| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,524,056 | C→A | 100% | A179A (GCG→GCT) | zipA ← | FtsZ stabilizer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,524,056 | 0 | C | A | 95.4% | 657.8 / 20.6 | 217 | A179A (GCG→GCT) | zipA | FtsZ stabilizer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/4); new base A (112/95); total (118/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.58e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
ATATTCATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCCGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCGGC > CP009273/2523910‑2524200 | atatTCATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGc < 1:1499308/149‑1 (MQ=255) tatTCATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCt > 2:1477111/1‑149 (MQ=255) atTCATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTa > 1:3853085/1‑149 (MQ=255) tCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcaggctc < 1:1919689/149‑1 (MQ=255) cGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcaggctca > 1:489173/1‑149 (MQ=255) cGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcaggctca > 1:489051/1‑149 (MQ=255) aaaaaTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcaggctcaggct < 1:487772/149‑1 (MQ=255) aaaaaTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcaggctcaggct > 2:1224371/1‑149 (MQ=255) aaaaaTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTAcaggctcaggct < 1:2555929/149‑1 (MQ=255) aaaaTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCtg > 2:3222924/1‑149 (MQ=255) aaaTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCtgt < 2:2543055/149‑1 (MQ=255) aaTGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCtgtg < 1:431483/149‑1 (MQ=255) aaGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGc < 2:2221947/149‑1 (MQ=255) ccGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCt > 2:557451/1‑149 (MQ=255) cTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACg > 2:583466/1‑149 (MQ=255) gttgAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGt > 1:2505374/1‑149 (MQ=255) ttgAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGtt < 1:387341/149‑1 (MQ=255) ttgAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGtt < 1:4005553/149‑1 (MQ=255) tgAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTc > 2:2015903/1‑149 (MQ=255) gAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCt > 1:646383/1‑149 (MQ=255) gAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCt < 2:2833797/149‑1 (MQ=255) gAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCt > 2:592973/1‑149 (MQ=255) aaTGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTg > 1:2146556/1‑149 (MQ=255) aTGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATACCTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGc < 2:2309834/149‑1 (MQ=255) gCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAg < 1:276104/149‑1 (MQ=255) tGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGc > 1:552229/1‑149 (MQ=255) tGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGc > 1:2052165/1‑149 (MQ=255) tGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGc < 1:2079518/149‑1 (MQ=255) gTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCt < 1:2847640/149‑1 (MQ=255) ttAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTg > 1:678551/1‑149 (MQ=255) agCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGc > 1:1618299/1‑149 (MQ=255) agCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGc > 2:3921937/1‑149 (MQ=255) gCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGcc > 1:813486/1‑149 (MQ=255) gCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGcc > 1:2496575/1‑149 (MQ=255) gTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCCGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgt < 2:3072351/149‑1 (MQ=255) gTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgt > 1:378886/1‑149 (MQ=255) gTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgt < 2:3855360/149‑1 (MQ=255) ttCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgtt > 1:2949601/1‑149 (MQ=255) tCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgttg < 2:3347215/149‑1 (MQ=255) tCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgttg > 1:3378424/1‑149 (MQ=255) tCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgttg < 2:1234207/149‑1 (MQ=255) tCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACCGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgttg < 2:3347219/149‑1 (MQ=255) cACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCtgttgt > 2:1872949/1‑149 (MQ=255) aCCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTtgtg > 2:1581537/1‑149 (MQ=255) ccGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGc < 1:57224/149‑1 (MQ=255) ccGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGc < 1:3539495/149‑1 (MQ=255) aGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTg < 2:2695395/149‑1 (MQ=255) gCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGc > 1:136627/1‑149 (MQ=255) gCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGc < 2:4113440/149‑1 (MQ=255) gCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGc < 2:4113380/149‑1 (MQ=255) tCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCgg > 1:598818/1‑149 (MQ=255) cTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGc < 2:3565883/149‑1 (MQ=255) cTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGc < 2:1618299/149‑1 (MQ=255) cTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGc < 2:1519400/149‑1 (MQ=255) cTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGc < 2:1028873/149‑1 (MQ=255) cTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGAAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGc < 1:904435/149‑1 (MQ=255) tACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCCGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCt > 1:2535658/1‑149 (MQ=255) aCCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTg > 2:2419110/1‑149 (MQ=255) ccGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGa < 2:3159517/149‑1 (MQ=255) gATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGc < 2:2277159/149‑1 (MQ=255) gATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGc < 2:2954137/149‑1 (MQ=255) gATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGc > 2:2036810/1‑149 (MQ=255) gccgcGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAgg < 1:2369954/149‑1 (MQ=255) ccgcGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGc > 1:1704157/1‑149 (MQ=255) ccgcGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGc > 2:2462504/1‑149 (MQ=255) ccgcGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGc > 1:1704113/1‑149 (MQ=255) ccgcGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGc < 1:2924492/149‑1 (MQ=255) ccgcGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGc < 1:717052/149‑1 (MQ=255) cgcgACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCt < 1:1650896/149‑1 (MQ=255) cgACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTgc < 1:1754554/149‑1 (MQ=255) cGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTgcggc > 1:752052/1‑149 (MQ=255) ttCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGgcgc > 2:642349/1‑149 (MQ=255) tCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGTGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCt < 2:2635793/149‑1 (MQ=255) tGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGgc > 1:2535329/1‑149 (MQ=255) aaTCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGa > 2:1330216/1‑149 (MQ=255) cACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCCGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCt < 1:2298039/149‑1 (MQ=255) cACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCt > 2:1575028/1‑149 (MQ=255) cttcttTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGc > 1:1238198/1‑149 (MQ=255) cttcttTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGc < 2:2573161/149‑1 (MQ=255) gcTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGgc > 1:1066742/1‑149 (MQ=255) cTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGgct > 1:83913/1‑149 (MQ=255) tCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGgctgc < 2:678551/149‑1 (MQ=255) cGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGgctgct < 1:3009772/149‑1 (MQ=255) gTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCtgctgc > 2:3390358/1‑149 (MQ=255) tttATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCa > 1:3156196/1‑149 (MQ=255) ttATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCaa > 1:2800485/1‑149 (MQ=255) tATCCATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAAc < 1:1428248/149‑1 (MQ=255) ccATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGc < 1:2167556/149‑1 (MQ=255) ccATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGc < 1:1807649/149‑1 (MQ=255) ccATAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGc > 1:1353683/1‑149 (MQ=255) aTAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTg > 2:315073/1‑149 (MQ=255) aTAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTg > 1:381560/1‑149 (MQ=255) aTAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTg < 2:1127009/149‑1 (MQ=255) tAACTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGt > 1:3253821/1‑149 (MQ=255) aCTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTc < 2:3509578/149‑1 (MQ=255) cTGGAGCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCa < 1:3573217/149‑1 (MQ=255) gCAGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTg > 2:4059118/1‑149 (MQ=255) aGGTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCg < 2:2052165/149‑1 (MQ=255) gTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCGGc < 2:4020717/149‑1 (MQ=255) gTTCAGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCGGc > 1:2955790/1‑149 (MQ=255) | ATATTCATATCGCCAAAAATGAAGCCCGCTTGTTGAATGCTGTTAAGAAGCAGTTCACCGTTTAGCTCGCTACCGTGATGCGCCGCGACGTTCATGATAATCACCGCTTCTTTGCGCTTCGGTTTATCCATAACTGGAGCAGGTTCCGCTACAGGCTCAGGCTGTGGTGCCGCTACGGGTTCTGCAGGCTGGAAAGCCTGTTGTGCCGGTTGCGGTGCTGAATGCACAGGCTGCGGCGCTGGCGCGACCTGTGGCGAAACTGGCTGCTGCAACGGCTGTTCAGGCTGCGGC > CP009273/2523910‑2524200 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |