| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 2,077,698 | A→T | 37.7% | intergenic (+34/+9) | sbcB → / ← yeeD | exodeoxyribonuclease I; exonuclease I/putative TusA family sulfurtransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,077,698 | 0 | A | T | 37.7% | 221.4 / 294.2 | 247 | intergenic (+34/+9) | sbcB/yeeD | exodeoxyribonuclease I; exonuclease I/putative TusA family sulfurtransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (87/67); new base T (62/31); total (149/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
GTTTTTGCAGGGTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGC > CP009273/2077550‑2077846 | gTTTTTGCAGGGTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACa > 1:1262984/1‑149 (MQ=255) tttGCAGGGTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATg > 2:635280/1‑149 (MQ=255) aGGGTTATGCTGATGAATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACTATGTTGAg > 2:3081880/1‑149 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |