Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 2,303,070 | T→G | 100% | Q272P (CAG→CCG) | ada ← | fused DNA‑binding transcriptional dual regulator/O6‑methylguanine‑DNA methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,303,070 | 0 | T | G | 100.0% | 997.7 / NA | 243 | Q272P (CAG→CCG) | ada | fused DNA‑binding transcriptional dual regulator/O6‑methylguanine‑DNA methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (100/143); total (100/143) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
AGGGTATTATGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCTGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACTCGCT > CP009273/2302924‑2303215 | ggTATTATGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGaaa < 2:2501120/149‑1 (MQ=255) gTATTATGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGaaaa > 1:1314820/1‑149 (MQ=255) tattatGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAg > 1:3894184/1‑149 (MQ=255) tattatGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGGTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAg < 2:3795771/149‑1 (MQ=255) tatGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAg < 1:686693/149‑1 (MQ=255) tGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTg > 1:3338235/1‑149 (MQ=255) gATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGc > 2:3141640/1‑149 (MQ=255) aTAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGcc < 2:408143/149‑1 (MQ=255) aTAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGcc < 1:209199/149‑1 (MQ=255) tAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCcg > 2:2276480/1‑149 (MQ=255) aGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCcgc < 1:95173/149‑1 (MQ=255) aGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCcgc > 2:1507985/1‑149 (MQ=255) gCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCcgcg > 1:3429848/1‑149 (MQ=255) gCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATg > 1:1565896/1‑149 (MQ=255) gCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATg > 1:1565582/1‑149 (MQ=255) cTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGt < 1:1947630/149‑1 (MQ=255) gttgGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCa < 2:2710443/149‑1 (MQ=255) gttgGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCa < 2:189168/149‑1 (MQ=255) gttgGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCa < 2:3936894/149‑1 (MQ=255) cggcACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGt < 2:2567803/149‑1 (MQ=255) ggcACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTa < 1:2897794/149‑1 (MQ=255) ggcACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTa > 2:533696/1‑149 (MQ=255) gcACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTaa < 2:3164426/149‑1 (MQ=255) gcACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTaa < 2:3480317/149‑1 (MQ=255) gcACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTaa < 2:3480591/149‑1 (MQ=255) gcACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTaa < 1:1167243/149‑1 (MQ=255) cacaGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAAc < 2:1110539/149‑1 (MQ=255) cacaGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAAc > 1:825571/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCa > 2:2248217/1‑149 (MQ=255) gcTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAgcg > 1:4070488/1‑149 (MQ=255) tACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttgat < 2:580358/149‑1 (MQ=255) tACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttgat > 1:7649/1‑149 (MQ=255) aCCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttgatt < 2:1297772/149‑1 (MQ=255) aCCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttgatt < 2:770431/149‑1 (MQ=255) cGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttgattga < 2:3720881/149‑1 (MQ=255) cGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttgattga > 1:660843/1‑149 (MQ=255) cTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGCTTGAgg > 2:3890265/1‑149 (MQ=255) tCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTg < 1:211579/149‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTgga < 2:1444680/149‑2 (MQ=255) tGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATc < 1:937934/149‑1 (MQ=255) cGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGAGATCACt < 2:3338235/149‑1 (MQ=255) aTGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTc < 1:566980/149‑1 (MQ=255) tGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCa < 1:1659748/149‑1 (MQ=255) 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tATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCgg < 1:2508658/149‑1 (MQ=255) aTCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTGGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGc < 2:2424737/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAg > 1:1014107/1‑149 (MQ=255) tGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCg > 2:3647425/1‑149 (MQ=255) cctgccAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGAGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATc < 2:897894/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |