| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,985,472 | T→A | 14.7% | F7Y (TTC→TAC) | ygeH → | putative transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,985,472 | 0 | T | A | 14.7% | 640.0 / 89.9 | 231 | F7Y (TTC→TAC) | ygeH | putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (109/88); new base A (24/10); total (133/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
AGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGAAAGATATGATC > CP009273/2985325‑2985620 | aGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATtc < 2:627420/149‑1 (MQ=255)aGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATtc < 1:4081268/149‑1 (MQ=255)aGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATtc < 2:4057900/149‑1 (MQ=255)aGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATtc < 1:1375793/149‑1 (MQ=255) tGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATtctc < 1:3516600/149‑1 (MQ=255) aaCACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCat > 2:303340/1‑149 (MQ=255) cacaACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCatat < 1:3752543/149‑1 (MQ=255) caACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCa < 1:2955441/149‑1 (MQ=255) caACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCa < 1:611814/149‑1 (MQ=255) aTAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTc < 1:1972496/149‑1 (MQ=255) aGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCtt < 1:701199/149‑1 (MQ=255) aGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCtt < 1:2501445/149‑1 (MQ=255) gATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTg < 1:1785541/149‑1 (MQ=255) tatGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAg < 1:1339614/149‑1 (MQ=255) atGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAgg < 1:102069/149‑1 (MQ=255) tCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGAt < 1:2400073/149‑1 (MQ=255) cAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATACTCATATCATTTTCTTGAGGGAtt > 1:4048559/1‑149 (MQ=255) cAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATACTCATATCATTTTCTTGAGGGAtt > 1:1538533/1‑149 (MQ=255) tGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACg > 2:719923/1‑149 (MQ=255) tGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACg > 2:32376/1‑149 (MQ=255) gTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGc < 2:2042510/149‑1 (MQ=255) ttCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACg > 2:3684364/1‑149 (MQ=255) ccTGTAGCTTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGa < 1:1228606/149‑1 (MQ=255) cTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGaa < 1:1595468/149‑1 (MQ=255) tGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAg < 2:3231842/149‑1 (MQ=255) tGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAg > 1:2189339/1‑149 (MQ=255) aGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATg < 2:1074491/149‑1 (MQ=255) gCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATgg < 1:1668259/149‑1 (MQ=255) gCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATgg < 1:3393178/149‑1 (MQ=255) gTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGaa < 2:3256891/149‑1 (MQ=255) aTGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCt < 1:3829499/149‑1 (MQ=255) tGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCtt < 2:1141653/149‑1 (MQ=255) acaTAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATACTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTc > 1:3515742/1‑149 (MQ=255) caTAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCa < 2:2244289/149‑1 (MQ=255) caTAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCa > 2:2965383/1‑149 (MQ=255) aTAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCaa > 2:1940149/1‑149 (MQ=255) aTAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCaa > 1:4088568/1‑149 (MQ=255) tAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAg < 2:543383/149‑1 (MQ=255) aaaTATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAgg > 2:849272/1‑149 (MQ=255) aaTATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATACTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGa < 1:751004/149‑1 (MQ=255) tatGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGaaa > 1:3153865/1‑149 (MQ=255) aaTAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTATTACTCAAGGAAATGAg > 2:3177817/1‑149 (MQ=255) aGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCaa < 1:3972934/149‑1 (MQ=255) aGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAAACAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCaa < 1:531840/149‑1 (MQ=255) gtcATAATTTGTTTTGGATATGCAGGCAGCTAGAAACGAATTTTTACAAAGAGGATAACAAATGGACTTAGATAATAATTACTCATATCATATTCAAGAGGGATAAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAg < 2:2219861/147‑1 (MQ=255) gCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAg > 1:2311463/1‑149 (MQ=255) cATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGtt > 1:1434150/1‑149 (MQ=255) cATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGtt < 2:3629138/149‑1 (MQ=255) aTAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGttt > 2:1698235/1‑149 (MQ=255) tAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTta > 1:546450/1‑149 (MQ=255) tttCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATACTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTatat > 1:3133304/1‑149 (MQ=255) tCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTc < 1:242997/149‑1 (MQ=255) aGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAagag > 1:1152724/1‑149 (MQ=255) aGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTAATCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTa > 2:2119912/1‑149 (MQ=255) aTGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATACTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAggg > 2:2699406/1‑148 (MQ=255) tGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGgtg < 1:2821568/149‑1 (MQ=255) gCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGgtgt > 1:1657304/1‑149 (MQ=255) gCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATACTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGgtgt > 1:1918490/1‑149 (MQ=255) cAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTa < 2:3878085/149‑1 (MQ=255) cAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATACTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTa > 1:2859618/1‑149 (MQ=255) gAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTa > 2:134711/1‑149 (MQ=255) aaaCCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTaa > 2:2907948/1‑149 (MQ=255) aaaCCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTaa < 2:1246386/149‑1 (MQ=255) aaaCCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTaa < 2:791339/149‑1 (MQ=255) aaCCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAAt > 1:1753774/1‑149 (MQ=255) aCCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATa > 2:309459/1‑149 (MQ=255) ccAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAg > 1:3268308/1‑149 (MQ=255) cAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGt > 1:271928/1‑149 (MQ=255) aaTTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTa > 2:34119/1‑149 (MQ=255) ttttttCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTAtt > 1:1292870/1‑149 (MQ=255) ttttCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTAc < 2:1307181/149‑1 (MQ=255) ttttCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTAc > 1:958342/1‑149 (MQ=255) tttCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATACTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACt < 2:519645/149‑1 (MQ=255) aTAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGaa < 1:1843964/149‑1 (MQ=255) aTAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGaa > 1:2475230/1‑149 (MQ=255) aTAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGaa > 1:2692600/1‑149 (MQ=255) tAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATACTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAAt < 1:3341738/149‑1 (MQ=255) agagGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATAATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATc < 2:1658991/149‑1 (MQ=255) agGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCg > 2:3967101/1‑149 (MQ=255) agGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCg > 1:2736285/1‑149 (MQ=255) ggTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGc < 1:3860976/149‑1 (MQ=255) gTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCt > 2:2885642/1‑149 (MQ=255) gTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCt > 1:1126052/1‑149 (MQ=255) ttAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTg > 2:2636209/1‑149 (MQ=255) ttAACTAATGGACTTAGAAAATAAATACTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTg > 2:2405972/1‑149 (MQ=255) aaTGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCAtg < 2:4088568/149‑1 (MQ=255) tGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCAtgtt > 2:1065927/1‑149 (MQ=255) tGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCAtgtt > 1:874332/1‑149 (MQ=255) ggACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCAtgttg > 2:1426059/1‑149 (MQ=255) aCTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTa < 1:3619229/149‑1 (MQ=255) aCTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTa < 1:2053182/149‑1 (MQ=255) cTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTAc > 1:19318/1‑149 (MQ=255) cTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTAc > 1:3631636/1‑149 (MQ=255) aGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGa > 2:4074120/1‑149 (MQ=255) aaaaTAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGaaa < 2:2492012/149‑1 (MQ=255) aaataaatACTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGAAAg > 2:3391086/1‑149 (MQ=255) taaatTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGAAAGata > 2:3524/1‑149 (MQ=255) taaatTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGAAAGata > 1:1003063/1‑149 (MQ=255) aaatACTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGAAAGatat < 1:927818/149‑1 (MQ=255) aatTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATGTTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGAAAGATATg < 1:1070081/149‑1 (MQ=255) | AGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGAAAGATATGATC > CP009273/2985325‑2985620 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |