300009/149‑1 (MQ=255) tATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTaaaat > 2:2081711/1‑148 (MQ=255) tATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAg > 1:106261/1‑149 (MQ=255) aTTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGa < 2:3120764/149‑1 (MQ=255) tGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATg < 2:3055086/149‑1 (MQ=255) tGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATg < 2:684437/149‑1 (MQ=255) cTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCt > 2:2539878/1‑149 (MQ=255) cTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCt > 1:915597/1‑149 (MQ=255) gtTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAt < 1:1154155/149‑1 (MQ=255) ttATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAtt < 1:1742532/149‑1 (MQ=255) ttATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAtt < 1:621350/149‑1 (MQ=255) tATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAttt < 1:424461/149‑1 (MQ=255) aTGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAAtttt > 1:3009981/1‑149 (MQ=255) gTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTAt < 1:2932911/149‑1 (MQ=255) ttCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATg < 2:2767427/149‑1 (MQ=255) cTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCa > 1:3260744/1‑149 (MQ=255) ttGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAAt < 2:2920772/149‑1 (MQ=255) ttGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAAt > 2:3240578/1‑149 (MQ=255) ttGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAAt > 2:732326/1‑149 (MQ=255) tGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAAtt > 2:1643261/1‑149 (MQ=255) tGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAAtt > 1:3929173/1‑149 (MQ=255) tAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCaa < 2:1290357/149‑1 (MQ=255) tAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCaa > 1:3548171/1‑149 (MQ=255) cTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGcc < 1:2912128/149‑1 (MQ=255) ttttAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATTTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAg < 1:2834711/149‑1 (MQ=255) tttAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGAGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAgg > 1:2102942/1‑149 (MQ=255) ttAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGa < 1:740185/149‑1 (MQ=255) tAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGaa < 2:3008350/149‑1 (MQ=255) tGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGa < 2:3740355/149‑1 (MQ=255) gTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGAt < 2:2408119/149‑1 (MQ=255) gCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGc < 1:1539186/149‑1 (MQ=255) tGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCAt > 2:3224690/1‑149 (MQ=255) tGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCAt > 1:3238988/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAg > 2:3790482/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAg > 2:1750062/1‑149 (MQ=255) ccTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCa < 2:3875407/149‑1 (MQ=255) ccTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCa < 2:1941457/149‑1 (MQ=255) tGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATc < 1:2511486/149‑1 (MQ=255) cATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGc < 2:2312132/149‑1 (MQ=255) cATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGc < 1:2501366/149‑1 (MQ=255) tCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATc > 1:132329/1‑149 (MQ=255) tCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATc < 2:2809312/149‑1 (MQ=255) aTTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTg > 1:75962/1‑149 (MQ=255) ttGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGa < 2:1832640/149‑1 (MQ=255) ttGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGa > 2:500631/1‑149 (MQ=255) ttGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGa > 2:2571630/1‑149 (MQ=255) tgtgACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGAt < 2:1365275/149‑1 (MQ=255) tgtgACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGAt < 2:1365319/149‑1 (MQ=255) aaTGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAat > 1:493186/1‑149 (MQ=255) aaTGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTAAAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAat < 1:2630788/149‑1 (MQ=255) tGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAatat < 2:1035895/149‑1 (MQ=255) tGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAatat < 1:2349579/149‑1 (MQ=255) gTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATg > 1:1357717/1‑149 (MQ=255) aaTTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGAt < 1:3238640/149‑1 (MQ=255) aaTTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGAt > 1:3130094/1‑149 (MQ=255) aaTTTAGTCTGTTAAATTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGAt < 1:363837/149‑1 (MQ=255) tttAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGa > 2:835740/1‑149 (MQ=255) ttAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGac < 1:698728/149‑1 (MQ=255) aGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACATCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGAAATTAAAGCGCCCGAATAACAGGAAATATGGACAAAGCATCGCAAATCTGATCGGGAATATGGATGacaa > 2:2928409/1‑149 (MQ=255) tCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGacaaca < 2:3504692/149‑1 (MQ=255) tCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGATTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGTAAAGATTGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGacaaca > 2:3613673/1‑149 (MQ=255) cTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGAcaacaa < 2:70390/149‑1 (MQ=255) cTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGAcaacaa < 2:3337993/149‑1 (MQ=255) tGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACaaa > 2:326416/1‑149 (MQ=255) ttCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGt > 2:1489085/1‑149 (MQ=255) ttCAAGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGt < 2:915597/149‑1 (MQ=255) aaGTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTg < 1:3303616/149‑1 (MQ=255) gTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGtt < 1:3197515/149‑1 (MQ=255) gTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGtt < 2:2892777/149‑1 (MQ=255) gTTTAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCAGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGtt < 1:2027031/149‑1 (MQ=255) tttAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGttt > 1:1406948/1‑149 (MQ=255) ttAAGCGCATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGtttt < 1:3348353/149‑1 (MQ=255) gcATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAat > 1:279426/1‑149 (MQ=255) cATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAata > 2:3841547/1‑149 (MQ=255) cATTAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAata > 2:1616998/1‑149 (MQ=255) ttAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATAtt > 1:2046618/1‑149 (MQ=255) ttAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATAtt < 2:3684423/149‑1 (MQ=255) ttAAATACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATAtt > 2:1830626/1‑149 (MQ=255) aaaTACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGa > 1:863305/1‑149 (MQ=255) | CGCATCCCCTCAATGCAAAGATCCGGCGTACCGTATTGCTGTGTTATGTTCTTTGCTAAATCTTTTATTTCTTTTAATGTTGCGTGATCCTGCATAGTCATTGTGACTAATGTTAATTTAGTCTGTTCAAGTTTAAGCGCATTAAAGACTTCTAAATTAATTGTCGACGTTACAATTAAAAGATGCTTAATTTTATGCAATTCAAGCGCCCGAATAACAGGAAAGATGGCCATAGCATCGCCAATCTGATCGGGAATATGGATGACAACAAAGTCTGTTTTTTCAATATTGA > CP009273/2046454‑2046745 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |