| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 238,195 | G→T | 100% | V532V (GTC→GTA) | fadE ← | acyl coenzyme A dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 238,195 | 0 | G | T | 100.0% | 747.2 / NA | 223 | V532V (GTC→GTA) | fadE | acyl coenzyme A dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (123/100); total (123/100) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
GGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAGCACGCG > CP009273/238050‑238340 | ggTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACg > 1:1729303/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGt > 2:3418270/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGt > 1:2487392/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGt > 1:3589198/1‑149 (MQ=255) ttCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTc > 1:2199182/1‑149 (MQ=255) tCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCa > 2:3480684/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCAt > 1:4061575/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCAt < 1:2739639/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCAt < 2:2079789/149‑1 (MQ=255) aGGTGCTGATAGTAGCGATTAGTGTCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCTGGCCCATCCAGAAGCTGCGATCTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCAtt < 2:324996/149‑1 (MQ=255) gCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGttc < 1:3289748/149‑1 (MQ=255) tGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAGCCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGttctt < 2:3886924/149‑1 (MQ=255) gATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGttcttc < 1:692101/149‑1 (MQ=255) gagtagCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTcgc < 1:1753067/148‑1 (MQ=255) agtagCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTcgcc > 1:213377/1‑149 (MQ=255) tagCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTcgccgc > 1:2556652/1‑149 (MQ=255) tagCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTcgccgc > 1:3863443/1‑149 (MQ=255) agCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCt > 1:30860/1‑149 (MQ=255) cGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTNTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTc < 1:2082788/149‑1 (MQ=255) cGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTc < 1:1712464/149‑1 (MQ=255) gTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTcc < 1:3221199/149‑1 (MQ=255) tttAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCa < 2:1147442/149‑1 (MQ=255) tttAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGAGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACATTGTTGCTACAGACGTGACCGATATTTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCa < 1:3289872/149‑1 (MQ=255) ttAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCAt > 1:296058/1‑149 (MQ=255) tAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCAtc > 1:2633076/1‑149 (MQ=255) gTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCAtctc > 1:2929772/1‑149 (MQ=255) ggCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCtt > 1:3938139/1‑149 (MQ=255) ggCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCtt > 2:2537823/1‑149 (MQ=255) gCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGGTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTc > 2:1512044/1‑149 (MQ=255) cATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTcc < 2:1574232/149‑1 (MQ=255) cATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTcc < 1:99092/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCa > 1:1919107/1‑149 (MQ=255) tCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAg > 1:1545211/1‑149 (MQ=255) gCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCa > 1:596367/1‑149 (MQ=255) ggTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGt < 2:3076456/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTa > 1:1380532/1‑149 (MQ=255) ggCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACgg < 2:1964825/149‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGa < 2:3883397/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATg > 1:1518599/1‑149 (MQ=255) gctgctGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGc < 1:3264220/149‑1 (MQ=255) tgctgGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCaa > 2:1100021/1‑149 (MQ=255) gctgGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAAc > 1:2307911/1‑149 (MQ=255) aaCCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCt > 2:2771509/1‑149 (MQ=255) aaCCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCt > 2:1996804/1‑149 (MQ=255) ccGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTcc < 1:2842301/149‑1 (MQ=255) cgcgcgTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCt < 1:2187217/149‑1 (MQ=255) gTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTcc > 2:1838871/1‑149 (MQ=255) tCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAAATTTGTTGCTACCGAAGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGACTCGCTCCTTGTCCg > 2:776122/1‑149 (MQ=255) aGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGaa > 1:437642/1‑149 (MQ=255) ggCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAg > 1:2391906/1‑149 (MQ=255) cagccagAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGACGatca > 2:2714840/1‑149 (MQ=255) gccagAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGatcatc < 2:2536641/149‑1 (MQ=255) gccagAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGatcatc < 1:3653033/149‑1 (MQ=255) gccagAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGatcatc > 2:405945/1‑149 (MQ=255) gccagAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGatcatc < 2:525027/149‑1 (MQ=255) cagAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATcatcat < 2:2586884/149‑1 (MQ=255) cagAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATcatcat > 1:1627945/1‑149 (MQ=255) gAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCAtgc > 2:458959/1‑149 (MQ=255) gAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCAtgc < 2:3003743/149‑1 (MQ=255) gAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCAtgc < 1:2116494/149‑1 (MQ=255) aGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCAtgctg > 2:2925532/1‑149 (MQ=255) tttGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGATGCGGGTCAGaa > 1:3837023/1‑149 (MQ=255) tttGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCCTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGaa < 1:1162250/149‑1 (MQ=255) ttgttgCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAAt < 2:577633/149‑1 (MQ=255) gCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAg < 1:157466/149‑1 (MQ=255) ccGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCGGAATGTTAGcccc > 1:1247778/1‑149 (MQ=255) ccGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGcccc > 1:1247068/1‑149 (MQ=255) aCGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTc < 2:231346/149‑1 (MQ=255) gTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCaa > 2:3224040/1‑149 (MQ=255) tGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAAc > 1:2359944/1‑149 (MQ=255) tGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAAc > 1:768057/1‑149 (MQ=255) gACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACg > 2:2122554/1‑149 (MQ=255) aCCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACgg > 1:968014/1‑149 (MQ=255) ccGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGt > 1:507473/1‑149 (MQ=255) cGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTg > 1:1196818/1‑149 (MQ=255) atatGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGAt < 2:1738301/149‑1 (MQ=255) tatGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATg > 2:1532314/1‑149 (MQ=255) tatGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATg > 2:721785/1‑149 (MQ=255) tatGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATg > 2:3805550/1‑149 (MQ=255) tGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGc > 2:2443286/1‑149 (MQ=255) tttGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCaa > 2:502170/1‑149 (MQ=255) ttGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAAt < 1:2326030/149‑1 (MQ=255) tGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATc < 1:3376323/149‑1 (MQ=255) aacaacAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCgg > 2:1226294/1‑149 (MQ=255) caacaGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTg < 2:373182/149‑1 (MQ=255) aacaGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTgc < 1:1368797/149‑1 (MQ=255) acaGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACTAATCGCTCCGTGTCCGAAGATCATCATGCTGCCGGTCAGAATTTTAGCCCCTTCAACGGTGATGTCAATCGGTgcg > 1:1075510/1‑149 (MQ=255) gTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGccc > 2:862643/1‑149 (MQ=255) tttATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCt < 2:596367/149‑1 (MQ=255) tttATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCt < 2:2781208/149‑1 (MQ=255) tCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTa > 2:3620307/1‑149 (MQ=255) tCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTa > 2:539621/1‑149 (MQ=255) cGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTaa > 2:688348/1‑149 (MQ=255) gAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAg > 1:2477818/1‑149 (MQ=255) gAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAg > 1:359193/1‑149 (MQ=255) aaCGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAGc > 1:2440674/1‑149 (MQ=255) aaCGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAAACGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAGc > 1:2441418/1‑149 (MQ=255) aaCGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGACGCTTAAATCTCTTACAGCAAGTACGGATGGAAACGAATCGCTCCTTGTACGAAGATCATAATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCACTTCAACGGTGATGGCAATCGGTTCGCCCTGGTAAGc > 1:3495056/1‑149 (MQ=255) aCGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAGCa > 2:3724534/1‑149 (MQ=255) aCGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAGCa > 1:3406703/1‑149 (MQ=255) | GGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAGCACGCG > CP009273/238050‑238340 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |