| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,736,714 | C→A | 100% | R325S (CGC→AGC) | yfiN → | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase with an N‑terminal periplasmic domain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,736,714 | 0 | C | A | 97.3% | 709.8 / 8.8 | 226 | R325S (CGC→AGC) | yfiN | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase with an N‑terminal periplasmic domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/2); new base A (123/97); total (127/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
CCCGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCAT > CP009273/2736568‑2736859 | cGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCt < 1:782679/149‑1 (MQ=255) aaaaaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTgg > 2:1011039/1‑149 (MQ=255) aaaaaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTgg > 2:1615488/1‑149 (MQ=255) aaaaaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTgg < 1:2394905/149‑1 (MQ=255) aaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGggcg < 1:3944375/149‑1 (MQ=255) aaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATAGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACATCCAGggcg > 2:3421671/1‑149 (MQ=255) aCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGggcgg < 1:140857/149‑1 (MQ=255) aCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTAAAATACAACAATGATAACTGGGGTCATGCGACGGGCGATATAGTCTTGATTGAAAAAGCAAAACGGTTAGCGGAAATTGGCGGGCTGCGACAAAAAGCAAACAGCCAGggcgg > 1:1898768/1‑149 (MQ=255) tACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTc > 2:799045/1‑149 (MQ=255) cTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGc > 1:2335415/1‑149 (MQ=255) tATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCt < 2:1883918/149‑1 (MQ=255) tATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCt > 2:1739950/1‑149 (MQ=255) tCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATgg < 2:698938/149‑1 (MQ=255) tCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATgg > 1:662407/1‑149 (MQ=255) cTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGt < 2:1053353/149‑1 (MQ=255) tGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGc < 2:2170558/149‑1 (MQ=255) ggCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCGAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTa > 2:602355/1‑149 (MQ=255) ggCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTa < 1:1714776/149‑1 (MQ=255) ggCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTa < 1:2138271/149‑1 (MQ=255) gATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTatga > 2:2148421/1‑149 (MQ=255) aTAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTatgat > 2:295946/1‑149 (MQ=255) aTAAGTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTatgat > 1:244339/1‑149 (MQ=255) aaTTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGt > 2:3973843/1‑149 (MQ=255) tttCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAATCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTAc > 1:475347/1‑149 (MQ=255) tttCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTAc < 2:1349950/149‑1 (MQ=255) tttCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTAc > 2:1016068/1‑149 (MQ=255) tCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAg > 1:1137071/1‑149 (MQ=255) cAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGt < 2:3097579/149‑1 (MQ=255) aaaTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTc < 1:2861043/149‑1 (MQ=255) aaTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCg > 1:220911/1‑149 (MQ=255) aaTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCg > 2:2691506/1‑149 (MQ=255) aaTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCg > 2:1455119/1‑149 (MQ=255) aTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCgg > 1:1541568/1‑149 (MQ=255) aTACACCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCgg < 1:3745186/149‑1 (MQ=255) cATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAAt > 2:949636/1‑149 (MQ=255) cATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAAt < 1:42061/149‑1 (MQ=255) cATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAAt < 2:2429176/149‑1 (MQ=255) aaTGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGa < 1:1914566/149‑1 (MQ=255) aTGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGaa > 2:2102029/1‑149 (MQ=255) aTGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGaa > 2:3158695/1‑149 (MQ=255) tGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAg > 2:3264937/1‑149 (MQ=255) gATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGt > 2:1733121/1‑149 (MQ=255) aTACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTg > 1:1783964/1‑149 (MQ=255) tACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgc > 1:2670850/1‑149 (MQ=255) tACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgc > 1:2173645/1‑149 (MQ=255) tACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgc > 2:2833574/1‑149 (MQ=255) cTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgcagc < 2:458286/149‑1 (MQ=255) tGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgcagca > 1:1139832/1‑149 (MQ=255) gTCATGCGACGGGCGATAGTGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGata > 1:3357990/1‑149 (MQ=255) tCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGatat > 2:2151300/1‑149 (MQ=255) aTGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGt < 2:1145673/149‑1 (MQ=255) aTGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGt < 2:1145434/149‑1 (MQ=255) gCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTc > 1:3592543/1‑149 (MQ=255) gCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTc > 1:3591195/1‑149 (MQ=255) cGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCa > 1:726823/1‑149 (MQ=255) gACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAg > 2:4040945/1‑149 (MQ=255) cGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCa < 2:2605775/149‑1 (MQ=255) cGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGa > 2:1550510/1‑149 (MQ=255) cGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGa < 1:2069952/149‑1 (MQ=255) cGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGa < 1:3661657/149‑1 (MQ=255) gATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGac > 2:4098381/1‑149 (MQ=255) aTAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGaca > 1:2510983/1‑149 (MQ=255) tAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGacac > 1:2386797/1‑149 (MQ=255) agTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACaaa < 2:1292954/149‑1 (MQ=255) gTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAAt < 1:1491963/149‑1 (MQ=255) tCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATc > 2:1744277/1‑149 (MQ=255) tCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATc > 2:3163839/1‑149 (MQ=255) tCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATc > 2:3579446/1‑149 (MQ=255) tCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATc < 1:3917020/149‑1 (MQ=255) attgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTaa > 2:637691/1‑149 (MQ=255) aaTCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTcc > 1:594472/1‑149 (MQ=255) tCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCg > 2:3705466/1‑149 (MQ=255) cGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGt < 2:2335415/149‑1 (MQ=255) cAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGttt < 1:1628640/149‑1 (MQ=255) aaaaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTg > 1:3605137/1‑149 (MQ=255) aaaaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTg > 2:1592281/1‑149 (MQ=255) aaaaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTg > 1:854444/1‑149 (MQ=255) aCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATc < 2:863416/149‑1 (MQ=255) aCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATc < 1:3040716/149‑1 (MQ=255) ggTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCtt < 1:3548438/149‑1 (MQ=255) ttAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCa < 1:1011039/149‑1 (MQ=255) ttAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCa < 1:2423969/149‑1 (MQ=255) tAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCAt > 1:563502/1‑149 (MQ=255) tGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAGTg > 2:240202/1‑149 (MQ=255) tGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATg < 1:2183645/149‑1 (MQ=255) tGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATg < 1:2092927/149‑1 (MQ=255) aaTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGc < 1:1744277/149‑1 (MQ=255) aaTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGc > 1:3008130/1‑149 (MQ=255) aaTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGc < 1:1112760/149‑1 (MQ=255) atgtGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGcc < 2:2162598/146‑1 (MQ=255) aTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGcc < 2:3462200/149‑1 (MQ=255) aTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGcc < 2:2024717/149‑1 (MQ=255) ggCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCa > 2:1716611/1‑149 (MQ=255) cGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGa < 1:367153/149‑1 (MQ=255) aCATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGa < 1:2102029/149‑1 (MQ=255) gCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAg > 2:1986771/1‑149 (MQ=255) gCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAg > 1:3435402/1‑149 (MQ=255) gCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAg > 1:4016138/1‑149 (MQ=255) cATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGc > 2:3784488/1‑149 (MQ=255) tACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCAt > 2:1054887/1‑149 (MQ=255) | CCCGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCAT > CP009273/2736568‑2736859 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |