| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,568,720 | C→T | 100% | A33T (GCC→ACC) | eutP ← | putative P‑loop NTPase ethanolamine utilization protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,568,720 | 0 | C | T | 100.0% | 671.5 / NA | 201 | A33T (GCC→ACC) | eutP | putative P‑loop NTPase ethanolamine utilization protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (97/104); total (97/104) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
CAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAAT > CP009273/2568574‑2568865 | caACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCAACGGTCt > 2:3181821/1‑149 (MQ=255) aCCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGTGATGGTTAAAATATTCACCCGGCTTATCAATATCGCCCTTATAATTAAATTACACGGTCttt > 2:3705005/1‑147 (MQ=255) aCCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCtgt > 2:377879/1‑149 (MQ=255) aCCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCtgt < 2:3273138/149‑1 (MQ=255) gACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGtt > 2:1668016/1‑149 (MQ=255) gACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGtt > 1:2516421/1‑149 (MQ=255) aCTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGttt > 2:3093063/1‑149 (MQ=255) tttCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGttttt < 1:759585/149‑1 (MQ=255) tCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCt < 2:1605707/149‑1 (MQ=255) ggTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCg > 2:1237672/1‑149 (MQ=255) ggTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCg > 2:3377351/1‑149 (MQ=255) aTTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAggg < 1:2579641/149‑1 (MQ=255) ttGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGta < 1:1185538/149‑1 (MQ=255) ttGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGta < 1:1504047/149‑1 (MQ=255) aTGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTcc > 1:2731811/1‑149 (MQ=255) ggACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTcccc > 2:3496790/1‑149 (MQ=255) ggACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTcccc < 2:1909037/149‑1 (MQ=255) gACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCt < 1:3676996/149‑1 (MQ=255) aCATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTg > 2:101278/1‑149 (MQ=255) cATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGc < 2:142417/149‑1 (MQ=255) tCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCa > 2:3865134/1‑149 (MQ=255) cAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCAt < 1:3886923/149‑1 (MQ=255) gCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTa > 2:1776601/1‑149 (MQ=255) tGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAAt > 2:1442827/1‑149 (MQ=255) gTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATa > 1:581845/1‑149 (MQ=255) tACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACg > 2:264903/1‑149 (MQ=255) tACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACg > 2:2110412/1‑149 (MQ=255) cATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgtt < 2:1931094/149‑1 (MQ=255) aTCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCACTGCAACGCATTAAATAACgttg > 2:2061721/1‑149 (MQ=255) tCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttgt > 2:35440/1‑149 (MQ=255) ccTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttgtt > 2:3322040/1‑149 (MQ=255) ccTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttgtt < 1:130090/149‑1 (MQ=255) tGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGtttt > 1:1839049/1‑149 (MQ=255) tGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGtttt > 2:2870788/1‑149 (MQ=255) gTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGttttt > 1:3508091/1‑149 (MQ=255) gTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGttttt > 2:1530281/1‑149 (MQ=255) gTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGttttt < 1:3244647/149‑1 (MQ=255) gTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGttttt < 1:3244623/149‑1 (MQ=255) tAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTc < 2:1765347/149‑1 (MQ=255) gCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCt > 2:3630482/1‑149 (MQ=255) gCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCt > 1:3236436/1‑149 (MQ=255) gCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCt < 2:1515645/149‑1 (MQ=255) tGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGcc > 2:850170/1‑149 (MQ=255) aaTTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGa > 1:1891412/1‑149 (MQ=255) aTTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGAc < 1:95910/149‑1 (MQ=255) ttAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACg > 1:1368833/1‑149 (MQ=255) tAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGc < 2:397389/149‑1 (MQ=255) gTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCca < 1:854199/149‑1 (MQ=255) cGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAAt < 2:247364/149‑1 (MQ=255) gggATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTc < 2:689166/149‑1 (MQ=255) gATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGt > 2:1796684/1‑149 (MQ=255) tGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGttt > 2:2594159/1‑149 (MQ=255) ttAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCAt > 1:670407/1‑149 (MQ=255) ttAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCAt < 1:4023085/149‑1 (MQ=255) ttAAAATATTCACCCGGCGTATCAATAGCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAACTAACGTGGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAACCGCAATTCGTTTctt < 2:1546330/149‑3 (MQ=255) tAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATg < 1:2473463/149‑1 (MQ=255) aaaTATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGaa < 2:4013800/149‑1 (MQ=255) aaaTATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGaa < 1:3811848/149‑1 (MQ=255) aaTATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAAt < 1:377879/149‑1 (MQ=255) aaTATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAAt > 2:1286043/1‑149 (MQ=255) ttCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCt < 1:1802204/149‑1 (MQ=255) cccGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCCCGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTa < 2:3293838/149‑1 (MQ=255) cccGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTa < 2:3293118/149‑1 (MQ=255) cGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTAtt < 1:3005012/149‑1 (MQ=255) ggCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATTAATGCCTCGTATTa > 2:2402597/1‑149 (MQ=255) cGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAAGTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAAc < 2:2721598/149‑1 (MQ=255) gTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACt < 1:4016025/149‑1 (MQ=255) gTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACt < 1:1153790/149‑1 (MQ=255) gTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACt < 1:4015970/149‑1 (MQ=255) tATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACtt > 2:706863/1‑149 (MQ=255) cAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTg < 1:1640300/149‑1 (MQ=255) cAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTg > 2:2189416/1‑149 (MQ=255) cAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTg > 2:3350135/1‑149 (MQ=255) tatCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTc > 2:3956045/1‑149 (MQ=255) atCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCa > 2:777542/1‑149 (MQ=255) tCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGtgtt < 2:2972365/149‑4 (MQ=255) tCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCAt > 2:3156516/1‑149 (MQ=255) tCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCAt < 1:2408130/149‑1 (MQ=255) tCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCAt < 1:3258345/149‑1 (MQ=255) cccTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTc > 1:544727/1‑149 (MQ=255) cccTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTc > 1:544682/1‑149 (MQ=255) ccTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTca < 1:3859719/149‑1 (MQ=255) cTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTcac < 1:876884/149‑1 (MQ=255) cTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTcac < 1:2704197/149‑1 (MQ=255) cTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTcac < 2:2856642/149‑1 (MQ=255) tATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACaa > 2:3180844/1‑149 (MQ=255) aTCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACaaa > 2:2537838/1‑149 (MQ=255) cATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGc > 1:297276/1‑149 (MQ=255) aTTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCg > 2:1967542/1‑149 (MQ=255) tAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGta < 2:4070472/149‑1 (MQ=255) tAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGta < 2:581845/149‑1 (MQ=255) aaaTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGtat > 1:2267092/1‑149 (MQ=255) aaaTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGtat > 2:712193/1‑149 (MQ=255) aaaTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTAGGTAAAATCACAAAGCGtat > 2:3031025/1‑149 (MQ=255) aaTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGtata > 2:2328749/1‑149 (MQ=255) aaTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGtata < 1:1995755/149‑1 (MQ=255) aTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATaa > 1:1230342/1‑149 (MQ=255) tCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAAtt < 1:2631578/149‑1 (MQ=255) ccACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAAttt > 2:506088/1‑149 (MQ=255) cGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACTCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTTGTCATTTCACAAAGCGTATAATTtaat < 1:3530903/149‑1 (MQ=255) | CAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAAT > CP009273/2568574‑2568865 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |