| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,993,699 | C→A | 100% | intergenic (‑449/‑5) | ygeR ← / → xdhA | LysM domain‑containing M23 family putative peptidase; septation lipoprotein/xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,993,699 | 0 | C | A | 100.0% | 814.7 / NA | 246 | intergenic (‑449/‑5) | ygeR/xdhA | LysM domain‑containing M23 family putative peptidase; septation lipoprotein/xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (121/125); total (121/125) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
TCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCC > CP009273/2993553‑2993844 | tcatcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGaataat < 1:3188789/149‑1 (MQ=255) catcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTGTGTGGGGTAAAACTTGGCTGCTTAGACTAAATCTTTTCCATAAGAAACAAATTTTAAAATAGTGGGGATTTGTATGGAAGCGCGGGCAGCAACCGCTCAGGGTGAATtatg > 1:18290/1‑149 (MQ=255) acacTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgcatg < 2:725423/149‑1 (MQ=255) cTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATgcgc < 2:2691028/149‑1 (MQ=255) cTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGGAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCCTAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATgcgc > 2:1595318/1‑149 (MQ=255) ccTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCCAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAAACGCTACGGGTGAATAATGCCTGCGCGTc > 2:3494032/1‑149 (MQ=255) tACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGa < 1:3798669/149‑1 (MQ=255) aCCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGAt < 2:2581501/149‑1 (MQ=255) aCCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGAt < 2:2431410/149‑1 (MQ=255) aCCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGAt < 2:2086677/149‑1 (MQ=255) tCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGcc < 2:1482134/149‑1 (MQ=255) tCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATATTTCCTGCTTAGTCTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGTAGCGCGGGACGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGGCGATGcc > 1:2548194/1‑149 (MQ=255) ccccTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCa < 1:1363798/149‑1 (MQ=255) cccTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCAt < 1:2161643/149‑1 (MQ=255) ccTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCAtt < 1:2309550/149‑1 (MQ=255) ccTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCAtt < 1:2310774/149‑1 (MQ=255) cGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTaa < 2:3356028/149‑1 (MQ=255) cTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCGTAGACTAAATATTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCGAAgg > 2:2683827/1‑149 (MQ=255) tATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAATAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTAAGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCAAAGGTc > 2:3698275/1‑149 (MQ=255) tcgtcgTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCAc < 1:2449212/149‑1 (MQ=255) tcgtcgTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCAc < 1:62960/149‑1 (MQ=255) tcgtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgg > 1:1182284/1‑149 (MQ=255) tcgtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgg > 1:3233636/1‑149 (MQ=255) tttCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTCAGGTCACcgggcg > 2:1142389/1‑149 (MQ=255) tttCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggcg < 1:2176621/149‑1 (MQ=255) tttCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggcg > 2:1806798/1‑149 (MQ=255) cTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCgggcgggc < 2:378529/149‑1 (MQ=255) tGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCa > 2:493047/1‑149 (MQ=255) gCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACg < 2:987120/149‑1 (MQ=255) gTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGat > 2:1079574/1‑149 (MQ=255) gTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGat > 2:1268612/1‑149 (MQ=255) tAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGTGGGCACGata < 1:1546801/149‑1 (MQ=255) tAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGata > 2:870880/1‑149 (MQ=255) tAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGata > 2:2874162/1‑149 (MQ=255) aTCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATAc > 2:589591/1‑149 (MQ=255) cTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAt < 2:3917725/149‑1 (MQ=255) cTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAt < 2:1716841/149‑1 (MQ=255) cTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAt > 1:3605310/1‑149 (MQ=255) tGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtt < 1:46541/149‑1 (MQ=255) cTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttat < 1:4007644/149‑1 (MQ=255) cTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttat < 2:1363891/149‑1 (MQ=255) ttAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatg > 2:2481090/1‑149 (MQ=255) aGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgtt < 1:626097/149‑1 (MQ=255) aGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgtt < 2:3256791/149‑1 (MQ=255) cTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgttatg > 2:2839861/1‑149 (MQ=255) cTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgttatg > 2:932583/1‑149 (MQ=255) aaaTCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGc > 1:105992/1‑149 (MQ=255) tCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCggg > 1:89536/1‑149 (MQ=255) cTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGc < 2:2437911/149‑1 (MQ=255) tGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAtg < 1:3926387/149‑1 (MQ=255) gCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAtgt < 2:657882/149‑1 (MQ=255) ccATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCCtgtg > 2:3067231/1‑149 (MQ=255) cATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATgtgt < 2:1195273/149‑1 (MQ=255) cATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATgtgt > 1:914764/1‑149 (MQ=255) aTAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGtt > 1:1935680/1‑149 (MQ=255) tAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTa > 1:3474806/1‑149 (MQ=255) tAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTa < 1:3128582/149‑1 (MQ=255) tAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTa > 1:2740170/1‑149 (MQ=255) tAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTa < 1:55112/149‑1 (MQ=255) aaGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTAt > 1:1982812/1‑149 (MQ=255) aaGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTAt > 2:2023507/1‑149 (MQ=255) aCCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGa < 1:1608396/149‑1 (MQ=255) ccAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaa > 2:3401219/1‑149 (MQ=255) ccAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaa < 2:2648340/149‑1 (MQ=255) cAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaaa > 2:3709883/1‑149 (MQ=255) tGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATg > 2:2469388/1‑149 (MQ=255) aaaTCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGt > 1:946620/1‑149 (MQ=255) aaaTCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGt < 1:158754/149‑1 (MQ=255) aTCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAg > 2:3365441/1‑149 (MQ=255) aTCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAg > 2:1312861/1‑149 (MQ=255) aGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCt < 2:1888119/149‑1 (MQ=255) gATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCg < 2:275909/149‑1 (MQ=255) gATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCg > 2:3952130/1‑149 (MQ=255) gATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCg > 1:3708584/1‑149 (MQ=255) cTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACAt < 2:1277943/149‑1 (MQ=255) tATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATg > 2:3146516/1‑149 (MQ=255) ggAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGtt < 1:2908059/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGc > 2:1537559/1‑149 (MQ=255) ggAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa > 2:3936959/1‑149 (MQ=255) ggAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa < 2:1982534/149‑1 (MQ=255) ggAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa < 2:1433007/149‑1 (MQ=255) ggAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa > 1:704909/1‑149 (MQ=255) gAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAg > 1:1217130/1‑149 (MQ=255) aaGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGt < 1:1117470/149‑1 (MQ=255) aGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTa < 2:1029822/149‑1 (MQ=255) aGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTa < 2:2183255/149‑1 (MQ=255) gCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTAt > 2:249892/1‑149 (MQ=255) aaCCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGAACGATATACTGACGATTATGTTATGGAGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATTCCGTAAGTATTa > 1:1709959/1‑149 (MQ=255) aCCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTaa < 2:2987955/149‑1 (MQ=255) ccGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAat < 1:2409599/149‑1 (MQ=255) ccGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAat < 1:2242671/149‑1 (MQ=255) gCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatga < 1:590482/149‑1 (MQ=255) gCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatga < 1:2655628/149‑1 (MQ=255) cTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatgat > 2:3932207/1‑149 (MQ=255) tACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatgatg < 1:2797986/149‑1 (MQ=255) cGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGaa < 1:2504625/149‑1 (MQ=255) cGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGaa < 1:2503560/149‑1 (MQ=255) ggTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACa < 2:1329243/149‑1 (MQ=255) gAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGc > 2:2408537/1‑149 (MQ=255) aataatGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGcc < 1:2980434/149‑1 (MQ=255) | TCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCC > CP009273/2993553‑2993844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |